| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_37 | 1 = | 0 (0.000) | 169 (0.600) | 63/258 | 0.3 | 100% | intergenic (–/+9) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Mobile element protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_8 | = 137664 | 0 (0.000) | intergenic (‑2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Histidinol‑phosphate aminotransferase (EC 2.6.1.9)/– | |||||
Only 100 of 384 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGTTCAATA > TrimmedAssembly_T66_contig_37/1‑136 | tattttctgcatcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAg < 2:192878‑M2/2‑1 (MQ=255)cattaagccttcgaatttcacatggtcattaggcatcgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAg > 2:278448‑M1/135‑136 (MQ=255)cattaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAg > 1:2343541‑M1/135‑136 (MQ=255) attttctgcatcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttata > 1:100214‑M2/134‑134 (MQ=255) attaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGa < 2:90716‑M1/3‑1 (MQ=255) attaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGa < 2:1456806‑M1/3‑1 (MQ=255) attaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGa < 1:2019890‑M1/3‑1 (MQ=255) cttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGtt < 1:73367‑M1/10‑1 (MQ=255) cttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGtt < 1:853093‑M1/10‑1 (MQ=255) atcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGttt < 1:1019010‑M2/11‑1 (MQ=255) cattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTaaa > 2:1870191‑M2/123‑136 (MQ=255) agttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTaaaa < 2:2175093‑M1/15‑1 (MQ=255) agttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTaaaa < 2:326672‑M1/15‑1 (MQ=255) agttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTaaaa < 2:526468‑M1/15‑1 (MQ=255) atggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAATATCTCTTGa < 2:1428096‑M1/23‑1 (MQ=255) atggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGa < 1:1047906‑M1/23‑1 (MQ=255) tggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGag > 2:2019890‑M1/113‑136 (MQ=255) atttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGa > 1:338538‑M2/113‑135 (MQ=255) tttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGag < 2:1012409‑M2/24‑1 (MQ=255) ggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGagc > 2:2095822‑M1/112‑136 (MQ=255) tggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTaaaaaa < 2:364938‑M1/40‑1 (MQ=255) ggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTaaaaaa < 2:2229574‑M1/40‑1 (MQ=255) cactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTaaa < 2:1759103‑M1/46‑1 (MQ=255) cactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcggtggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCACTACTAAAAAAGCTaaa < 2:837374‑M1/46‑1 (MQ=255) ctgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAAt > 1:1941858‑M1/89‑136 (MQ=255) atctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAAt < 1:1423030‑M2/48‑1 (MQ=255) atctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAAt < 1:228989‑M2/48‑1 (MQ=255) atctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttatttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAAt < 1:1143448‑M2/48‑1 (MQ=255) ttaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGAcc < 2:1697154‑M1/52‑1 (MQ=255) ttaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGAcc < 1:2429038‑M1/52‑1 (MQ=255) ttaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAAAACTAAAAAAGCTAAAAAGAcc < 1:1163354‑M1/52‑1 (MQ=255) ttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGAcc > 2:2434158‑M2/85‑136 (MQ=255) taattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCa < 1:684115‑M1/53‑1 (MQ=255) caaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCAttt < 1:151009‑M2/56‑1 (MQ=255) aaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTg > 2:2298479‑M2/80‑136 (MQ=255) aaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTg > 1:807913‑M2/80‑136 (MQ=255) gccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTga > 2:671849‑M1/79‑136 (MQ=255) gccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTga > 1:96392‑M1/79‑136 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttctcttactactctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:45070‑M2/59‑1 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:132768‑M2/59‑1 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatatcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:1372248‑M2/59‑1 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 2:773659‑M1/77‑135 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:26132‑M1/77‑135 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:1697154‑M1/77‑135 (MQ=255) ctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgacg > 2:1257883‑M2/75‑134 (MQ=255) cccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgacgac < 1:2213577‑M1/62‑1 (MQ=255) cccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgacg < 1:917147‑M1/60‑1 (MQ=255) ctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttcttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACt > 2:1317469‑M2/74‑136 (MQ=255) cctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAACAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTa < 2:918668‑M1/64‑1 (MQ=255) tcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAgt > 1:2154318‑M1/71‑136 (MQ=255) gtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAgtgt > 2:2275924‑M2/69‑136 (MQ=255) tttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATTACCATTTGACGACTAGTGTTAAGtt > 1:2303769‑M2/63‑136 (MQ=255) tttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGtt > 1:157295‑M2/63‑136 (MQ=255) tttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGtt > 2:1360528‑M2/63‑136 (MQ=255) tttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGtt > 2:615836‑M2/63‑136 (MQ=255) tttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACATGTTTAATATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTTACGACTAGTGTTAAGtt > 1:748803‑M2/63‑136 (MQ=255) tctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTaaa > 1:1651433‑M2/56‑101 (MQ=255) ttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACaa > 1:1885157‑M2/52‑136 (MQ=255) 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tagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTa > 1:1759103‑M1/24‑136 (MQ=255) acctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCtt > 1:1213116‑M1/20‑40 (MQ=255) acctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGAACATATTACGACAAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATATTTCCAGAGACGGCGCAATTTAACTAACCa < 1:63796‑M1/117‑1 (MQ=255) ctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAgaga > 2:1571467‑M1/18‑114 (MQ=255) ctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCa < 1:1617837‑M1/117‑1 (MQ=255) tggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTg < 2:1209046‑M2/121‑1 (MQ=255) 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ctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGa < 1:413975‑M2/126‑1 (MQ=255) ctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGa < 1:2243950‑M2/126‑1 (MQ=255) ttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATc > 1:1790637‑M2/9‑136 (MQ=255) ttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATc > 1:893525‑M2/9‑136 (MQ=255) ttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGt > 2:2358324‑M2/7‑136 (MQ=255) tttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGtt < 1:1802390‑M2/131‑1 (MQ=255) tttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGtt < 1:2039185‑M2/131‑1 (MQ=255) ggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGtt > 2:2144478‑M1/6‑136 (MQ=255) ggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGtt > 2:1794344‑M1/6‑136 (MQ=255) ttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGTTc > 2:981485‑M2/5‑136 (MQ=255) aGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGTTCaata < 1:287750/136‑1 (MQ=255) aGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGTTCaata < 1:574310/136‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGTTCAATA > TrimmedAssembly_T66_contig_37/1‑136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |