New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AM260480 | 128407 = | 16 (0.580) | 4 (0.160) | 4/196 | 2.0 | 20.2% | coding (823/1728 nt) | h16_B0110 | ABC‑type transporter, duplicated permease domains |
? | AM260480 | 128449 = | 17 (0.680) | coding (865/1728 nt) | h16_B0110 | ABC‑type transporter, duplicated permease domains |
TACAAGGCGGTGGTCGGGCAGCAGCAGTTCGACCGCGGCGCGCTGATCGGCATGCTGCTGCTGGCGCCCGCGCTGCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGGCGCTGGTCAGTGCCGCGCTGCTGGCAGTGATCGCCACCGCGCT > AM260480/128338‑128576 | tACAAGGCGGTGGTCGGGCAGCAGCAGTTCGACCGCGGCGCGCTGATCGGCATGCTGCTGCTGGCGCCCGCGCTGCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCcg < 1:576291/134‑1 (MQ=255) cAAGGCGGTGGTCGGGCAGCAGCAGTTCGACCGCGGCGCGCTGATCGGCATGCTGCTGCTGGCGCCCGCGCTGCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCcgcg < 1:588918/134‑1 (MQ=255) cgcgGCGCGCTGATCGGCATGCTGCTGCTGGCGCCCGCGCTGCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCgg > 1:803743/1‑134 (MQ=255) cggcgCGCTGATCGGCATGCTGCTGCTGGCGCCCGCGCTGCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGcc > 1:549962/1‑134 (MQ=255) gcgcgcTGATCGGCATGCTGCTGCTGGCGCCCGCGCTGCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGctgc < 2:803743/134‑4 (MQ=255) gcTGATCGGCATGCTGCTGCTGGCGCCCGCGCTGCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACg < 2:606426/134‑1 (MQ=255) cATGCTGCTGCTGGCGCCCGCGCTGCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGcc < 2:549962/134‑1 (MQ=255) gctgGCGCCCGCGCTGCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCtgg > 1:682410/1‑134 (MQ=255) ctgGCGCCCGCGCTGCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCtggt < 1:863652/134‑1 (MQ=255) cgcCCGCGCTGCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGgcg > 1:317279/1‑134 (MQ=255) gcgctgctgcattgccatgtccacggcaaaggtcagcagcgcCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGgcgc > 2:848668‑M2/43‑130 (MQ=255) gcgctgctgcattgccatgtccacggcaaaggtcagcagcgcCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGgcgc < 1:848668‑M2/88‑1 (MQ=255) GCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGcc < 2:95794‑M1/95‑1 (MQ=255) GCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGcc > 1:95794‑M1/1‑95 (MQ=255) ccGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGGCGCTGGTCAGTGCCGCgctcgg < 2:682410/133‑4 (MQ=255) gTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGGCGCTGGTCAGTGCCGCGCTGCTgg > 1:446378/1‑133 (MQ=255) cggcaaaggtcagcagcgcCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGGCGCTGGTCAGTGCCGCgctgct > 1:934913‑M2/20‑126 (MQ=255) cggcaaaggtcagcagcgcCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGGCGCTGGTCAGTGCCGCgctgct < 2:934913‑M2/107‑1 (MQ=255) cATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGAc < 2:405352/82‑1 (MQ=255) cATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGAc > 1:405352/1‑82 (MQ=255) tGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGGCGCTGGTCAGTGCCGCGCTGCTGGCAGTGATc < 2:446378/134‑1 (MQ=255) aTGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCcg > 2:1015800/1‑35 (MQ=255) aTGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCcg < 1:1015800/35‑1 (MQ=255) gcagcgcCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGGCGCTGGTCAGTg > 1:679582‑M2/8‑104 (MQ=255) gcagcgcCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGGCGCTGGTCAGTg < 2:679582‑M2/97‑1 (MQ=255) cagcgcCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGGCGCTGGTCAGTGCCGCGCTGCTGGCAGTGATCGCCACCGCGCt > 1:531140‑M2/7‑134 (MQ=255) | TACAAGGCGGTGGTCGGGCAGCAGCAGTTCGACCGCGGCGCGCTGATCGGCATGCTGCTGCTGGCGCCCGCGCTGCTGACCTTTGCCGTGGACATGGCAATGCAGCAGCGCCAGCGCACACAGATGGGCAGCCGCGCGCAGGTGTATGTGCCGGCGCCCGAGCGCGGCCGCGACGGCGCGTGCCTGCTGCTGGTGGCGCTGGTCAGTGCCGCGCTGCTGGCAGTGATCGCCACCGCGCT > AM260480/128338‑128576 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |