New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 4123926 = | 53 (1.060) | 5 (0.110) | 5/316 | NT | 9.8% | coding (401/1746 nt) | PP_3628 | Choline/carnitine/betaine transporter family protein |
? | AE015451 | 4123974 = | 42 (0.900) | coding (449/1746 nt) | PP_3628 | Choline/carnitine/betaine transporter family protein |
TCAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCAAACGGCCCTCTCGGCCGCCTGATCGACATGATGGCAATCTTCGCC > AE015451/4123740‑4124194 | tcAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAg > 1:644122/1‑235 (MQ=255) tcAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGc > 1:708940/1‑236 (MQ=255) cAATTTCGGCTGGTTCTTCGTACTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGc < 1:585010/235‑1 (MQ=255) tCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCGCTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCggg > 2:791317/1‑233 (MQ=255) tcttcGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCagcga > 1:778867/1‑235 (MQ=255) cTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGc < 1:612063/235‑1 (MQ=255) ccctccctcTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTg < 1:635616/233‑1 (MQ=255) cGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGc < 1:86226/196‑1 (MQ=255) gtgtTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCtt < 1:427519/236‑1 (MQ=255) tgtTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCCGGTGGCAATGGCCACTACCTTg > 1:345684/1‑236 (MQ=255) ttCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCa < 2:444551/199‑1 (MQ=255) gTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTGCCa > 1:546075/1‑236 (MQ=255) cggcggaaggtgccgtaggcgattaccaggccgacgatggcgtacatggcccaagggtgcagggtccaatggaacaaggtagtggccattgccacctgcatcgcttcgctggtctgcccgctggccgagccgggcggcggcgatatgtagtgcgacagcggctcggccaGCGGGCAGACCa < 2:763848‑M2/12‑1 (MQ=255) cAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGGCCAGCGAAGCGATGCAGGTTGCAATGGCCACTACCTTGTTccct > 1:548051/1‑218 (MQ=255) ccGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTgg < 1:502714/235‑1 (MQ=255) cgggcgggTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGt > 1:864899/1‑236 (MQ=255) gggcgggTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGt < 1:712480/235‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAcc < 2:555558/210‑1 (MQ=255) gCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTcc < 2:855149/183‑1 (MQ=255) gCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATgg < 2:482925/161‑1 (MQ=255) aagggtgcagggtccaatggaacaaggtagtggccattgccacctgcatcgcttcgctggtctgcccgcTGGCCGAGCCGCTGTGGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCCGCCAGCGGGCAGACCagcgaagc < 1:288914‑M1/67‑1 (MQ=255) cGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCCGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAcc < 1:682208/174‑1 (MQ=255) cACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCAGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTg > 1:579909/1‑236 (MQ=255) aGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAcc < 2:682886/157‑1 (MQ=255) gCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAcc < 2:499940/156‑1 (MQ=255) atgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGGGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGACGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGcc < 2:400745/168‑1 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGa > 1:797471/1‑150 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGa < 2:797468/150‑1 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTTCGGccc > 1:778325/1‑203 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTccgcc > 1:114284/1‑213 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCg > 1:690625/1‑224 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGAACCTTccgcc > 2:347686/1‑213 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCCCTGGCGCACTACATATCGCTGCCGCCCGGCTCCGCCAGCGGGCAggc > 2:310272/1‑101 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCATGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATCTCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCCGGCAGACCagc > 2:343323/1‑107 (MQ=255) atgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTccga > 2:643942/1‑235 (MQ=255) ttCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCagcgaagc > 2:209107/1‑107 (MQ=255) ttCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCcgccgc > 1:658114/1‑236 (MQ=255) cccGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTc < 1:790307/223‑1 (MQ=255) cGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCa < 1:853114/132‑1 (MQ=255) cGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCa > 2:853111/1‑132 (MQ=255) cGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTAGCCGAGCCGATGTCGAACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACGAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAGCCTGCACCCTTGGGCCATg > 2:578808/1‑157 (MQ=255) tGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGGCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGGGGCAATGGCCACTACCTTGtt > 2:653551/1‑124 (MQ=255) gCATCGGCCTGGTGTTCTGCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGGCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGc < 1:210953/109‑1 (MQ=255) gcttcgctggtctgcccgctggcggagccgggcggcggcgatatgtagtgccacagcggctcggccaGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCtt < 1:288914‑M2/69‑1 (MQ=255) tggtctgcccgcTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTccgccg < 2:763848‑M1/169‑1 (MQ=255) ttcttcGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCaa < 1:209109/235‑1 (MQ=255) tggccgagccgggcggcggcgatatgtagcgcgacagcggctcggccaGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCa < 2:97160‑M2/84‑1 (MQ=255) ggcggcggcgatatgtagtgcgacagcggctcggccaGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAAt < 2:237764‑M2/34‑1 (MQ=255) cgccgccgcCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGcc > 2:857341/1‑178 (MQ=255) cgccgccgcCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCAAACGGCCCTCTCGGCCGCCTGATCGACATGATGGCAAt > 1:366394/1‑235 (MQ=255) gccgccgccCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATAGc < 2:61092/57‑1 (MQ=255) cgccgccCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCAAACGGCCCTCTCGgcc > 2:409679/1‑210 (MQ=255) gccgccCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGc > 2:666439/1‑173 (MQ=255) cgacagcggctcggccaGCGGGCAGACCagcgaagc < 2:205348‑M2/19‑1 (MQ=255) cgccCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCAAACGGCCCTCTCGGCCGCCTGATCGACATGATGGCAATCTTCGcc < 1:664894/236‑1 (MQ=255) cccGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAggcggcc > 2:270117/1‑44 (MQ=255) cccGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGcc > 2:632695/1‑184 (MQ=255) cccGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCCCCTTCCGGCCGCt > 2:19798/1‑173 (MQ=255) cggccaGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCAAACGGCCCtctc > 1:806881‑M2/7‑194 (MQ=255) | TCAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCAAACGGCCCTCTCGGCCGCCTGATCGACATGATGGCAATCTTCGCC > AE015451/4123740‑4124194 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |