| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_13 | 1 = | 0 (0.000) | 129 (0.580) | 56/254 | 0.7 | 71.1% | intergenic (–/‑320) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_17 | 66634 = | 105 (0.580) | intergenic (+348/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TAATTGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_13/134‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC‑‑‑G > TrimmedAssembly_T66_contig_17/66634‑66738 TAATTGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGG > 1:2168892/1‑136 ATTGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAA > 1:531495/1‑136 ATTGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCATAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAA < 1:2463191/136‑1 TGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATT < 2:2646057/136‑1 TGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATT < 1:306585/136‑1 TGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATT < 1:306538/136‑1 TGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATT < 1:2187411/136‑1 GGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTA > 2:1198274/1‑136 GTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAG > 1:2543297/1‑136 AAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGA > 2:469678/1‑135 AGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTG > 2:2849435/1‑136 AGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTG > 2:1118169/1‑136 ttaTGTTGTCGCAACGGCAACTATGAAAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGA < 2:1782026/131‑1 TTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGA < 1:1445482/134‑1 TTCTGATGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGA < 1:577061/134‑1 CTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAA > 1:2501077/1‑134 GTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAATCTG < 2:1994474/136‑1 GTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTG < 2:2038758/136‑1 GTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTG > 2:813486/1‑136 GTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTG > 2:1164240/1‑136 GTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTG < 2:381574/136‑1 TGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGA < 2:764469/135‑1 TGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGA < 2:614525/135‑1 TCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACA > 2:259135/1‑136 TCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACA > 2:2217359/1‑136 TCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACA > 1:1208279/1‑136 TCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACA > 1:2832830/1‑136 TCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACA > 1:776185/1‑136 CAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAG > 2:970063/1‑136 CAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAG > 2:744664/1‑136 cgtCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTT < 1:643200/133‑1 CGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTT < 2:492747/136‑1 CGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTT < 2:1493042/136‑1 CGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTT < 2:1882886/136‑1 CGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTT < 2:1882925/136‑1 CGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTT < 1:564607/136‑1 CGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTT < 1:439375/136‑1 CGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTT < 2:776185/136‑1 AACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGAC < 1:49777/136‑1 AACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGAC > 2:165317/1‑136 AACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGA < 1:1774591/135‑1 TATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAA < 1:1170023/136‑1 TATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAA < 2:1347420/136‑1 TATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAA < 1:2606921/136‑1 TATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACAGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAA < 1:773198/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAATTTGTTGAAAAGATATTTATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 2:1520979/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGTTTAACACACGGAATTAGATCTTTGATAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 1:1106769/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 2:984428/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 1:2645815/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 2:2663998/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 1:2266204/136‑1 ATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 2:1241923/136‑1 GACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCA < 1:226212/136‑1 GACAAATTAATCAACTTACATCTTAAAACAAGTTGTTCACAAGATATAGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTACGACGAATCA < 2:1931167/136‑1 AATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATG > 2:2715142/1‑136 AATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATG > 1:1403981/1‑136 AATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTT > 2:2051921/1‑122 AATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTT < 1:2051921/122‑1 ATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGT < 1:351302/136‑1 TAAACAAGTTACTTCATAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGT < 1:2835868/136‑1 AATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTA > 1:183959/1‑136 TCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGA > 1:988518/1‑100 ACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTT > 1:278520/1‑136 TCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGAT > 2:532428/1‑136 TCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTA < 1:2231732/124‑1 TCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTA > 2:2231732/1‑124 TTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTT > 2:1932381/1‑136 AAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGA < 2:1403894/136‑1 AAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGA < 2:1216369/136‑1 AAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGA < 2:10562/136‑1 AAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAAT < 2:626514/136‑1 AAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAAT < 2:626517/136‑1 AAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAA > 2:2310569/1‑135 TGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAG < 2:1898538/136‑1 tagTGATTAAGATCTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGAACATTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGACCCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTG < 2:500040/133‑1 TATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTG < 1:1932381/136‑1 ATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGC < 2:1134134/136‑1 GATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAA > 1:2536112/1‑136 GATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAA > 1:2767377/1‑136 AAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCA > 1:796064/1‑136 TGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTC > 1:1156772/1‑136 TGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTC > 1:2131497/1‑136 TGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTC < 1:2157320/136‑1 TGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTC > 1:751428/1‑136 TGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTC < 1:268039/136‑1 TGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAAT > 1:741383/1‑134 TGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGAGTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATTTGTAGGGTCTCATGATTGTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGACAATaa > 2:955935/1‑134 GTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTC > 2:268039/1‑135 TTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTC > 2:2482211/1‑134 GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC > 1:1453384/1‑136 GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC > 1:1633863/1‑136 GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC > 1:507249/1‑136 GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC > 1:555553/1‑136 GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC > 1:857194/1‑136 GATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC > 2:2018139/1‑136 ATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCa > 1:2176240/1‑135 ATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCa > 1:989385/1‑135 ATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCGTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGCacat > 1:2281021/1‑132 AAGCTGTGTTAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTA > 2:2023458/1‑75 TAAGCGATTAACACACGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAAT < 2:2569749/56‑1 TAATTGGTAAGATAGTTTCTGTTGTCGCAACGGCAACTATGACAAATTAATCAAGTTACTTCTTAAAAAAAGTTGTTGACAAGATATTGATTAAGATGTTATGATGATTAAGCTGTGTTAAGCGATTAACACAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_13/134‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacGGAATTAGATCTTTGAAAACTGAACAAAGTTTCGACGAATCAAATGTGTAGGGTCTCTTGATTTTGAATCAAGAGCAAAACATTTGCGAAGTCAATTCGCTAGC‑‑‑G > TrimmedAssembly_T66_contig_17/66634‑66738 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |