| New junction evidence | |||||||||||
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tctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTT‑AAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCATAGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCtt > 2:31073‑M1/10‑135 (MQ=255) aattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTT‑AAGAAGTAACTTGAt > 2:1853100‑M1/7‑91 (MQ=255) aattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTT‑AAGAAGTAACTTGAt < 1:1853100‑M1/85‑1 (MQ=255) cGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTT‑AAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCATAGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAAtt < 1:16167‑M1/133‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTT‑AAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCATAGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATT > TrimmedAssembly_T66_contig_13/1‑133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |