| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_13 | 1 = | 0 (0.000) | 93 (0.490) | 44/252 | 1.5 | 65.5% | intergenic (–/‑320) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_17 | 66634 = | 98 (0.610) | intergenic (+348/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 442 total aligned reads displayed.
GAGGCGTTACCGATTATGTTATGATAATAACGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_17/66499‑66738 | gAGGCGTTACCGATTATGTTATGATAATAACGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACg > 2:2333629/1‑136 (MQ=255)gAGGCGTTACCGATTATGTTATGATAATAACGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACg > 1:279153/1‑136 (MQ=255)gAGGCGTTACCGATTATGTTATGATAATAACGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACg > 1:676437/1‑136 (MQ=255) ggCGTTACCGATTATGTTATGATAATAACGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGa > 1:1007734/1‑136 (MQ=255) aattggtaagatagtttctgttgtcgcaacggcaactatgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacg < 1:16167‑M2/1‑1 (MQ=255) ggtaagatagtttctgttgtcgcaacggcaaccacgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTa < 1:564817‑M1/31‑1 (MQ=255) atgttatgATAATAACGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGa > 2:1039618/1‑136 (MQ=255) ctgttgtcgcaacggcaactatgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGaaa > 1:661954‑M2/117‑134 (MQ=255) ctgttgtcgcaacggcaaccacgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGaaa < 1:830555‑M1/42‑1 (MQ=255) tgttgtcgcaacggcaaccacgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGaaa < 2:2298762‑M1/42‑1 (MQ=255) gttgtcgcaacggcaaccacgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTg < 1:1065243‑M1/46‑1 (MQ=255) tataataAATTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTATTAAATATAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGa < 2:2366495/135‑1 (MQ=255) tgtcgcaacggcaactatgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGa < 1:1377740‑M2/23‑1 (MQ=255) tcgcaacggcaactatgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACa > 2:2010648‑M2/111‑136 (MQ=255) tcgcaacggcaactatgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACa > 1:472953‑M2/111‑136 (MQ=255) ataaCGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACaa > 2:1902609/1‑136 (MQ=255) aCGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGa < 1:1255635/122‑1 (MQ=255) aCGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGt > 1:1811121/1‑136 (MQ=255) aCGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGt > 1:1339954/1‑136 (MQ=255) gTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCtt < 1:2264630/117‑1 (MQ=255) gTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGttt < 1:1423085/136‑1 (MQ=255) cggcaactatgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGttt < 2:1856445‑M2/32‑1 (MQ=255) actatgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTcgacg < 1:546122‑M2/37‑1 (MQ=255) aTTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGaa < 2:279153/136‑1 (MQ=255) aTTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGaa < 1:21712/136‑1 (MQ=255) ttCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 2:253206/136‑1 (MQ=255) ttCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 2:1811121/136‑1 (MQ=255) ttCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 2:1572919/136‑1 (MQ=255) atgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacTGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 1:612084‑M2/40‑1 (MQ=255) atgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 1:1211605‑M2/40‑1 (MQ=255) acgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgatttagatgttatgattattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt > 1:1502607‑M1/73‑136 (MQ=255) acgacaaattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt > 2:1497504‑M1/73‑136 (MQ=255) acgacaaattaatcaagttaattattaaaaaaagatgttgacaagatattgattaagatgttatgattattaAGTTGTTTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt > 2:826785‑M1/73‑136 (MQ=255) cATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCa < 2:1424437/136‑1 (MQ=255) aattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGaa < 1:2137846‑M1/28‑1 (MQ=255) aattaatcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGaa > 2:2137846‑M1/67‑94 (MQ=255) aattaataaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAAATGAACAAAGTTTCGACGAATCAAAtg > 2:1264137‑M1/67‑136 (MQ=255) atcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAAtt < 1:1853100‑M2/6‑1 (MQ=255) atcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAg > 2:1369181‑M2/86‑136 (MQ=255) atcaagttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAg > 1:31‑M1/62‑136 (MQ=255) agttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGtc > 1:112586‑M1/58‑136 (MQ=255) agttacttcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGtc > 2:720833‑M1/58‑136 (MQ=255) tcttaaaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGAt < 2:799466‑M2/62‑1 (MQ=255) taaataaaGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAgg > 1:1721458/1‑122 (MQ=255) taaataaaGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTg > 1:1637223/1‑136 (MQ=255) aaataaaGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGa > 2:240948/1‑136 (MQ=255) aaaaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGACCAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGa < 2:898297‑M2/67‑1 (MQ=255) aaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGttt < 2:669741‑M1/56‑1 (MQ=255) aaaagttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGaa < 2:588579‑M1/92‑1 (MQ=255) aaagttgttgacaagatattgattgagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATc > 1:1561138‑M2/67‑136 (MQ=255) agttgttgacaagatattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCaa < 1:1152486‑M2/72‑1 (MQ=255) tgttgCCAATGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGCATAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACAGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAaga < 2:1845575/134‑1 (MQ=255) tattgattaagatgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACAttt < 1:1748209‑M2/85‑1 (MQ=255) tattgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACAttt > 2:632818‑M1/27‑135 (MQ=255) attgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGc < 2:933289‑M1/111‑1 (MQ=255) attgattaagatgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGc > 2:2385810‑M1/26‑136 (MQ=255) tgttatgatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTc > 2:328530‑M2/39‑136 (MQ=255) tgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTc < 1:220629‑M1/122‑1 (MQ=255) tgttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTc < 1:333980‑M1/122‑1 (MQ=255) tgttatgatgattaAGTAGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAAGTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGATACGACGAATCAAATGTGTAGTGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGACAATTc < 1:237687‑M1/122‑1 (MQ=255) gttatgatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTc < 2:1184636‑M1/122‑1 (MQ=255) ttatGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTa > 1:1595351/1‑135 (MQ=255) gatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGc > 1:1456306‑M2/33‑136 (MQ=255) gatgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGc > 1:880259‑M2/33‑136 (MQ=255) gatgattaAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGc < 1:751430‑M1/128‑1 (MQ=255) atgattaagctgtgttaagcgattaacacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAgca > 2:1625906‑M2/32‑135 (MQ=255) aaTAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGc < 2:1604016/131‑1 (MQ=255) aagTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaa > 2:529255‑M1/2‑129 (MQ=255) gTTGTGTTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaatt > 1:633086‑M1/1‑127 (MQ=255) ttGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATGAGATCTTTGAAATCTGAACAATGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGGTTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCgaatatttgt > 2:469493‑M1/1‑126 (MQ=255) tgtgTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaatttt > 1:2426547‑M1/1‑125 (MQ=255) gtgtTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaatttta < 1:794399‑M1/136‑13 (MQ=255) gtTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttag < 1:2066193‑M1/135‑14 (MQ=255) gtTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttag < 2:2075003‑M1/135‑14 (MQ=255) gtTAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttag < 2:226295‑M1/135‑14 (MQ=255) gtTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttag < 1:2353051‑M1/135‑14 (MQ=255) ttAAGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagt > 1:1906737‑M1/1‑121 (MQ=255) ttAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCgaataaattttagt > 1:2241825‑M1/1‑121 (MQ=255) tAAGCGATTAACGCATGGACTTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtac > 1:1992103‑M1/1‑120 (MQ=255) tAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtac > 2:1943658‑M1/1‑120 (MQ=255) tAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTCGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtac > 2:1320237‑M1/1‑120 (MQ=255) aGCGATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaa > 1:1085332‑M1/1‑118 (MQ=255) gATTAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaatat > 1:1586247‑M1/1‑115 (MQ=255) ttAACGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaatatta < 2:85219‑M1/136‑24 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaatttttgtacaacattaaat > 1:2110882‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat > 1:2318220‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat > 1:942938‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat > 2:219346‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat < 2:42500‑M1/133‑27 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat > 1:720030‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat > 2:618209‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat > 2:1763954‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacgGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaacattaaat > 1:1965320‑M1/4‑110 (MQ=255) acacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt < 2:1971564‑M2/40‑1 (MQ=255) acacacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAt > 2:1712528‑M2/7‑46 (MQ=255) aCGCATGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCATAACATTTGCGAAGTAAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaatattatat > 2:1161947‑M1/1‑110 (MQ=255) aCGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCgaataaattttagtacaacattaaat < 2:2232779‑M1/136‑27 (MQ=255) aCGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCgaataaattttagtacaacattaaat < 1:2404128‑M1/136‑27 (MQ=255) ACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGaa > 1:593010‑M1/1‑45 (MQ=255) acaCGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCaaataaattttagtacaaaattaaatga > 1:760476‑M1/2‑108 (MQ=255) | GAGGCGTTACCGATTATGTTATGATAATAACGTTTCAAATTCATTTGCATAGTTATTCAACTTCTTAAATAAAGTTGTTGACAAGGAAATGATGAAATGATATTATGTAATAGTTGTGTTAAGCGATTAACGCACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_17/66499‑66738 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |