New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AC_000091 | = 4056987 | NA (NA) | 125 (0.930) | 88/178 | 0.3 | 89.3% | coding (388/414 nt) | yrhA | hypothetical protein |
? | AC_000091 | = 4370795 | 15 (0.110) | coding (471/1116 nt) | dcuA | C4‑dicarboxylate antiporter |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
ACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAATCATCATTATTTC > AC_000091/4056900‑4057076 | aCAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCtt < 2:1000963/90‑1 (MQ=31) aCAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCtt > 2:2591735/1‑90 (MQ=31) cAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGGATCACCttt > 2:2499984/1‑90 (MQ=17) cAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCttt < 2:1798362/90‑1 (MQ=32) gaggGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAAt < 2:82042/90‑1 (MQ=37) gaggGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAAt < 1:1129154/90‑1 (MQ=37) aggGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATg < 1:2796527/90‑1 (MQ=38) gggACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGt < 2:20333/90‑1 (MQ=39) ggACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTc > 2:1889150/1‑90 (MQ=40) aGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCAACACGTTTAATGTCATaa > 2:2690173/1‑90 (MQ=255) aGCGGATAGAAACAGAAGCCCCTGGAGCACCTCAAAAACTCCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATaa < 1:842115/90‑1 (MQ=14) tGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTa > 2:2109029/1‑90 (MQ=255) tGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTa < 1:623569/90‑1 (MQ=255) tGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTa < 1:546039/90‑1 (MQ=255) aTAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTaaa > 2:3257395/1‑90 (MQ=255) aGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAata > 2:1909046/1‑90 (MQ=255) gAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAatat < 1:750125/90‑1 (MQ=255) aaaCAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATAtt < 2:1500032/90‑1 (MQ=255) aaaCAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACC‑TTAATGTCATAAGTAAATATTg < 2:1899163/90‑1 (MQ=255) aaCAGAAGCCACTGGAGCCCCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTg < 2:1833795/90‑1 (MQ=255) aaCAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTg > 2:1142816/1‑90 (MQ=255) cAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGaa < 2:631073/90‑1 (MQ=255) gAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAAt < 1:568548/90‑1 (MQ=255) gAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAAt < 1:3259440/90‑1 (MQ=255) aGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGc > 2:2598097/1‑90 (MQ=255) ccACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCta < 1:1665098/90‑1 (MQ=255) cACTGGTGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGCTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCtat < 1:3080998/90‑1 (MQ=255) cACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCtat < 1:3452758/90‑1 (MQ=255) cACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCtat < 2:312212/90‑1 (MQ=255) cACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCtat < 1:1555060/90‑1 (MQ=255) aCTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCtata < 2:2264864/90‑1 (MQ=255) aCTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTAATAAGTAAATATTGAAATGCtata < 1:2670213/90‑1 (MQ=255) tGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAAt < 1:1922258/90‑1 (MQ=255) ggAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATc < 1:3079580/90‑1 (MQ=255) gAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATcc > 2:504382/1‑90 (MQ=255) gAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATcc > 2:2643509/1‑90 (MQ=255) aGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATccc > 2:1077904/1‑90 (MQ=255) aGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATccc < 1:906772/90‑1 (MQ=255) gCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATcccc < 1:2291831/90‑1 (MQ=255) ccTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCCTAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGAt < 2:758583/90‑1 (MQ=255) tCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCa < 2:2394226/90‑1 (MQ=255) tCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCa < 2:32614/90‑1 (MQ=255) cAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCAc < 1:235582/90‑1 (MQ=255) cAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGAAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCAc > 1:845221/1‑90 (MQ=255) aaaaaCACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACt > 1:1691586/1‑90 (MQ=255) aaaaaCACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACt > 1:2314609/1‑90 (MQ=255) aaaaaCACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACt < 2:1734537/90‑1 (MQ=255) aaaaCACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTa < 2:1542572/90‑1 (MQ=255) aaaaCACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTa < 2:3401161/90‑1 (MQ=255) aaaaCACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTa < 2:2879848/90‑1 (MQ=255) aaaCACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTaa > 1:2423905/1‑90 (MQ=255) aaCACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAAc < 1:2033589/90‑1 (MQ=255) aaCACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAAc < 1:2171139/90‑1 (MQ=255) aaCACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAAc < 2:2263473/90‑1 (MQ=255) acacCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATACGTAAATATTGAAATGCTATAATCCACGATCACTATcc > 2:903537/1‑90 (MQ=37) acacCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAAcc > 2:3244754/1‑90 (MQ=255) acacCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAAcc < 1:361309/90‑1 (MQ=255) acCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGt > 1:1016935/1‑90 (MQ=255) acCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGt > 2:3300513/1‑90 (MQ=255) ccATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGtt > 1:2932691/1‑90 (MQ=255) tcatACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCtt < 2:817219/90‑1 (MQ=255) tcatACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCtt < 1:1752428/90‑1 (MQ=255) atACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGt > 1:1024286/1‑90 (MQ=255) acacTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAg > 2:3017286/1‑90 (MQ=255) acacTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAg < 2:2028730/90‑1 (MQ=255) acTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGAt > 2:1810483/1‑90 (MQ=255) aaaTCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAg < 2:1961320/90‑1 (MQ=255) aaaTCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAg > 2:3101625/1‑90 (MQ=255) aaaTCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAg > 1:646523/1‑90 (MQ=255) aaTCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAgg < 1:1437852/90‑1 (MQ=255) aaTCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAgg < 1:1263975/90‑1 (MQ=255) aTCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAggg > 1:139845/1‑90 (MQ=255) aTCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAggg < 2:1292944/90‑1 (MQ=255) cAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGtt < 1:2532200/90‑1 (MQ=255) cAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGtt > 1:2941559/1‑90 (MQ=255) aGTAAGTTGGCAGCATCCCCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATATTCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGttt < 2:2708009/90‑1 (MQ=255) aGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGttt < 2:2101032/90‑1 (MQ=255) gTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTa < 1:2888314/90‑1 (MQ=255) tAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTAt < 1:668726/90‑1 (MQ=255) tAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTAt < 2:2198246/90‑1 (MQ=255) tAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTAt < 1:3371181/90‑1 (MQ=255) aaGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCGGATCACTACCCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATg < 2:1940063/90‑1 (MQ=255) aaGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATg < 1:1195746/90‑1 (MQ=255) ttGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGaaa > 2:2386768/1‑90 (MQ=255) tGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAat > 2:2601007/1‑90 (MQ=255) tGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAat < 2:2552542/90‑1 (MQ=255) gcagcaTCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAatca < 1:1799868/90‑1 (MQ=255) 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ccTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAATCATCATTAttt < 1:1911057/90‑1 (MQ=255) cTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAATCATCATTATTTc > 2:3280930/1‑90 (MQ=255) cTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAATCATCATTATTTc > 1:2123159/1‑90 (MQ=255) cTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAATCATCATTATTTc < 1:3145765/90‑1 (MQ=255) cTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAATCATCATTATTTc > 2:2761857/1‑90 (MQ=255) | ACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTTTAATGTCATAAGTAAATATTGAAATGCTATAATCCCCGATCACTAACCGTTCTTGTAGATCAGGGTTTATGAAATCATCATTATTTC > AC_000091/4056900‑4057076 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |