| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_18 | 1 = | 0 (0.000) | 220 (0.730) | 69/260 | 0.2 | 100% | intergenic (–/+69) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_34 | = 1203 | 0 (0.000) | intergenic (+58/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Mobile element protein/– | |||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGCATTTAACTTGG > TrimmedAssembly_T66_contig_18/1‑134 | aagataccttaaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggg < 2:123223‑M1/1‑1 (MQ=255) taccttaaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGaaaa < 1:56636‑M1/5‑1 (MQ=255) taccttaaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGaaaa < 2:2302019‑M1/5‑1 (MQ=255) ccttaaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAAt > 1:539595‑M1/130‑136 (MQ=255) ccttaaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAAt > 2:390645‑M1/130‑136 (MQ=255) taaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTaa < 2:1407124‑M1/10‑1 (MQ=255) aaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTaaa < 2:2389405‑M1/11‑1 (MQ=255) aaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTaaa < 1:1829778‑M1/11‑1 (MQ=255) aaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTaaa < 1:1772122‑M1/11‑1 (MQ=255) aaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTaaa < 2:515121‑M1/11‑1 (MQ=255) acaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAg < 1:315785‑M1/13‑1 (MQ=255) accggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCg < 1:681610‑M1/16‑1 (MQ=255) gctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGc < 2:1211233‑M1/19‑1 (MQ=255) gctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGc < 1:2315493‑M1/19‑1 (MQ=255) gctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGc < 1:124137‑M1/19‑1 (MQ=255) gctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGc < 1:936186‑M1/19‑1 (MQ=255) gctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGc < 1:1729263‑M1/19‑1 (MQ=255) tacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGCGctc > 1:2174850‑M1/115‑135 (MQ=255) attgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTaa < 2:1828160‑M1/32‑1 (MQ=255) attgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTaa < 1:497467‑M1/32‑1 (MQ=255) tgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAAt < 1:513230‑M1/33‑1 (MQ=255) gaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaatagaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAAt < 2:1146844‑M1/33‑1 (MQ=255) atcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGaaa > 2:2519766‑M1/97‑136 (MQ=255) atcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGaaa > 1:557153‑M1/97‑136 (MQ=255) atcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGaaa > 2:1836058‑M1/97‑136 (MQ=255) atcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGaaa > 2:1323860‑M1/97‑136 (MQ=255) atcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGaaa > 1:2075126‑M1/97‑136 (MQ=255) atcgctgcccagccgatctaatgccagaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGaaa > 2:2194976‑M1/97‑136 (MQ=255) ctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCAc < 2:43216‑M1/44‑1 (MQ=255) ctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCAc < 1:1539597‑M1/44‑1 (MQ=255) tgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACg < 1:1636008‑M1/45‑1 (MQ=255) gcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGa > 1:1548422‑M1/91‑136 (MQ=255) cagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACtt < 2:1980438‑M1/49‑1 (MQ=255) atctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAAt > 2:771132‑M1/82‑114 (MQ=255) taatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTtttaattta < 2:1736069‑M1/57‑1 (MQ=255) taatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTtttaattta < 2:42798‑M1/57‑1 (MQ=255) tgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCgtgt < 2:2029590‑M1/65‑1 (MQ=255) tgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCgtgt < 1:1827992‑M1/65‑1 (MQ=255) ctagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCaa < 2:1604479‑M1/69‑1 (MQ=255) tagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAAt < 2:1035948‑M1/70‑1 (MQ=255) tagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAAt > 2:87500‑M1/67‑136 (MQ=255) tagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAAt < 2:1435375‑M1/70‑1 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTa > 2:1254418‑M1/63‑134 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:685117‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:768‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:794782‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:962701‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:1722916‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:2208161‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:1289529‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:1435375‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:1439421‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:203003‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:2377871‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:1875035‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:408594‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttataataatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:2255683‑M1/63‑136 (MQ=255) tgagcaactagacctcttctaagaattgattcttagtgttgaacttgatttgacaattgagtGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTata > 1:2297945‑M1/63‑135 (MQ=255) tagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCg < 1:1484428‑M1/75‑1 (MQ=255) actagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGAcc < 1:2468703‑M1/79‑1 (MQ=255) actagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGAcc < 2:283708‑M1/79‑1 (MQ=255) actagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGAcc < 2:616986‑M1/79‑1 (MQ=255) accacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc < 1:446886‑M1/74‑1 (MQ=255) accacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:446886‑M1/52‑125 (MQ=255) ccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAg > 1:1957949‑M1/51‑135 (MQ=255) ccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAg > 1:1211208‑M1/51‑135 (MQ=255) ccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAg > 2:2315493‑M1/51‑135 (MQ=255) ttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTg > 1:2105539‑M1/47‑136 (MQ=255) ttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTg > 2:1636008‑M1/47‑136 (MQ=255) ttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTg > 1:82466‑M1/47‑136 (MQ=255) ctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTgg < 2:179376‑M1/91‑1 (MQ=255) ctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTgg < 2:2403245‑M1/91‑1 (MQ=255) taagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTc < 2:2126579‑M1/93‑1 (MQ=255) taagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTc < 1:1696057‑M1/93‑1 (MQ=255) aagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCg < 2:2457132‑M1/94‑1 (MQ=255) agaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGctc > 2:1369317‑M1/42‑62 (MQ=255) agaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGctc < 1:1369317‑M1/21‑1 (MQ=255) agaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:2304262‑M1/42‑115 (MQ=255) agaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGt < 1:1048627‑M1/95‑1 (MQ=255) agaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAAGTATCGGACCACATAGACGTGGTCGt < 2:1441512‑M1/95‑1 (MQ=255) attcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAg < 1:327995‑M1/102‑1 (MQ=255) attcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAAGTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAg < 1:2067296‑M1/102‑1 (MQ=255) ttcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGACTCAgg < 1:2017639‑M1/103‑1 (MQ=255) ttcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAgg < 1:252668‑M1/103‑1 (MQ=255) ttcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAgg < 1:1119815‑M1/103‑1 (MQ=255) tcttagtgttgcacttgctttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGt > 2:941082‑M1/33‑136 (MQ=255) cttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTc < 2:318496‑M1/105‑1 (MQ=255) tgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATg < 2:1636839‑M1/110‑1 (MQ=255) tgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATg < 1:291525‑M1/110‑1 (MQ=255) acttgatttgacaattgaggGAACAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGa > 2:271093‑M1/21‑136 (MQ=255) acttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGa > 1:946103‑M1/21‑136 (MQ=255) acttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGa > 1:119929‑M1/21‑136 (MQ=255) cttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGaa < 1:1646158‑M1/117‑1 (MQ=255) cttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGa > 1:428422‑M1/20‑135 (MQ=255) ttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc < 1:1325964‑M1/74‑1 (MQ=255) ttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGc < 1:479049‑M1/123‑1 (MQ=255) ttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGc < 1:1119470‑M1/123‑1 (MQ=255) acaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTATCGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGCAtt < 2:1527172‑M1/126‑1 (MQ=255) caattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGCAttt > 1:1407124‑M1/10‑136 (MQ=255) gAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAAATTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGCATTTAACTTgg < 1:893944/134‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGCATTTAACTTGG > TrimmedAssembly_T66_contig_18/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |