| New junction evidence | |||||||||||
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agCTTCAAGCGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCACGGACACATCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATGGCACGGACACGTCAGCTTCAAGCGACAGTACGGa > 1:2441429‑M1/3‑135 (MQ=255) aaCTTCAAGCGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCACGGACACATCAGCTTCAAGTGACa > 2:1533079‑M1/3‑71 (MQ=255) gCTTCAAGCGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCACTGACACATCAGCTTCATGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGAAGGCACGGACACGTCAGCTTCTGGCgtcagttggga < 2:1562563‑M1/133‑6 (MQ=255) aCTTCAAGCGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCACGGATACATCAGCTTCAAGTGACa < 2:619716‑M1/69‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTCAAGCGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATAGCACGGACACATCAGCTTCAAGTGACAGTACAGATACTACCTCTACCACAAGTGATGGCACGGACACGTCAGCTTCAAGCGACAGTACGGAT > AssemblyC74_contig_24/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |