| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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|
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| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP025533 | = 1778275 | 0 (0.000) | 133 (1.090) +TGTTTAAGTTTAGTGGATGG |
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| ? | CP025533 | 2000080 = | 0 (0.000) | intergenic (‑471/+15) | CYL77_09540/CYL77_09545 | hypothetical protein/anion transporter | |||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
CAGAAGCCATCGCTCACCCTCTCGCCCGCGTGGGGTGAACGTGGGGTGAGTGGATTCATTTCTGGTCATTCTTGGGCGCTTCCTGCTAAAATGAAGCCATCGCGACCTCGCGTTTTATGAAGGCACCAGGGCGCTACGGCTGGTTCGAACCCAGCTAGGACCACAACTAAACCCCCTGTAAACAGGGGGTTTTCGTCGTTTCATGACTATCTATAGCTTCTTCAGCTTTTCAAGGGATGAAGGTTCCAGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCCACAGTTGGGAGGAAAAATACGATGAGCGCTCCCCCGATGATGTCAAAGCTAATTCCAGTGCGGATCATTCGAGCAATGGATACGCAGCCCGAACCGTAGACGATGGCGTTCTGCGGTGTGGAAATCGGAAGCATGAACCCAAATGAAGCACCGAATGCAGCCGCCATAGCCGGGATAACTGGATCAATACCGGCCGCTATGGCAA > CP025533/1999832‑2000324 | agaccgaacgctccctcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggg < 1:642416‑M2/1‑1 (MQ=255) gctccctcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGAt < 1:130516‑M2/10‑1 (MQ=255) ctcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACg > 2:741239‑M2/235‑249 (MQ=255) cgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTc > 2:666029‑M2/233‑249 (MQ=255) aacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAg < 1:378021‑M2/19‑1 (MQ=255) ccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAAc < 1:100002‑M2/30‑1 (MQ=255) caagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgctttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAccc > 2:759312‑M2/219‑249 (MQ=255) gccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGcc < 1:308472‑M2/40‑1 (MQ=255) aaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCCACAGt < 2:1036069‑M2/45‑1 (MQ=255) aaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCCACAGtt < 2:772214‑M2/46‑1 (MQ=255) aagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCCACAGTTg < 1:1149447‑M2/47‑1 (MQ=255) cacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCCACAGTtgggn > 2:492217‑M2/200‑248 (MQ=255) caggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCCACAGTTGggagg < 2:803957‑M2/52‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |