| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | = 3572747 | 110 (1.840) | 3 (0.060) | 3/144 | 3.6 | 3.2% | coding (259/696 nt) | yhhW | quercetin 2,3‑dioxygenase |
| ? | NZ_CP009273 | = 3572830 | 84 (1.600) | coding (176/696 nt) | yhhW | quercetin 2,3‑dioxygenase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGC > NZ_CP009273/3572660‑3572832 | gATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACccgccg > 1:1092722/1‑90 (MQ=255)gATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACccgccg > 2:1066526/1‑90 (MQ=255)gATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACccgccg > 2:821097/1‑90 (MQ=255)gATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACccgccg < 1:1245051/90‑1 (MQ=255)gATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACccgccg > 2:1560605/1‑90 (MQ=255)gATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACccgccg > 2:1629019/1‑90 (MQ=255)gATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACccgccg > 1:1592421/1‑90 (MQ=255) aTACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCgg < 1:941174/90‑1 (MQ=255) aCAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTCCTCTGAGTGACGAATCCCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGaa < 2:478191/90‑1 (MQ=255) aGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATCCCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAAcc < 1:1009942/90‑1 (MQ=255) aGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTCCCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAAcc < 2:1092722/90‑1 (MQ=255) aGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAAcc < 1:982533/90‑1 (MQ=255) gATGCAGACGCTCGGTGCTTCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCt > 2:848691/1‑90 (MQ=255) gATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGa < 1:496401/86‑1 (MQ=255) gATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGa > 2:496401/1‑86 (MQ=255) gATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCt > 1:601691/1‑90 (MQ=255) gATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCt > 1:473105/1‑90 (MQ=255) gATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCt > 1:1299414/1‑90 (MQ=255) gATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCt > 2:353464/1‑90 (MQ=255) aTGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAAcc < 1:1387010/88‑1 (MQ=255) aTGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAAcc > 2:1387010/1‑88 (MQ=255) aTGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTg > 1:577649/1‑90 (MQ=255) aTGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTg > 2:1056136/1‑90 (MQ=255) tGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGc > 2:853241/1‑90 (MQ=255) cAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGctc > 2:429484/1‑90 (MQ=255) cGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTa < 2:1299414/90‑1 (MQ=255) cGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTa < 2:727728/90‑1 (MQ=255) cTCGGTGCTGTTTGGGTTGTCCTCTGAGTGACGAATCCCCGTACCAGCCCTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTAtt < 2:414905/90‑1 (MQ=255) cTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATCCCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTAtt < 2:1121556/90‑1 (MQ=255) cTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATATCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTAtt > 2:1129866/1‑90 (MQ=255) cTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTAtt < 1:1410055/90‑1 (MQ=255) cTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTAtt > 1:1479049/1‑90 (MQ=255) cGGTGCTTCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGc < 1:848691/90‑1 (MQ=255) cGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGc > 2:610553/1‑90 (MQ=255) ggTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATCCCCGTACCAGCACTCATGATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGcc < 1:1334319/90‑1 (MQ=255) ggTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGcc < 1:883529/90‑1 (MQ=255) gctgctTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCAt > 1:827309/1‑90 (MQ=255) tgtttGGGTTGTACTCTGAGTGGCAAATCCCCGTACCAGCTCTAATAATCTGAACCTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGc < 2:1592421/87‑1 (MQ=255) tgctTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATCCCCGTCCCCGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGc < 2:247155/90‑1 (MQ=255) gctTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATCCCCGTACCAGCCCTCATAACCCGGACCTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCt < 2:306756/90‑1 (MQ=255) tGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTc > 1:346431/1‑90 (MQ=255) ggTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCt < 1:1560605/90‑1 (MQ=255) ggTTGTACTCTCAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTCCCCATGCTGTCCt > 2:1261153/1‑90 (MQ=255) ttGTCCTCTGAGTGACGAATCCCCGTACCAGCACTAATAACCTGGAACTCCCCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGa < 2:1065005/90‑1 (MQ=255) tACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGt < 1:596844/82‑1 (MQ=255) tACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGt > 2:596844/1‑82 (MQ=255) tACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGc < 1:1316765/90‑1 (MQ=255) tGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAAc > 2:918662/1‑90 (MQ=255) tGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAAc > 1:670669/1‑90 (MQ=255) tGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGACGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAAc > 2:1458760/1‑90 (MQ=255) ggggACAAATCCCCGTCCCAGCACTAATAATCTGGAACTCCCCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAg < 2:510394/87‑1 (MQ=255) gTGACGAATCCCCGTACCAGCCCTCATAATCGGGACCTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGt < 2:1779499/90‑1 (MQ=255) tGACGAATACCCGTACCAGCCCTCATAATCTGGAACTCACCCGTCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTa < 1:1586716/90‑1 (MQ=255) tGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTa > 1:189733/1‑90 (MQ=255) tGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTa > 2:1578807/1‑90 (MQ=255) aCGAATATCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTAcc < 1:1129866/90‑1 (MQ=255) tACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCa > 1:1664469/1‑90 (MQ=255) aGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGt > 2:806610/1‑90 (MQ=255) cACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCa > 2:1234012/1‑90 (MQ=255) tCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCt < 1:447349/54‑1 (MQ=255) tCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCt > 2:447349/1‑54 (MQ=255) cATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGc > 2:1284846/1‑47 (MQ=255) cATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGc < 1:1284846/47‑1 (MQ=255) cATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGc < 1:1701306/58‑1 (MQ=255) cATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGc > 2:1701306/1‑58 (MQ=255) cATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTAc < 1:803734/68‑1 (MQ=255) cATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTAc > 2:803734/1‑68 (MQ=255) cATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAAt > 1:796971/1‑90 (MQ=255) cATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAAt < 2:1479049/90‑1 (MQ=255) tCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCa < 1:1234012/90‑1 (MQ=255) tCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCa < 1:1752228/90‑1 (MQ=255) tCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCa < 2:533045/90‑1 (MQ=255) tCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCa > 2:318143/1‑90 (MQ=255) cTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCat < 1:156074/90‑1 (MQ=255) aggATCTGACCCACCGGCACCTGCCGTGTACCGCCCATGCTCCCCTGCTGCCCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCata < 2:277409/89‑1 (MQ=255) ggAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGc > 2:487226/1‑50 (MQ=255) ggAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGc < 1:487226/50‑1 (MQ=255) ggAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCatat > 2:483088/1‑90 (MQ=255) ggAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCatat > 2:907178/1‑90 (MQ=255) ggAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCa > 2:1209128/1‑87 (MQ=255) ggAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCa < 1:1209128/87‑1 (MQ=255) gaccTCCCCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATc < 1:853241/87‑1 (MQ=255) gAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGc < 1:585499/49‑1 (MQ=255) gAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGc > 2:585499/1‑49 (MQ=255) gAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATc < 1:689835/90‑1 (MQ=255) gAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATc < 2:827309/90‑1 (MQ=255) gAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATc < 1:855977/90‑1 (MQ=255) gAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATc < 1:907178/90‑1 (MQ=255) aCTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATTCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCtt > 2:301413/1‑90 (MQ=255) aCTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTAc > 1:1033856/1‑57 (MQ=255) aCTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTAc < 2:1033856/57‑1 (MQ=255) aCTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCtt < 1:429484/90‑1 (MQ=255) cTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCttt > 2:1113132/1‑90 (MQ=255) cACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGc < 2:5596/44‑1 (MQ=255) cACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTAt > 1:1443202/1‑90 (MQ=255) cccGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGc < 1:691738/90‑1 (MQ=255) cccGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGc < 1:1032860/90‑1 (MQ=255) cgccgGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTa < 1:902184/63‑1 (MQ=255) cgccgGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTa > 2:902184/1‑63 (MQ=255) cgccgGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTa < 1:984428/63‑1 (MQ=255) | GATACAGATGCAGACGCTCGGTGCTGCTTGGGTTGTACTCTGAGTGACGAATACCCGTACCAGCACTCATAATCTGGAACTCACCCGCCGGAACCTGCTCTTTATTGCCCATGCTGTCCTGATGCTCAACAGTACCTTCCAGCACGTAGGTCAAAATTTCCATATCTTTATGC > NZ_CP009273/3572660‑3572832 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |