New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_13 | 1 = | 0 (0.000) | 93 (0.490) | 44/252 | 1.5 | 65.5% | intergenic (–/‑320) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/hypothetical protein |
? | TrimmedAssembly_T66_contig_17 | 66634 = | 98 (0.610) | intergenic (+348/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
AATTGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_13/133‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCG > TrimmedAssembly_T66_contig_17/66634‑66738 AATTGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACG < 1:16167/134‑1 AAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGA > 2:31073/1‑135 AAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGA > 1:1454594/1‑135 AAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGGTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGA > 1:677030/1‑135 AGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AATAAAAGTTGTTGACAAGATATTTATTATGATGTTTTGATGTTTAAGCTGTGTTATTCGTTTTACACACGGAATTAGATC < 1:217150/136‑1 AGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTG > 1:1138126/1‑136 AGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTG > 2:855096/1‑136 AGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTG > 1:2259218/1‑136 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GTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTG > 1:2393777/1‑136 TGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGA < 1:1377740/135‑1 TCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACA > 2:2010648/1‑136 TCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACA > 1:472953/1‑136 TCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACA > 2:1876661/1‑136 CAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATAAATATGTTATGATTATAAAGATGTGTAAAGCGATTAACACACGTAATTAGATATTTGAAAACTGAACAAA > 1:2195725/1‑136 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ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 2:2044896/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 2:2140708/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 2:2151202/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 1:855096/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 1:1108429/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 1:660932/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 1:537939/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 1:1532121/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 1:1581456/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 1:180167/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 1:2015032/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 2:1281248/136‑1 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ATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAG > 2:1369181/1‑136 ATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAG > 1:2258787/1‑136 ATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATT > 2:1853100/1‑91 ATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATT < 1:1853100/91‑1 AAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGG > 2:2341103/1‑135 AAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGG > 2:1420576/1‑135 CTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTG > 2:84379/1‑136 TTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGA > 1:1097690/1‑136 TCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGAT < 2:799466/136‑1 TCTT‑AAAAAAAGATGTTGCCAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCAGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGAT < 2:424642/136‑1 T‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGTTTTT > 1:829239/1‑136 AAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGACCAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGA < 2:898297/136‑1 AAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGA < 1:31073/136‑1 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TATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTT < 1:1748209/135‑1 ATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGC < 2:622617/136‑1 TGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGA < 1:1707778/136‑1 ATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAAT > 1:1608901/1‑135 TGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTC > 2:328530/1‑136 GTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTC > 2:1618742/1‑135 GTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTC > 2:820645/1‑135 GTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTC > 2:2233078/1‑135 GTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTC > 2:1164206/1‑135 TGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTA > 1:1732527/1‑135 GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACTGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC > 2:2027748/1‑136 GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC > 1:1983430/1‑136 GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC > 2:800997/1‑136 GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC > 1:1456306/1‑136 GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC > 1:880259/1‑136 GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC > 1:2429313/1‑136 ATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCa > 2:1625906/1‑135 AAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGAT > 2:1574502/1‑35 GCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGA > 2:1167027/1‑84 GCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGA < 1:1167027/84‑1 ACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 1:1712528/46‑1 ACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT > 1:1971564/1‑46 ACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 2:1971564/46‑1 ACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT > 2:1712528/1‑46 AATTGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTT‑AAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_13/133‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCG > TrimmedAssembly_T66_contig_17/66634‑66738 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |