| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AC_000091 | = 3748324 | 18 (0.130) | 142 (1.060) | 99/178 | 0.1 | 88.8% | coding (657/984 nt) | tnaB | tryptophan transporter of low affinity |
| ? | AC_000091 | 4056220 = | NA (NA) | intergenic (‑564/+15) | yrhB/insB | hypothetical protein/IS1 transposase InsAB' | |||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AC_000091/3748236‑3748324‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACA > AC_000091/4056220‑4056308 TGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAG < 2:2059632/90‑1 GGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGG > 2:1698990/1‑90 GTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGT < 2:943285/90‑1 GTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGT > 2:2757050/1‑90 GTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGT < 1:3376015/90‑1 TGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTA < 1:2789821/90‑1 GCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAAACAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGTTAA > 2:1537171/1‑90 AATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATG > 1:1647384/1‑90 AATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTATGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATG > 2:2094643/1‑90 ATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGA < 2:2008779/90‑1 TAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGAC < 1:2243902/90‑1 TAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGCTTTCCAGGTAATGAC > 1:230631/1‑90 AGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACT > 1:1904223/1‑90 GAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTC > 1:690086/1‑90 GAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTC > 2:3018757/1‑90 AGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCC < 1:526221/90‑1 AGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCC > 1:909541/1‑90 AGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCC < 1:2193948/90‑1 AGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCC > 1:1457313/1‑90 CAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAAC < 2:3434363/90‑1 CAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAAC < 1:1340684/90‑1 GAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTT < 1:1775552/90‑1 AGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTAT > 2:3366905/1‑90 ATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 2:1152150/1‑90 TAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 1:1179870/90‑1 AAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 1:3311230/90‑1 AAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 2:3417538/1‑90 TCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 2:271708/90‑1 TCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT > 1:3005056/1‑90 CACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCACCTTATTGATAGTGTT < 2:253348/90‑1 CACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT < 2:1112008/90‑1 cCCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 2:1476268/89‑1 ACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT > 1:548860/1‑90 CAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 2:3480825/1‑90 AGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 1:445348/1‑90 GCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 2:2012517/90‑1 GCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:2015184/90‑1 GCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:606498/90‑1 CCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC > 2:1001823/1‑90 CCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC < 1:1978244/90‑1 AGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 1:3182486/90‑1 AGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 2:3480297/90‑1 AGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 2:1949274/90‑1 AGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG > 1:2234829/1‑90 CAGAGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 2:3226031/90‑1 AGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA < 1:2291675/90‑1 AGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGCGTTTTATTTTCAGATA < 2:842189/90‑1 CGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:1976146/90‑1 AACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC > 2:2812034/1‑90 ACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 2:1025977/1‑90 ACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 2:1929175/1‑90 ACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 2:1190418/1‑90 ACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 1:1800101/1‑90 ACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC > 1:2503567/1‑90 ACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:159704/90‑1 CCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC > 1:1994649/1‑90 CCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTCATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC < 2:31667/90‑1 CAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 2:2133724/1‑90 CAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 2:1351184/1‑90 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CGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG > 1:1563218/1‑90 CGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG > 1:1375148/1‑90 GCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGT < 1:2800691/90‑1 CTTTTGATTAACTTATCTTTGCGGTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTC > 2:1116800/1‑90 TTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA > 1:784219/1‑90 TTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT > 1:2825531/1‑90 TTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG < 1:104998/90‑1 TTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG < 2:602078/90‑1 TGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC > 2:2183800/1‑90 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |