| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_21 | = 29409 | 0 (0.000) | 164 (0.590) | 58/260 | 0.9 | 100% | intergenic (‑1/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_37 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+9) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Mobile element protein | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_21/29276‑29409‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGT > TrimmedAssembly_T66_contig_37/1‑130 TATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTAG < 2:735326/136‑1TATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTAG < 2:2305806/136‑1TATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTAG < 2:1637346/136‑1 ATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTAGA > 1:1033783/1‑136 ATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTAGA < 1:221505/136‑1 ATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGTTTCTCTTTATAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTAGAACCTGTTT < 1:1839550/135‑1 ATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTAGAACCTGTTT < 1:1115516/135‑1 ATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTAGAACCTGTTT < 2:2078317/135‑1 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< 2:260921/136‑1 TCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTA < 1:1694147/136‑1 TCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTA < 2:140284/136‑1 TCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTA < 1:1352166/136‑1 TCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGAATAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTA < 2:296849/136‑1 CTAATTGGTTCTTTTTTTTTAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACC > 2:2195652/1‑136 AATTGGTTCTTTTTTTTTAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAA < 1:2535473/136‑1 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TTTTTTAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGT > 1:2372121/1‑136 TATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_21/29276‑29409‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGT > TrimmedAssembly_T66_contig_37/1‑130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |