New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_24 | 1 = | 0 (0.000) | 155 (0.620) +CTGACGTGTCCGT |
52/232 | 1.6 | 53.9% | coding (1/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
? | AssemblyC74_contig_24 | = 215 | 295 (1.060) | coding (215/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
ATCCGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_24/134‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTTGTGGTAGA < AssemblyC74_contig_24/215‑138 ||||||||||||| TCCGTACTTTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGC < 2:2199421/134‑1 TCCGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCT > 1:2441429/1‑135 TCCGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGC < 1:1989885/134‑1 ctGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGTGGTAGTATCTGTACGGTCACGTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTCGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTG > 2:823311/3‑135 CGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCCCTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACGTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTTAAGCTGA > 1:2387338/1‑135 CGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGA > 1:1213474/1‑135 TCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCC > 1:189801/1‑135 TGAAGCTGACGTGTCCGTGCCATCACGTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTACCTTTAATCTGAAATGTCCGTGCa > 2:1681778/1‑134 AAGCTGACGTTTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTgt < 1:1663411/135‑3 AAGCTGACGTCTCCGTCCTCTCACTTGTTGAAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGATGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTgt < 2:1155692/135‑3 ACGTGTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTG < 1:584722/135‑1 GTGTCCGTGCCATCTCTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTG < 2:1207443/135‑1 GTGTCCGTGCCATCTCTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTG < 1:909948/135‑1 GTGTCCGTGCCATCACTTGTGGTTGTGGGAGTTTCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTG < 2:1551466/135‑1 GTGTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTG < 2:1660332/135‑1 TGTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGG < 1:2556515/135‑1 TGTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACGTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGG > 1:762143/1‑135 CGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTTACTGTACTGTCTCTTGAAGCTGATGTTTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGA < 2:762143/135‑1 CGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGA < 1:713282/135‑1 CGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGA < 1:1273425/135‑1 gtgctgTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGAAGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAG > 1:380756/7‑135 GCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGT > 1:800111/1‑135 ctATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTCTCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTA < 1:227389/133‑1 atgacgTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAG < 2:295135/128‑1 atctaTTGTTGTAGAGGAAGTATATGTACTTTCTGTTGATGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAG < 1:725459/129‑1 ATCACTTGTTGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGAGGTGTCCGTGCTATCACTTGTTGTTGTGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAG < 1:468082/134‑1 ATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTTAATCTGAAGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGT > 2:2408528/1‑135 ATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGGTGAAGTTTAAGTGCTTTGACTTGTGGTAGAGGTAtt > 2:2246187/1‑133 ATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGT > 2:1086520/1‑135 ATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGT > 2:2066334/1‑135 ATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAG < 1:1605114/134‑1 ATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAG < 2:615919/134‑1 ATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAG < 2:1182020/134‑1 ATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGAAGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGT > 1:109147/1‑135 ATCACTAGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAG < 1:2201359/134‑1 ctCTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTAT < 1:651129/133‑1 TGGTAGAGGTAGTATCTGTACTTTCTCTTGAAGCTGATGTGTCAGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCTCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTAC < 2:852109/135‑1 TAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGA < 2:1883698/118‑1 TAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGA > 1:1883698/1‑118 GAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTC < 2:1333256/134‑1 GAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTTGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGAAGTTTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTC < 2:1892958/134‑1 AGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTAACTGTACTGTCACTTG < 1:271011/134‑1 AGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGAAGTTTACGTGCTGTCACTTTTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACT > 1:2503527/1‑132 ATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCTCTTGAAGCTGAAGTGTCCGGGCTTTCACTAGTGTTAGAGGTAGTATCTGTACAGTCACTTGA > 2:395106/1‑132 ATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGA > 1:1809443/1‑132 TCTGTACTGTCTCTTGAAGCTGATGTTGCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGTAGCAGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCT < 1:85143/135‑1 TCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGATGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAG < 2:1493524/133‑1 TCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCT < 1:1547381/135‑1 CTGTACTGTCTCTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTG < 1:1223769/99‑1 CTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTG > 2:1223769/1‑99 TACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGAtg < 1:2153042/135‑3 TACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGAtg < 2:777737/135‑3 TACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGAGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCTCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGAtg < 1:957384/135‑3 CTGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTCTCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGAGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTG < 1:1441105/135‑1 CTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGT < 2:1041874/134‑1 TGTCGCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTAATGTCAATTGAAGCTGATGTG > 2:898024/1‑134 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCT > 1:2526559/1‑110 TGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCT < 2:2526559/110‑1 gCTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGA < 1:587627/95‑1 CTTGAAGCTGATGTTTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGT > 1:84673/1‑98 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAG > 2:2501171/1‑96 CTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAG < 1:2501171/96‑1 CTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGT < 2:84673/98‑1 CTTGAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGAAGTTTACGTGCTTTAACTTGTGGTAGAGGTAGTATATGTACTGTCAAATGAAGCTGATGTGTACGTG > 2:40519/1‑135 GAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTC < 1:610859/110‑1 GAAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTC > 2:610859/1‑110 AAGCTGATGTATCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTAT < 1:2233429/135‑1 AGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTG < 2:797140/113‑1 AGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTG > 1:797128/1‑113 GCTGATGTGTCCGTTCTCTCACTTGTTGTTGAGGTATTATCGGTACTGTCGCTTGTAGCTGACGTGTCCGAGCTTTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCA < 2:1475537/135‑1 TGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATC > 2:1785033/1‑132 TGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATC < 1:1785033/132‑1 gtcGTGTCCGTGCTATCACTTGTTGTTGAGGTTGTATCTGTACTGTCTCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTTTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACT < 2:1271073/131‑1 acGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTTGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTG < 2:669576/133‑1 GTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTTGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTg < 2:544538/135‑2 aCCGTGCTATCACTTGTTGTCGAGGTTGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTCGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTa < 2:1581885/134‑2 CGTGCTATCACTTGTGGTAGATGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTaga < 2:593847/135‑4 CGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTaga < 2:1460404/135‑4 CGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTaga < 1:429585/135‑4 GTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTagag > 1:1033397/1‑131 GTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTagag > 1:2022897/1‑131 CTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTagaggt < 2:2191488/134‑7 CTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTagaggt < 1:1688078/134‑7 GGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGC > 1:1406820/1‑47 GGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGC < 2:1406820/47‑1 GTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGA > 1:650583/1‑56 GTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGA < 2:650583/56‑1 ATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGA < 1:635399/51‑1 ATCTGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGT < 1:1004424/45‑1 cGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTG > 2:48870/2‑43 cGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTG < 1:48870/42‑1 GTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTA < 1:2353967/55‑1 GTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTA > 2:2353967/1‑55 CTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTG < 1:1494608/88‑1 CTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTAT < 1:13215/82‑1 GAAGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTC > 2:1940773/1‑53 AGCTGACGTGTCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTG < 2:250726/67‑1 TCCGTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTC < 1:478024/41‑1 GTGCTGTCACTTGTGGTTGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTG < 1:958953/70‑1 GTGCTGTCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTG > 2:958953/1‑70 ||||||||||||| ATCCGTACTGTCGCTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCCATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGATGTGTCCGTGCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCGCTTGAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_24/134‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTATCACTTGTGGTAGAGGTAGTATCTGTACTGTCACTTGAAGCTGACGTGTCCGTGCTATCACTTGTTGTGGTAGA < AssemblyC74_contig_24/215‑138 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |