| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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|
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| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP025533 | = 1778275 | 0 (0.000) | 133 (1.090) +TGTTTAAGTTTAGTGGATGG |
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| ? | CP025533 | 2000080 = | 0 (0.000) | intergenic (‑471/+15) | CYL77_09540/CYL77_09545 | hypothetical protein/anion transporter | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
CGGTGCTGGAATAACTTTAGACCGAACGCTCCCTCGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGACCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTGAAAAATTGAACCGATTATGAATATTCAAAACTTCCGTGTTAACTTCTAAGCACACCGCAAGGTCCTATGGCTCAGTGGAAGAGCGTTCCGTTCACACCGGAAAGGTCGCTGGTTCGAACCCAGCTAGGACCACTTGTTTAGCCCCTGCTTGCAGGGGTTTTATTCATTTTTAGGGTTAAAAAACACGCGTTTGTGGGGTGAACGTGGGGTGAAAGAATTCATTACGAGTGCTTTTAAGCACCTCTCC > CP025533/1778030‑1778522 | tGCTGGAATAACTTTAGACCGAACGCTCCCTCGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGACCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTGtgttta < 2:1228‑M1/249‑7 (MQ=255) gCTGGAATAACTTTAGACCGAACGCTCCCTCGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGACCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTGtgtttaa < 1:793203‑M1/249‑8 (MQ=255) aTAACTTTAGACCGAACGCTCCCTCGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGACCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTGtgtttaagtttag > 2:233004‑M1/1‑236 (MQ=255) tAACTTTAGACCGAACGCTCCCTCGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGACCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTGtgtttaagtttagt > 1:794965‑M1/1‑235 (MQ=255) 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aGACCGAACGCTCCCTCGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGACCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTGtgtttaagtttagtggatggg < 1:642416‑M1/249‑22 (MQ=255) aaCGCTCCCTCGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGATCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTGtgtttaagtttagtggatgggctcctc < 2:542469‑M1/249‑28 (MQ=255) gCTCCCTCGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGACCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTGtgtttaagtttagtggatgggctcctcgat < 1:130516‑M1/249‑31 (MQ=255) cTCCCTCGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGACCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTGtgtttaagtttagtggatgggctcctcgatt > 1:292573‑M1/1‑218 (MQ=255) cTCGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGACCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTGtgtttaagtttagtggatgggctcctcgattaacg > 2:741239‑M1/1‑214 (MQ=255) cGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGACCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTGtgtttaagtttagtggatgggctcctcgattaacgtc > 2:666029‑M1/1‑212 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |