| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NZ_CP009273 | 1,613,500 | Δ4 bp | coding (124‑127/435 nt) | marR → | multiple antibiotic resistance transcriptional regulator MarR |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NZ_CP009273 | 1613500 | 1613503 | 4 | 51 [0] | [0] 53 | marR | multiple antibiotic resistance transcriptional regulator MarR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | = 1613499 | 0 (0.000) | 51 (1.640) | 31/160 | 0.1 | 100% | coding (123/435 nt) | marR | multiple antibiotic resistance transcriptional regulator MarR |
| ? | NZ_CP009273 | 1613504 = | 0 (0.000) | coding (128/435 nt) | marR | multiple antibiotic resistance transcriptional regulator MarR | |||||
CATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCG > NZ_CP009273/1613414‑1613594 | attccattgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcat < 2:417587‑M2/1‑1 (MQ=255)attccattgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcat < 1:398387‑M2/1‑1 (MQ=255) attgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAgg > 1:1019357‑M2/86‑91 (MQ=255) attgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAgg < 2:842826‑M2/6‑1 (MQ=255) attgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAgg < 2:646289‑M2/6‑1 (MQ=255) attgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAgg < 2:574053‑M2/6‑1 (MQ=255) attgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAgg < 2:1019357‑M2/6‑1 (MQ=255) gggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccccggcaTTAAGGtgc < 1:1008707‑M2/9‑1 (MQ=255) gtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGtgctc < 2:603094‑M2/11‑1 (MQ=255) gcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGtgctctgc > 1:646970‑M2/78‑91 (MQ=255) gttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTgcgc > 1:695293‑M2/64‑91 (MQ=255) ttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGcgcg > 1:708303‑M2/63‑91 (MQ=255) taatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgcttgatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCgcgg < 2:820316‑M2/30‑1 (MQ=255) atcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCgcggcg < 2:328517‑M2/32‑1 (MQ=255) agaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCgtgt < 2:695293‑M2/35‑1 (MQ=255) agaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCgcggcg > 1:555093‑M2/54‑85 (MQ=255) agaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCgcggcg < 2:555093‑M2/32‑1 (MQ=255) agaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCgcgg > 1:448802‑M2/54‑83 (MQ=255) agaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCgcgg < 2:448802‑M2/30‑1 (MQ=255) agatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTc < 2:231892‑M2/42‑1 (MQ=255) cgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCgcgg < 1:707350‑M2/30‑1 (MQ=255) cgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCgcgg > 2:707350‑M2/46‑75 (MQ=255) cgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGt > 1:615324‑M2/46‑91 (MQ=255) cgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGt > 2:772613‑M2/46‑91 (MQ=255) cctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggca‑TAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCgcgg < 2:56864‑M2/29‑1 (MQ=255) cctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggca‑TAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCgcgg > 1:56864‑M2/44‑72 (MQ=255) gcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAAc > 1:174046‑M2/41‑91 (MQ=255) gtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAgg > 1:386205‑M2/32‑91 (MQ=255) gtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAgg > 1:749058‑M2/32‑91 (MQ=255) tatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGtgctc < 2:789816‑M2/11‑1 (MQ=255) tatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGtgctc > 1:443602‑M2/31‑41 (MQ=255) tatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGtgctc > 1:789816‑M2/31‑41 (MQ=255) tatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGtgctc < 2:443602‑M2/11‑1 (MQ=255) tatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTgcgc > 2:1036406‑M2/31‑58 (MQ=255) tatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTgcgc < 1:1036406‑M2/28‑1 (MQ=255) atctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTa > 1:491819‑M2/30‑91 (MQ=255) gtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgt > 1:1045590‑M2/26‑91 (MQ=255) ccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggt > 1:613790‑M2/22‑91 (MQ=255) cgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggtc < 2:213157‑M2/71‑1 (MQ=255) cgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggtc < 1:30851‑M2/71‑1 (MQ=255) gctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggtcg > 1:684215‑M2/20‑91 (MQ=255) tggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGAc < 2:615324‑M2/74‑1 (MQ=255) attaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTggg < 2:684215‑M2/79‑1 (MQ=255) ttaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGa > 2:916826‑M2/12‑91 (MQ=255) ttaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGa > 2:657479‑M2/12‑91 (MQ=255) cgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCAc < 1:403540‑M2/84‑1 (MQ=255) cggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTg < 2:661857‑M2/86‑1 (MQ=255) cggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTg < 1:916826‑M2/86‑1 (MQ=255) ggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggtc < 1:933092‑M2/71‑1 (MQ=255) ggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggtc > 2:933092‑M2/5‑75 (MQ=255) caTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGAcc < 1:690175‑M2/89‑1 (MQ=255) ttAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCg < 2:613790/91‑1 (MQ=255) ttAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCg < 2:203682/91‑1 (MQ=255) | CATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCG > NZ_CP009273/1613414‑1613594 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |