| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 945 total aligned reads displayed.
ACCGTAATTATTGCTAGCAATTTAGAGTAGTTCGTTACTAATTAAGGAGCAAATAA‑AATTATTA‑TAA‑‑TATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTTCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_40/129‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGTTTGGTAATTTAGTGATTTTCTAGGGATATGGTTTCTTTTGGACGCAACGGATGAGATGAATCCTTGATTGACTTGGTTGAATTCCATTTCTTTTGGTAGTCCATCTTTTCGTAGGAGTCCGTTTGAAT > AssemblyC74_contig_45/1‑134 ACCGTAATTATTGCTAGCAATTTAGAGTAGTTCGTTACTAATTAAGGAGCAAATAA‑AATTATTA‑TAA‑‑TATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTTCTCATGGTGT > 2:1670830/1‑135 AATTATTGCTAGCAATTTAGAGTAGTTCGTTACTAATTAAGGAGCAAATAA‑AATTATTA‑TAA‑‑TATTATTTGTCAAATTAAGCGAGACAAAACTTTCCATTTACGTAACTCAAAAAAACTTCTAATGGTGTTTGGT > 2:2589350/1‑135 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AAAAAAACTTCTAATGGTGTTTGGTAATTTAGTGATTTTCTAGGGATATGGTTTCTTTTGGACGCAACGGATGAGATGAATCCTTGATTGACTTGGTTGAATTCCATTTCTTTTGGTAGTCCATCTTTTCGTAGG > 1:2030582/1‑135 AACTTCTAATGGTGTTTGGTAATTTAGTGATTTTCTAGGGATATGGTTTCTTTTGGACGCAACGGATGAGATGAATCCTTGATTGACTTGGTTGAATTCCATTTCTTTTGGTAGTCCATCTTTTCGTAGGAGTCC > 1:1850424/1‑135 AACTTCTAATGGTGTTTGGTAATTTAGTGATTTTCTAGGGATATGGTTTCTTTTGGACGCAACGGATGAGATGAATCCTTGATTGACTTGGTTGAATTCCATTTCTTTTGGTAGTC > 1:100452/1‑116 TAATGGTGTTTGGTAATTTAGTGATTTTCTAGGGATATGGTTTCTTTTGGACGCAACGGATGAGATGAATCCTTGATTGACTTGGTTGAATTCCATTTCTTTTGGTAGTCCATCTTTTCGTAGGAGTCCGTTTGA > 1:1260385/1‑135 TAATGGTGTTTGGTAATTTAGTGATTTTCTAGGGATATGGTTTCTTTTGGACGCAACGGATGAGATGAATCCTTGATTGACTTGGTTGAATTCCATTTCTTTTGGTAGTCCATCTTTTCGTAGGAGTCCGTTTGA < 2:3603796/135‑1 TAATGGTGTTTGGTAATTTAGTGATTTTCTAGGGATATGGTTTCTTTTGGACGCAACGGATGAGATGAATCCTTGATTGACTTGGTTGAATTCCATTTCTTTTGGTAGTCCATCTTTTCGTAGGAGTCCGTTTGA < 1:1422788/135‑1 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AssemblyC74_contig_40/129‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGTTTGGTAATTTAGTGATTTTCTAGGGATATGGTTTCTTTTGGACGCAACGGATGAGATGAATCCTTGATTGACTTGGTTGAATTCCATTTCTTTTGGTAGTCCATCTTTTCGTAGGAGTCCGTTTGAAT > AssemblyC74_contig_45/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |