| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 656512 | 242 (2.960) | intergenic (‑544/‑45) | dcuC/pagP | anaerobic C4‑dicarboxylate transport/phospholipid:lipid A palmitoyltransferase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
TTCTTTTTTGACTATTCCCATCGCAGAAAACGACGCATCATCTTTAATCGATGCGCGGAAATATTTAACTTGAACAAGCGGAAATAAATAGAGCAGCTATTCAGATTATTCTTTATGTTGGGTCTATTAAGGTTATGTTAATTGTAGCTTTGCTATGCTAGTAGTAGATTTTTGATAAATGTTTTATGGTCACAAATGAACGTGAGTAAATATGTCGCTATCTTTTCCTTTGTTTTTATTCAGTTAATCAGCGTTGGTAAAGTTTTTGCTAACGCAGATGAGTGGATGACAACG > NC_000913/656362‑656655 | ttCTTTTTTGACTATTCCCATCGCAGAAAACGACGCATCATCTTTAATCGATGCGCGGAAATATTTAACTTGAACAAGCGGAAATAAATAGAGCAGCTATTCAGATTATTCTTTATGTTGGGTCTATTAAGGTTATGTTAATTGTAGC > 8:16754‑M1/1‑148 (MQ=255) ttttttGACTATTCCCATCGCAGAAAACGACGCATCATCTTTAATCGATGCGCGGAAATATTTAACTTGAACAAGCGGAAATAAATAGAGCAGCTATTCAGATTATTCTTTATGTTGGGTCTATTAAGGTTATGTTAATTGTAGCt < 4:29259/146‑1 (MQ=255) tGACTATTCCCATCGCAGAAAACGACGCATCATCTTTAATCGATGCGCGGAAATATTTAACTTGAACAAGCGGAAATAAATAGAGCAGCTATTCAGATTATTCTTTATGTTGGGTCTATTAAGGTTATGTTAATTGTAGCTTtgctat > 4:203117/1‑148 (MQ=255) gACTATTCCCATCGCAGAAAACGACGCATCATCTTTAATCGATGCGCGGAAATATTTAACTTGAACAAGCGGAAATAAATAGAGCAGCTATTCAGATTATTCTTTATGTTGGGTCTATTAAGGTTATGTTAATTGTAGCTTtgctat < 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tAGCTTTGCTATGCTAGTAGTAGATTTTTGATAAATGTTTTATGGTCACAAATGAACGTGAGTAAATATGTCGCTATCTTTTCCTTTGTTTTTATTCAGTTAATCAGCGTTGGTAAAGTTTTTGCTAACGCAGATGAGTGGATGACa < 1:383950/147‑1 (MQ=255) aGCaaagctacaattaacataaccttaatagacccaacataaagaataatctgaatagctgctctatttatttccgcttgttcaagttaaatatttccgcgcatcgattaaagatgatgcgtcgttttctgcgatgggaatagtcaa > 2:217345‑M1/1‑3 (MQ=255) aGCaaagctacaattaacataaccttaatagacccaacataaagaataatctgaatagctgctctatttatttccgcttgttcaagttaaatatttccgcgcatcgattaaagatgatgcgtcgttttctgcgatgggaatagtcaa > 2:231006‑M1/1‑3 (MQ=255) aGCaaagctacaattaacataaccttaatagacccaacataaagaataatctgaatagctgctctatttatttccgcttgttcaagttaaatatttccgcgcatcgattaaagatgatgcgtcgttttctgcgatgggaatagtcaa > 2:405635‑M1/1‑3 (MQ=255) caaagctacaattaacataaccttaatagacccaacataaagaataatctgaatagctgctgtatttatttacgcttgttcaagtttaatatttcctcgcatctattaaagatgatgcgtcgttttctgcgatgggaatagtcaaaa > 6:170336‑M1/1‑1 (MQ=255) caaagctacaattaacataaccttaatagacccaacataaagaataatctgaatagctgctctatttatttccgcttgttcaagttaaatatttccgcgcatcgattaaagatgatgcgtcgt > 6:228267‑M1/1‑1 (MQ=255) | TTCTTTTTTGACTATTCCCATCGCAGAAAACGACGCATCATCTTTAATCGATGCGCGGAAATATTTAACTTGAACAAGCGGAAATAAATAGAGCAGCTATTCAGATTATTCTTTATGTTGGGTCTATTAAGGTTATGTTAATTGTAGCTTTGCTATGCTAGTAGTAGATTTTTGATAAATGTTTTATGGTCACAAATGAACGTGAGTAAATATGTCGCTATCTTTTCCTTTGTTTTTATTCAGTTAATCAGCGTTGGTAAAGTTTTTGCTAACGCAGATGAGTGGATGACAACG > NC_000913/656362‑656655 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |