| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AE015451 | 6131444 = | 57 (1.140) | 4 (0.080) | 4/326 | NT | 7.4% | coding (78/1080 nt) | copB‑II | copper resistance protein B |
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cATGATCCATCTTGCTGTGGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCAccc > 2:535843/1‑233 (MQ=255) cATGATCCATCTTGCTGTGGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGc < 1:659856/236‑1 (MQ=255) cATGATCCATCTTGCTGTGGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGc < 1:917723/236‑1 (MQ=255) gATCCATCTTGCTGTGGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTgg < 2:414180/216‑1 (MQ=255) tCTTGCTGTGGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCtgaat < 1:724811/236‑1 (MQ=255) cTTGCTGTGGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCGGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCt > 1:235982/1‑231 (MQ=255) tgGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGc > 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tCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCa > 1:306961/1‑236 (MQ=255) cctcAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTCCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCAt < 1:183547/214‑1 (MQ=255) ccgcagcaACGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCt < 1:264663/180‑1 (MQ=255) cagcagCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTcc < 2:808298/153‑1 (MQ=255) attcagcatGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCATCGAGTCAt < 1:256096‑M1/225‑1 (MQ=255) agcagcAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTGGCTGTGATCCATACCTTCCCTCGAg < 1:47081/158‑1 (MQ=255) cagcaAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCATCGAGt < 1:638919/229‑1 (MQ=255) aGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCAt < 1:810616/185‑1 (MQ=255) aGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCAt > 2:810613/1‑185 (MQ=255) GCTGGGCGAAGCAGCTCCCCGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGTTGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTc > 2:208806‑M1/1‑167 (MQ=255) | TCCATCCCCTGCATGCTGCCATGATCCATCTTGCTGTGGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCATCGAGTCAT > AE015451/6131211‑6131668 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |