| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_17 | 66634 = | 105 (0.580) | intergenic (+348/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCATAGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTA > TrimmedAssembly_T66_contig_13/1‑134 | atgtgctagcgaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaacgatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAat > 1:2281021‑M1/109‑136 (MQ=255) tgctagcgaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAatcat > 1:989385‑M1/106‑136 (MQ=255) tgctagcgaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAatcat > 1:2176240‑M1/106‑136 (MQ=255) gctagcgaattgacttcgcaaatgttttgctcttgattcaaaatcaagagaccctacacatttgattcgtcgaaactttgttcagttttcaaagatctaattccGTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAatcatc > 2:2018139‑M1/105‑136 (MQ=255) 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(MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGTGTTAATCGCTTAACACAGCTTAATCATCATAACATCTTAATCAATATCTTGTCAACAACTTTTTTTAAGAAGTAACTTGATTAATTTGTCATAGTTGCCGTTGCGACAACAGAAACTATCTTACCAATTA > TrimmedAssembly_T66_contig_13/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |