New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2571158 = | 38 (0.760) | 4 (0.080) | 4/322 | NT | 10.2% | coding (1279/1311 nt) | dctA‑III | C4‑dicarboxylate transport protein |
? | AE015451 | 2571261 = | 34 (0.710) | coding (1176/1311 nt) | dctA‑III | C4‑dicarboxylate transport protein |
CACGGTTACCGCTTCGCGCAGGCTGGGGCGGCTGATGCCCAGTTGTTCGGCCAGTTCGCGCTGGCCTGGCAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGCCGATACCCATGAACCAGTCCACCGCCAGCACCAGTACCAGGCCAACCACAGGGATCGCCGGTACCGCAGTCAGGGTGGCGGCAAGAATCACCAGT > AE015451/2570924‑2571384 | cACGGTTACCGCTTCGCGCAGGCTGGGGCGGCTGATGCCCAGTTGTTCGGCCAGTTCGCGCTGGCCTGGCAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGttgcttg < 1:207641/236‑1 (MQ=255) gcAGGCTGGGGCGGCTGATGCCCAGTTGTTCGGCCAGTTCGCGCTGGCCTGGCAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCaa > 2:570897/1‑235 (MQ=255) cAGGCTGGGGCGGCTGATGCCCGGTTGTTCGGCCAGTTCGCGCTGGCCTGGCAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTgcgtggc < 2:326776/224‑1 (MQ=255) cAGGCTGGGGCGGCTGATGCCCAGTTGTTCGGCCAGTTCGCGCTGGCCTGGCAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGcgtggcgtgg < 1:536199/228‑1 (MQ=255) gggCGGCTGATGCCCAGTTGTTCGGCCAGTTCGCGCTGGCCTGGCAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGc < 1:570900/235‑1 (MQ=255) cAGTTGTTCGGCCAGTTCGCGCTGGCCTGGCAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCg > 2:338443/1‑230 (MQ=255) tCGGCCAGTTCGCGCTGGCCTGGCAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTgc < 1:743192/235‑1 (MQ=255) ggCCAGTTCGCGCTGGCCTGGCAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGGAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTggggg > 1:654599/1‑201 (MQ=255) gCCAGTTCGCGCTGGCCTGGCAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGcgtggcgtgg < 1:307174/197‑1 (MQ=255) ggcctggcAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTgc < 1:49747/219‑1 (MQ=255) ggcctggcAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCa < 1:543766/229‑1 (MQ=255) gCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCa > 2:836610/1‑218 (MQ=255) tGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAAt < 1:338446/236‑1 (MQ=255) gcCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCaa > 1:278519/1‑225 (MQ=255) gCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTccc < 2:324037/209‑1 (MQ=255) ggAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGCGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAAt > 2:65715/1‑185 (MQ=255) ccaccaCTGAGGTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTgc < 2:183993/159‑1 (MQ=255) caccacTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGTTCAGGTTGGTCaa < 1:896128/235‑1 (MQ=255) aGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTcc > 2:456494/1‑171 (MQ=255) acgGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGCCGATAccc > 1:445492/1‑235 (MQ=255) tgatgaGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGGCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCg > 1:291066/1‑200 (MQ=255) tgaGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGCCGATACCCATGAACCAg < 1:575198/236‑1 (MQ=255) gaGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTtctc < 2:610026/159‑1 (MQ=255) aGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAAc < 2:739384/210‑1 (MQ=255) aTCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCACGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCTTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTGCCAGGTCAAt < 2:831479/144‑1 (MQ=255) cTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGcc > 2:771986/1‑202 (MQ=255) tGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGCCGATACCCATGAACCAGTCCACCGCCAGCACCAGTAcc > 1:516608/1‑235 (MQ=255) gAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGCCGATACCCATGAACCAGTCCACCGCCAGCACCAGTACCAg < 1:456497/235‑1 (MQ=255) ggCCGGCGTCGTGCCGGCCACGTTCGATCAGAATCCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGcc < 2:278516/192‑1 (MQ=255) cGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGCCGATACCCATGAACCAGTCCACCGCCAGCACCAGTAccctggctctta > 1:239004/1‑226 (MQ=255) ggCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTg > 2:106710/1‑174 (MQ=255) ggCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGGCAACGCCCGGCCGATACCCATGAACCAGTCCACCGCCAGCACCAGTACCAGGCCAAAca > 1:6713/1‑235 (MQ=255) cATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGCCGATACCCATGAACCAGTCCACCGCCAGCACCAGTACCAGGCCAACCACAggg < 1:317911/235‑1 (MQ=255) actggttcatgggtatcggccgggcgttgaccaacctgatcggcaacTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGc > 2:924276‑M1/48‑85 (MQ=255) actggttcatgggtatcggccgggcgttgaccaacctgatcggcaacTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGc < 1:924279‑M1/38‑1 (MQ=255) cTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGCCGATACCCATGAACCAGTCCACCGCCAGCACCAGTACCAGGCCAACCACAGGGATCGCCGGTACCGCAg < 1:847618/234‑1 (MQ=255) gccgggcgttgaccaacctgatcggcaacTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCtt < 2:365226‑M1/70‑1 (MQ=255) gccgggcgttgaccaacctgatcggcaacTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCtt > 1:365229‑M1/30‑99 (MQ=255) aTTCCTGTTGAGGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGcc < 2:35025/160‑1 (MQ=255) tGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGCCGATACCCATGAACCAGTCCACCGCCAGCACCAGTACCAGGCCAACCACAGGGATCGCCGGTACCGCAGTCAGGGTGGCGGCAAGAAt > 1:75826/1‑236 (MQ=255) ggTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGc > 2:688875/1‑37 (MQ=255) ggTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGc < 1:688878/37‑1 (MQ=255) ggTTGCTTGCGCGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGTTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCCCGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGCCGATACCCATGAACCAGTCCACCGCCAGCACCAGTACCAGGCCAACCACAGGGATCGCCGGTACCGCAGTCAGGGTGGCGGCAAGAATCACCAGt < 1:287259/234‑1 (MQ=255) cgtgcGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCTGTCGAGCACGTCCTGCGCACGTTCCAgg < 2:500118/59‑1 (MQ=255) | CACGGTTACCGCTTCGCGCAGGCTGGGGCGGCTGATGCCCAGTTGTTCGGCCAGTTCGCGCTGGCCTGGCAGCATGTCGCCGGTGCGCCATTGGCCGCGGGCCAGGGCCTGGCGGAGTTTTTCCACCACTGAGTTGACGACGGTTGATGAGCTGATCACGGTTCGCTCCTGGAAGGGCCGGCGTCATGCCGGCCACGTTCGCTCAGAATTCCTGTTGATGGGCGCTGGGTTGCTTGCGTGGCGTGGGGGCAAAGCCAGGCTTGCCGTCGAGCACGTTCTGCGCACGTTCCAGGTCAATGTCCTTCTCCCAACGGGCAATGGCCACGGTGGCCACGCAGTTGCCGATCAGGTTGGTCAACGCCCGGCCGATACCCATGAACCAGTCCACCGCCAGCACCAGTACCAGGCCAACCACAGGGATCGCCGGTACCGCAGTCAGGGTGGCGGCAAGAATCACCAGT > AE015451/2570924‑2571384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |