| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_21 | = 29409 | 0 (0.000) | 164 (0.590) | 58/260 | 0.9 | 100% | intergenic (‑1/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_37 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+9) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Mobile element protein | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_21/29276‑29409 | tATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTag < 2:735326‑M1/136‑3 (MQ=255)tATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTag < 2:2305806‑M1/136‑3 (MQ=255)tATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTag < 2:1637346‑M1/136‑3 (MQ=255) aTTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTaga > 1:1033783‑M1/1‑133 (MQ=255) aTTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTaga < 1:221505‑M1/136‑4 (MQ=255) atcatTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGTTTCTCTTTATAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgttt < 1:1839550‑M1/135‑12 (MQ=255) atcatTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgttt < 1:1115516‑M1/135‑12 (MQ=255) atcatTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgttt < 2:2078317‑M1/135‑12 (MQ=255) atcatTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgttt < 1:400609‑M1/135‑12 (MQ=255) atcatTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgttt < 1:266233‑M1/135‑12 (MQ=255) atcatTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgttt < 1:2253841‑M1/135‑12 (MQ=255) atcatTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtgta > 1:949088‑M1/1‑124 (MQ=255) atcatTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTACTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgttt < 1:1162048‑M1/135‑12 (MQ=255) ttcattGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaat < 2:1083780‑M1/136‑17 (MQ=255) attGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctc < 2:1421854‑M1/136‑20 (MQ=255) ggATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacatgtttaaaatctcttg > 2:2503263‑M1/1‑114 (MQ=255) atttttaatttttaAATCTGTATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTataacatttttaaaatctcttga > 2:847351‑M1/1‑112 (MQ=255) atttttaatttttaAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgag < 2:1780196‑M1/135‑25 (MQ=255) tttttaatttttatATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATATTGTGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgag < 1:923026‑M1/135‑25 (MQ=255) tttaatttttaaATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcag < 2:2005514‑M1/136‑28 (MQ=255) ttaaATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatacta < 2:1154180‑M1/136‑36 (MQ=255) taaATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaa > 1:827691‑M1/1‑100 (MQ=255) tCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaa < 2:2484533‑M1/136‑41 (MQ=255) aTCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaat < 1:2563316‑M1/136‑49 (MQ=255) aTCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaat < 1:2420763‑M1/136‑49 (MQ=255) tttAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatga > 1:443467‑M1/1‑85 (MQ=255) aaCAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccat < 2:1089026‑M1/136‑55 (MQ=255) aaCAAAGTCTTTGAGATTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccat < 1:278992‑M1/136‑55 (MQ=255) cAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccattt < 1:572322‑M1/136‑57 (MQ=255) aaaGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttg > 1:2220207‑M1/1‑79 (MQ=255) aaaGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttg > 2:1442694‑M1/1‑79 (MQ=255) aaaGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccattt < 2:216126‑M1/135‑57 (MQ=255) tttctTTGAGTTTATTTTGGGTTATCTTACTAATCTCTTCTTTAACCTTTTCCTTCTCTTATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaatctaaaatgaccatttgac < 2:748985‑M1/134‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactcaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:1803176‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagcttaaatgaccatttgac < 1:1342594‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:2279534‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:332277‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:1734231‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:2333855‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:200676‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:1358110‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:1700291‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:1837790‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACAATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:146376‑M1/136‑60 (MQ=255) cTTTGAGTTTCGTTTGGGTTCTCGTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTGTTagatcctgtttgatatctcttgagcagctatactaaaaaagctaaaatgacctttggacgtc > 2:282981‑M1/1‑74 (MQ=255) cTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacg > 1:2166594‑M1/1‑74 (MQ=255) cTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacg > 2:14089‑M1/1‑74 (MQ=255) cTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacg > 2:615943‑M1/1‑74 (MQ=255) cTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacg > 2:133972‑M1/1‑74 (MQ=255) ttGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgacta < 2:950381‑M1/136‑65 (MQ=255) ttGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgacta < 2:59986‑M1/136‑65 (MQ=255) ttGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac > 1:1525708‑M1/1‑72 (MQ=255) aTTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaag < 1:2417678‑M1/136‑73 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaacatttgacgactagtgttaagtt > 2:790223‑M1/1‑62 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATGTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTATTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcactactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgcctcgtgttacgtt > 2:179791‑M1/1‑62 (MQ=255) ttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatacaaaaaaagctaaaatgacaatttgacgactagtgttaagttt > 2:2446741‑M1/1‑61 (MQ=255) tACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaat > 2:769385‑M1/1‑50 (MQ=255) tACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaat > 1:670679‑M1/1‑50 (MQ=255) tACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTAagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatatgacgactagtgttaagttgaagttcacaat > 1:2238180‑M1/1‑50 (MQ=255) aTCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaattttt > 2:150150‑M1/1‑45 (MQ=255) ctctTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaaaactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttcca > 2:1534166‑M1/1‑43 (MQ=255) ttcttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagag > 2:1220049‑M1/1‑40 (MQ=255) ttcttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagag > 2:2379147‑M1/1‑40 (MQ=255) ttcttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagag > 1:376773‑M1/1‑40 (MQ=255) ttcttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagag > 2:1721677‑M1/1‑40 (MQ=255) tcttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagaga < 1:1742556‑M1/136‑98 (MQ=255) tcttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagaga < 2:2173890‑M1/136‑98 (MQ=255) tcttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagaga < 1:1367067‑M1/136‑98 (MQ=255) tatttaaCCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagaagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagttttaatttgacgttcacaatttttccagaga < 2:1598996‑M1/134‑98 (MQ=255) cttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagac > 2:1269955‑M1/1‑38 (MQ=255) cttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagac > 1:513910‑M1/1‑38 (MQ=255) cttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagac > 1:220895‑M1/1‑38 (MQ=255) cttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagac > 2:2194870‑M1/1‑38 (MQ=255) ctgtaacCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagac > 1:1015605‑M1/4‑38 (MQ=255) ttAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacg > 1:1405679‑M1/1‑36 (MQ=255) ttAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacg > 2:523663‑M1/1‑36 (MQ=255) ttAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaag < 1:1572537‑M1/108‑73 (MQ=255) aCCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcga < 2:137708‑M1/136‑104 (MQ=255) ccATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgac > 1:1269479‑M1/1‑32 (MQ=255) tttCAAACTCTAATTTGTTATTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatt < 2:635957‑M1/136‑108 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacattta > 1:71935‑M1/1‑25 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacattta > 2:1493227‑M1/1‑25 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacattta > 1:1903334‑M1/1‑25 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccat > 1:2403860‑M1/1‑25 (MQ=255) aTCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatct < 1:939299‑M1/136‑113 (MQ=255) aTCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatct < 2:260921‑M1/136‑113 (MQ=255) aTCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatct < 1:1442694‑M1/136‑113 (MQ=255) tctcTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatcta < 1:1352166‑M1/136‑114 (MQ=255) tctcTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatcta < 2:140284‑M1/136‑114 (MQ=255) tctcTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatcta < 1:1694147‑M1/136‑114 (MQ=255) tctcTAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgaatagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatcta < 2:296849‑M1/136‑114 (MQ=255) ctAATTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaacc > 2:2195652‑M1/1‑20 (MQ=255) aaTTGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaa < 1:2535473‑M1/136‑119 (MQ=255) ttGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaact < 2:700097‑M1/136‑121 (MQ=255) ttGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaaggtgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaacca > 1:723293‑M1/1‑16 (MQ=255) tGGTTCTTTTTTTTTagaacctgtttataatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactg < 2:390482‑M1/136‑122 (MQ=255) cTTTTATTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactgaaaga < 1:2128464‑M1/136‑127 (MQ=255) ttttttttagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactgaaagatc > 1:2018406‑M1/1‑8 (MQ=255) tttttttagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactgaaagatcg > 1:2513928‑M1/1‑7 (MQ=255) ttttttagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactgaaagatcgt > 1:2372121‑M1/1‑6 (MQ=255) | TATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_21/29276‑29409 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |