| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_18 | 1 = | 0 (0.000) | 220 (0.730) | 69/260 | 0.2 | 100% | intergenic (–/+69) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_34 | = 1203 | 0 (0.000) | intergenic (+58/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Mobile element protein/– | |||||
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
CAAGTTAAATGCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_18/133‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAAGGTATCTT < TrimmedAssembly_T66_contig_34/1203‑1069 AAATGCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTG > 2:1729263/1‑136 AAATGCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTG > 1:1407124/1‑136 AATGCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGATAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGT < 2:1527172/136‑1 GCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAA < 1:1119470/136‑1 GCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAA < 1:511977/136‑1 GCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAA < 1:479049/136‑1 TTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAG < 1:1646158/136‑1 TCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGT > 1:119929/1‑136 TCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAG > 1:428422/1‑135 TCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTGTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGT > 2:271093/1‑136 CATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACA < 2:1645756/136‑1 CATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACA < 1:86542/136‑1 CATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACA < 1:291525/136‑1 ACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAAGCAAGTGCAACACTAAGA > 2:941082/1‑136 CCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAA < 1:252668/136‑1 CCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAA < 1:1119815/136‑1 CCTGAGTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAA < 1:2017639/136‑1 CTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATACTTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAAT < 1:2067296/136‑1 CTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAAT < 1:327995/136‑1 ACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCT < 1:1048627/136‑1 CGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTT < 2:2457132/136‑1 GACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTA < 1:987784/136‑1 GACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTA < 1:1696057/136‑1 GACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTA < 2:2126579/136‑1 CCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAATAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAG < 1:2192649/135‑1 CCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAG < 2:179376/135‑1 CACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAA > 1:82466/1‑136 CACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAA > 1:2105539/1‑136 CACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAA > 2:1636008/1‑136 CTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGG > 2:2315493/1‑135 CTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGG > 1:2431846/1‑135 CTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGG > 1:1211208/1‑135 CTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGG > 1:2029590/1‑135 CTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGG > 1:1957949/1‑135 GGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTT > 1:64885/1‑136 GGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGT < 2:283708/135‑1 GGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGT < 2:616986/135‑1 GTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTT > 2:107330/1‑135 CCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCT < 2:1439090/136‑1 CGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTA < 1:1484428/136‑1 tATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCACTCAATTGTCAAATCAAGTTCAACACTAAGAATCAATTCTTAGAAGAGGTCTAGTTGCTca > 1:2297945/2‑134 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:377204/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:1439421/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:1435375/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:568690/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:1901933/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:1289529/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:768/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:794782/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:2377871/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGT < 1:446886/125‑1 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGT > 2:446886/1‑125 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCT > 1:2304262/1‑115 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTATTATAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:2255683/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACA > 1:955302/1‑100 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAA < 1:1325964/92‑1 TAAGTGAACACGCGTTAACTTAAAAGTCGTGCTTTCAGGCTTAAATTCTGAGAGCACGGCTTGTAATTTGTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGGCTAGTTGCTAt > 2:2228/1‑133 ATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGTATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTAAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTATTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTA > 2:1843754/1‑136 ATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTA > 2:87500/1‑136 TTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAG < 2:1604479/136‑1 TTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAG < 2:1479042/136‑1 TTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAG < 1:684882/136‑1 ACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCA < 1:1827992/136‑1 ACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCA < 2:2029590/136‑1 ACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCA < 2:1271497/136‑1 TAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTA < 2:42798/135‑1 TAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTA < 2:1736069/135‑1 TTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCG > 2:374941/1‑136 AAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTCAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTG < 1:489267/136‑1 AAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTG < 2:1980438/136‑1 TCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGC > 1:1548422/1‑136 CGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCA < 1:1636008/136‑1 GTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAG < 1:1539597/136‑1 GTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAG < 2:43216/136‑1 TTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGAT > 1:557153/1‑136 TTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGAT > 1:2075126/1‑136 TTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGAT > 2:2519766/1‑136 TTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGAT > 2:1323860/1‑136 ATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCTATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTC < 2:1146844/134‑1 ATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGAT > 2:771132/1‑114 TTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAAT < 2:1828160/136‑1 GAGCGCGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTA > 1:2174850/1‑135 GAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCT > 2:1369317/1‑62 GAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCT < 1:1369317/62‑1 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGC < 1:1729263/135‑1 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGC < 1:936186/135‑1 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGC < 1:124137/135‑1 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGC < 2:1211233/135‑1 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGC < 1:2315493/135‑1 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTACAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGC < 2:2410170/135‑1 GACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGAGCAACACTAAGACTCTATTCATAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTACAATGACCGCCGTAGCCGGTT < 2:1252904/136‑1 CTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGT < 1:315785/136‑1 TTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTT < 2:2389405/136‑1 TTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTT < 1:1772122/136‑1 TTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTT < 1:1829778/136‑1 TTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTA < 2:1407124/136‑1 ATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAAGG > 2:390645/1‑136 ATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAAGG > 1:539595/1‑136 TTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAAGGTA < 2:2302019/136‑1 TTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAAGGTA < 1:56636/136‑1 CAAGTTAAATGCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_18/133‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAAGGTATCTT < TrimmedAssembly_T66_contig_34/1203‑1069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |