New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 4123926 = | 53 (1.060) | 5 (0.110) | 5/316 | NT | 9.8% | coding (401/1746 nt) | PP_3628 | Choline/carnitine/betaine transporter family protein |
? | AE015451 | 4123974 = | 42 (0.900) | coding (449/1746 nt) | PP_3628 | Choline/carnitine/betaine transporter family protein |
GGCCAGCCTGGCCAGCAGCGCTTCCAGCGCGCAATCCTGGGTCATTCTCAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCAA > AE015451/4123693‑4124150 | ggCCAGCCTGGCCAGCAGCGCTTCCAGCGCGCAATCCTGGGTCATTCTCAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTg > 2:427516/1‑235 (MQ=255) cAATCCTGGGTCATTCTCAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCg < 1:413579/208‑1 (MQ=255) gagagggccgtttgcgtgcttgccgatcagcggccggaaggcggcggaaatcagctgcgagcggccacggcggaaggtgccgtaggcgattaccaggccgacgatggcgtacatggcccaagggtgcagggtccaatggaacaaggtagtggccattgccacctgcatcgcttcgctggtctgcccgcTGGCCg > 1:806881‑M1/189‑194 (MQ=255) tcAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAg > 1:644122/1‑235 (MQ=255) tcAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGc > 1:708940/1‑236 (MQ=255) tcAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTCCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCg < 2:432889/197‑1 (MQ=255) cAATTTCGGCTGGTTCTTCGTACTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGc < 1:585010/235‑1 (MQ=255) tCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCGCTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCggg > 2:791317/1‑233 (MQ=255) tcttcGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCagcga > 1:778867/1‑235 (MQ=255) cTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGc < 1:612063/235‑1 (MQ=255) ccctccctcTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTg < 1:635616/233‑1 (MQ=255) cctccctcTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCacgccg < 2:324941/209‑6 (MQ=255) cGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGc < 1:86226/196‑1 (MQ=255) gtgtTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCtt < 1:427519/236‑1 (MQ=255) tgtTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCCGGTGGCAATGGCCACTACCTTg > 1:345684/1‑236 (MQ=255) ttCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCa < 2:444551/199‑1 (MQ=255) cGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATcgccgccg > 2:841128/1‑172 (MQ=255) gTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTGCCa > 1:546075/1‑236 (MQ=255) tGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGcc > 2:86226/1‑140 (MQ=255) tGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGc > 1:255479/1‑181 (MQ=255) tgtgGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTg < 1:193960/146‑1 (MQ=255) cAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGGCCAGCGAAGCGATGCAGGTTGCAATGGCCACTACCTTGTTccct > 1:548051/1‑218 (MQ=255) ccGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTgg < 1:502714/235‑1 (MQ=255) cgggcgggTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATcgc > 2:72147/1‑140 (MQ=255) cgggcgggTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGt > 1:864899/1‑236 (MQ=255) gggcgggTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGt < 1:712480/235‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAcc < 2:555558/210‑1 (MQ=255) tggcgtacatggcccaagggtgcagggtccaatggaacaaggtagtggccattgccacctgcatcgcttcgctggtctgcccgcTGGCCGAGCCGCTGTCGCGCTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCa < 2:97160‑M1/48‑1 (MQ=255) gCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTcc < 2:855149/183‑1 (MQ=255) gCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATgg < 2:482925/161‑1 (MQ=255) cggagTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTGCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCGGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGc < 2:150213/82‑1 (MQ=255) agggTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCacg < 1:521260/121‑3 (MQ=255) aagggtgcagggtccaatggaacaaggtagtggccattgccacctgcatcgcttcgctggtctgcccgcTGGCCGAGCCGCTGTGGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCCGCCAGCGGGCAGACCagcgaagc < 1:288914‑M1/67‑1 (MQ=255) cGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCCGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAcc < 1:682208/174‑1 (MQ=255) cACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCAGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTg > 1:579909/1‑236 (MQ=255) aGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAcc < 2:682886/157‑1 (MQ=255) gCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAcc < 2:499940/156‑1 (MQ=255) gatgatGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCg < 2:216355/58‑1 (MQ=255) gatgatGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCg > 1:216357/1‑58 (MQ=255) atgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGGGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGACGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGcc < 2:400745/168‑1 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGa < 2:797468/150‑1 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGa > 1:797471/1‑150 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTTCGGccc > 1:778325/1‑203 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTccgcc > 1:114284/1‑213 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCg > 1:690625/1‑224 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGAACCTTccgcc > 2:347686/1‑213 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCCCTGGCGCACTACATATCGCTGCCGCCCGGCTCCGCCAGCGGGCAggc > 2:310272/1‑101 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCATGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATCTCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCCGGCAGACCagc > 2:343323/1‑107 (MQ=255) atgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTccga > 2:643942/1‑235 (MQ=255) ttCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCagcgaagc > 2:209107/1‑107 (MQ=255) ttCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCcgccgc > 1:658114/1‑236 (MQ=255) cccGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTc < 1:790307/223‑1 (MQ=255) attgccacctgcatcgcttcgctggtctgcccgcTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCgccgccgcc < 2:237764‑M1/37‑1 (MQ=255) cGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCa < 1:853114/132‑1 (MQ=255) cGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCa > 2:853111/1‑132 (MQ=255) cGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTAGCCGAGCCGATGTCGAACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACGAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAGCCTGCACCCTTGGGCCATg > 2:578808/1‑157 (MQ=255) tGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGGCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGGGGCAATGGCCACTACCTTGtt > 2:653551/1‑124 (MQ=255) gCATCGGCCTGGTGTTCTGCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGGCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGc < 1:210953/109‑1 (MQ=255) gcttcgctggtctgcccgcTGGCCGAGCCGCTGTCg < 2:205348‑M1/17‑1 (MQ=255) tggtctgcccgcTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTccgccg < 2:763848‑M1/169‑1 (MQ=255) ttcttcGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCaa < 1:209109/235‑1 (MQ=255) | GGCCAGCCTGGCCAGCAGCGCTTCCAGCGCGCAATCCTGGGTCATTCTCAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCAA > AE015451/4123693‑4124150 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |