| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_31 | 1 = | 0 (0.000) | 452 (0.380) +TTTAACAACTAATGTTGTT |
72/216 | 0.2 | 72.8% | intergenic (–/‑269) | –/rasttk_feature_creation_tool=RNA_reps_LSU_rRNA | –/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | AssemblyC74_contig_63 | = 176 | 397 (0.810) | intergenic (+2/‑26) | rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE/rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE | tRNA‑Ala‑TGC/tRNA‑Met‑CAT | |||||
Only 100 of 898 total aligned reads displayed.
TTTGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAGGTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCGATTTTTAAGAGCCTGGACCTTTAGCTCAGTTGGTTA > AssemblyC74_contig_63/41‑310 | agactacacaatttgtttttactttgttcagttttgagaggtttactctcaaTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCcatt > 2:63476‑M2/53‑135 (MQ=255) gactacacaatttgtttttactttgttcagttttgagaggtttactctcaaTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCcatt < 2:271168‑M2/83‑1 (MQ=255) tGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCcattt < 2:3086901/135‑1 (MQ=255) tGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCcattt < 1:1940927/135‑1 (MQ=255) acacaatttgtttttactttgttcagttttgagaggtttactctcaaTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAggctccattaacaa > 2:776714‑M2/48‑130 (MQ=255) acacaatttgtttttactttgttcagttttgagaggtttactctcaaTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAggctccattaacaa > 1:1765093‑M2/48‑130 (MQ=255) acacaatttgtttttactttgttcagttttgagaggtttactctcaaTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAggctccattaacaa > 1:2549188‑M2/48‑130 (MQ=255) cacaatttgtttttactttgttcagttttgtgaggtttactctcaaTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTaggctccattaacaac > 2:1036102‑M2/47‑129 (MQ=255) ggggTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAaat > 1:1691950/1‑135 (MQ=255) gCAGTTTCTAATACTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAATCTAGTGTACTTTGCTCAGCTGGGAGAGCGAATGCTTTGCAAGCAGGAGTTCAGCGTTTCGATCCAGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATATTGaa < 1:1857789/135‑1 (MQ=255) 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tctcaatttaAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttga > 1:2074934‑M2/5‑89 (MQ=255) tataAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGc > 1:810441/1‑135 (MQ=255) ataAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCt < 1:2266626/135‑1 (MQ=255) aaTTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCtttt > 1:3377160‑M2/3‑110 (MQ=255) aaTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagta > 1:161992‑M2/1‑85 (MQ=255) aaTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagta > 2:368098‑M2/1‑85 (MQ=255) tttAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGc < 2:2104319/135‑1 (MQ=255) tttAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGc < 2:1564830/135‑1 (MQ=255) tttAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGc < 2:145226/135‑1 (MQ=255) tttAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGc < 2:473462/135‑1 (MQ=255) tttAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGc < 1:614360/135‑1 (MQ=255) tttAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGc < 1:96528/135‑1 (MQ=255) ttAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaat < 1:2433823‑M2/135‑54 (MQ=255) ttAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaat < 1:462025‑M2/135‑54 (MQ=255) ttAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaat < 2:1768188‑M2/135‑54 (MQ=255) taaaacGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagta > 2:3327181‑M2/2‑81 (MQ=255) acGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGCGTCCgg > 2:586096/1‑134 (MQ=255) acGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGCGTCCgg > 2:84060/1‑134 (MQ=255) gggCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaa > 2:2658812‑M2/1‑74 (MQ=255) gggCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaa > 1:127626‑M2/1‑74 (MQ=255) gggCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaa > 2:1211922‑M2/1‑74 (MQ=255) gggCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaa > 2:2016404‑M2/1‑74 (MQ=255) ccTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCtttt > 1:1060289/1‑95 (MQ=255) cTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaataca < 1:1004523‑M2/135‑66 (MQ=255) cTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaataca < 1:1545686‑M2/135‑66 (MQ=255) ttAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGCGTCCGGTTCATAcc < 2:810441/134‑1 (MQ=255) aGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaac < 1:654399‑M2/135‑69 (MQ=255) aGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGCGTCCGGTTCATACCCgg > 1:2993156/1‑135 (MQ=255) cTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagta < 2:2435762‑M2/115‑51 (MQ=255) cAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAgg < 2:1647763/135‑1 (MQ=255) 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ggAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacac < 1:1419675‑M2/134‑78 (MQ=255) gagCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcg < 1:2721651‑M2/135‑82 (MQ=255) cTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaat < 2:2265973‑M2/135‑88 (MQ=255) cTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagta > 1:1335029‑M2/1‑48 (MQ=255) cTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagta < 2:1335029‑M2/98‑51 (MQ=255) tGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatt < 1:399248‑M2/135‑89 (MQ=255) ttGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaa < 1:268449‑M2/135‑93 (MQ=255) gCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctg < 1:2389709‑M2/134‑98 (MQ=255) gCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctg < 2:2150270‑M2/134‑98 (MQ=255) gCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctg < 2:1605560‑M2/134‑98 (MQ=255) ggaggTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaac > 2:3023637‑M2/1‑34 (MQ=255) ggaggTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaac > 2:2749827‑M2/1‑34 (MQ=255) 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ttCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttg < 1:718145‑M2/67‑46 (MQ=255) ttCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAGGTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCGATTTTTAAGAGCCTg > 1:2014606/1‑135 (MQ=255) cGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctg > 1:2342439‑M2/1‑20 (MQ=255) cGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagccta < 2:1934206‑M2/135‑116 (MQ=255) tCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctgaag < 2:2943511‑M2/135‑119 (MQ=255) tCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctaaag < 2:1883060‑M2/135‑119 (MQ=255) tCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaac < 1:3248811‑M2/117‑101 (MQ=255) tCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaac > 2:3248811‑M2/1‑17 (MQ=255) ccGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctaaagca > 1:2140251‑M2/1‑15 (MQ=255) cGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAGGTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCGATTTTTAAGAGCCTGGACCTTTa < 1:1203403/135‑1 (MQ=255) aGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctgaagcaaaata < 1:30349‑M2/135‑126 (MQ=255) aGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAGGTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCGATTTTTAAGAGCCTGGACCTTTAGCt < 1:849211/134‑1 (MQ=255) ggCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctaaagcaaaatag > 2:1278199‑M2/1‑9 (MQ=255) ggCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaaaaccgcggtgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctaaagcaaataa < 1:1481218‑M2/134‑126 (MQ=255) ggCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAGGTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCGATTTTTAAGAGCCTGGACCTTTAGCTCa > 2:2888605/1‑135 (MQ=255) tCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctgaagcaaaataggc > 1:3083530‑M2/1‑6 (MQ=255) tCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctaaagcaaaataggc > 1:2775343‑M2/1‑6 (MQ=255) tCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctaaagcaaaataggc > 2:1403144‑M2/1‑6 (MQ=255) ccATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctaaagcaaaataggcg > 2:2459645‑M2/1‑5 (MQ=255) taacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaattaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagccagaagcaaaataggcggacg < 1:3185476‑M2/134‑134 (MQ=255) taacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtcatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctgaagcacaatatgcggacg < 2:257480‑M2/134‑134 (MQ=255) taacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctgaagcaaaataggcggacg < 1:290614‑M2/134‑134 (MQ=255) taacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctgaagcaaaataggcggacg < 2:869781‑M2/134‑134 (MQ=255) taacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaatgtaagtaatacaaaccgagaacaccgcgttgaatttgaaagctgaacaaattgtttagcctgaagcaaaataggcggacg < 2:924519‑M2/134‑134 (MQ=255) | TTTGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGCGTCCGGTTCATACCCGGGAGGTCGGGGGTTCGATCCCCTCCGCCGCGATTTTTAAGAGCCTGGACCTTTAGCTCAGTTGGTTA > AssemblyC74_contig_63/41‑310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |