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gATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGAATCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACgtcgtc > 2:1533149/1‑134 (MQ=255) acagcacggacacgtcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtgacagtacagatactacctctaccacaagtgatggcacggaaacgtcagctt < 1:1663411‑M2/133‑131 (MQ=255) aGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTAcc < 2:806120/135‑1 (MQ=255) cacggacacgtcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtgacagtacagatactacctctaccacaagtgatggcacggacacgtcagcttcaag > 1:650600‑M2/1‑1 (MQ=255) | ACCTCTACCACAAGTGATGGCACGGACACGTCAGCTTCAAGCGACAGTACGGATACATCTACCACAACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCTACCACTACAAGTGATAGCACGGACACGTCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACATCCTCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAACTTCAAGCGATAGTACAGACACGTCGTCTACCAC > AssemblyC74_contig_24/81‑349 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |