New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AM260480 | 1718541 = | 12 (0.360) | 3 (0.100) | 3/198 | 2.8 | 22.1% | coding (24/282 nt) | h16_B1530 | Hypothetical protein |
? | AM260480 | 1718591 = | 10 (0.330) | coding (74/282 nt) | h16_B1530 | Hypothetical protein |
ACCGATAGCGAAGCCGCGCAGCCGCCGGTGCCAGGCCACCGGCGGCTGTGCGCCGGCGTCAGCGGGCAGTGCCCGAGCCGCTGGCTGCACCGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAGGGGTGCTGCTGCGGCTGCGGCTCTGTTCGGTGACCGAACCGGCGCCGGACAGCGAGCCAGAGCCGGTGGT > AM260480/1718471‑1718708 | aCCGATAGCGAAGCCGCGCAGCCGCCGGTGCCAGGCCACCGGCGGCTGTGCGCCGGCGTCAGCGGGCAGTGCCCGAGCCGCTGGCTGCACCGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCtggtt > 1:580947/1‑133 (MQ=255) ctagctcaagcacttctaccggcacgtccggcgccaccagcacgaccaGCCCGAGCCGCTGGCTGCACCGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAg < 1:456598‑M1/86‑1 (MQ=255) cgccgGTGCCAGGCCACCGGCGGCTGTGCGCCGGCGTCAGCGGGCAGTGCCCGAGCCGCTGGCTGCACCGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAg < 2:430464/134‑1 (MQ=255) cgccgGTGCCAGGCCACCGGCGGCTGTGCGCCGGCGTCAGCGGGCAGTGCCCGAGCCGCTGGCTGCACCGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAg < 1:727510/134‑1 (MQ=255) cttctaccggcacgtccggcgccaccagcacgaccagcccgagcggcacctccagcggcagcagcggtgcagccagcggctcgggcTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAg < 1:456598‑M2/48‑1 (MQ=255) CGAGCCGCTGGCTGCACCGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAGGGGTGCTGCTGCGGCTGCGGCTCTGTTCGGTGACCGAAc > 2:580947‑M1/1‑134 (MQ=255) CGAGCCGCTGGCTGCACCGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAGGGGTGCTGCTGCGGCTGCGGCTCTGTTCGGTGACCGAAc < 1:262611‑M1/134‑1 (MQ=255) AGCCGCTGGCTGCACCGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAGGGGTGCTGCTGCGGCTGCGGCTCTGTTCGGTGACCGAACCg < 1:624289‑M1/134‑1 (MQ=255) gctggctgCACCGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAGGGGTGCTgctgcg < 2:882687/102‑1 (MQ=255) gctggctgCACCGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAGGGGTGCTgctgcg > 1:882687/1‑102 (MQ=255) tgCACCGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAGGGGTGCTGCTGCGGCTGCGGCTCTGTTCGGTGACCGAACCGGCGCCGGa > 1:65228/1‑132 (MQ=255) ccagcggcagcagcggtgcagccagcggctcgggcTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTg < 2:183894‑M2/42‑1 (MQ=255) ccagcggcagcagcggtgcagccagcggctcgggcTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTg > 1:183894‑M2/36‑77 (MQ=255) ccGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAGGGGTGCTGCTGCGGCTGCGGCTCTGTTCGGTGACCGAACCGGCGCCGGACAGCGa < 2:624289/134‑1 (MQ=255) tgcCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAGGGGTGCTGCTGCGGCTGCGGCTCTGTTCGGTGACCGAACCGGCGCCGGACAGCGAGCCagag > 1:169206/1‑134 (MQ=255) cTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAGGGGTGCTGCTGCGGCTGCGGCTCTGTTCGGTGACCGAACCGGCGCCGGACAGCGAGCCAGAGCCggt < 2:169206/134‑1 (MQ=255) gAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAGGGGTGCTGCTGCGGCTGCGGCTCTGTTCGGTGACCGAACCGGCGCCGGACAGCGAGCCAGAGCCggtggt > 2:68737/1‑134 (MQ=255) | ACCGATAGCGAAGCCGCGCAGCCGCCGGTGCCAGGCCACCGGCGGCTGTGCGCCGGCGTCAGCGGGCAGTGCCCGAGCCGCTGGCTGCACCGCTGCTGCCGCTGGAGGTGCCGCTCGGGCTGGTCGTGCTGGTGGCGCCGGACGTGCCGGTAGAAGTGCTTGAGCTAGGGGTGCTGCTGCGGCTGCGGCTCTGTTCGGTGACCGAACCGGCGCCGGACAGCGAGCCAGAGCCGGTGGT > AM260480/1718471‑1718708 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |