New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 6131444 = | 57 (1.140) | 4 (0.080) | 4/326 | NT | 7.4% | coding (78/1080 nt) | copB‑II | copper resistance protein B |
? | AE015451 | 6131466 = | 45 (0.930) | coding (56/1080 nt) | copB‑II | copper resistance protein B |
TCTTGCTGTGGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCATCGAGTCATGATCCATGCCCTGAGAACCCTTC > AE015451/6131239‑6131691 | tCTTGCTGTGGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCtgaat < 1:724811/236‑1 (MQ=255) cTTGCTGTGGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCGGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCt > 1:235982/1‑231 (MQ=255) atgactcgatgaagggtatggatcatggctccatgaagggtatggaccacgacagcatgaaaggtatggaccatggctcgatggaaggtatggatcacagcaaaatgatggaatcgcatggcagcgataaagctaaggcagggaaagatgaccaatagcctggcacgaccatcgctgctggcattgaccgtttcattcagcatgctgggtgctgctgcgcccagcATGCtgaat < 1:256096‑M2/9‑1 (MQ=255) tgGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGc > 1:827247/1‑223 (MQ=255) cATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATg > 1:917011/1‑236 (MQ=255) cgcAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCACCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCcagca < 1:342537/236‑1 (MQ=255) tgtgTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATCGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGaaa > 2:609964/1‑198 (MQ=255) ttCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACg < 1:802868/195‑1 (MQ=255) cATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCt > 1:12035/1‑236 (MQ=255) gATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCtt < 1:535846/236‑1 (MQ=255) tCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAgg < 1:655985/210‑1 (MQ=255) gcgcGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCAt > 1:20319/1‑160 (MQ=255) ctcgatggaaggtatggatcacagcaaaatgatggaatcgcatggcagcgataaagctaaggcagggaaagatgaccaatagcctggcacgaccatcgctgctggcattgaccgtttcattcagcatgctgggtgctgctgcgcccagcATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGctttatcctgtct > 1:507698‑M2/150‑227 (MQ=255) tggaaggtatggatcacagctaaatgatggaatcgcatggcagcgataaagctaaggcagggaaagatgaccaatagcctggcacgaccatcgctgctggcattgaccgtttcattcagcatgctgggtgctgctgcgcccagcATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCt < 2:507695‑M2/64‑1 (MQ=255) tgctgcTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGAtt < 1:240614/236‑1 (MQ=255) aaggtatggatcacagcaaaatgatggaagcgcatggcagcgataaagctaaggcagggaaagatgaccaatagcctggcacgaccatcgctgctggcattgaccgtttcattcagcatgctgggtgctgctgcgcccagcATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCtt < 1:400272‑M2/59‑1 (MQ=255) ctTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGc > 2:315596/1‑227 (MQ=255) ctTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCcatc < 1:16910/236‑1 (MQ=255) gcgcCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCAtttt < 1:857424/234‑1 (MQ=255) gAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCAt < 1:342908/236‑1 (MQ=255) gTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCtt < 2:830000/234‑1 (MQ=255) ccATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCtgaatg < 1:439518/123‑1 (MQ=255) ccATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCtgaatg > 2:439515/1‑123 (MQ=255) agacaggataaagctaaggcagggaaagatgaccaatagcctggcacgaccatcgctgctggcattgaccgtttcattcagcatGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAg > 1:507698‑M1/85‑233 (MQ=255) tCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATg > 2:595976/1‑233 (MQ=255) cggTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTcc < 1:330931/219‑1 (MQ=255) tCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTcc > 2:28507/1‑232 (MQ=255) cGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGa > 2:668466/1‑200 (MQ=255) cGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTc < 1:195887/236‑1 (MQ=255) cGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTc < 1:595979/236‑1 (MQ=255) gACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCtt > 2:910980/1‑233 (MQ=255) ggAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTc < 2:221740/207‑1 (MQ=255) agggaaagatgaccaatagcctggcacgaccatcgctgctggcattgaccgtttcattcagcatGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTAGCTGTGATCCATACCTTCCa < 2:507695‑M1/144‑1 (MQ=255) cGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCcatc > 2:796992/1‑180 (MQ=255) cGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGt < 1:832411/235‑1 (MQ=255) aagatgaccaatagcctggcacgaccatcgctgctggcattgaccgtttcattcagcatGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGCTTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCtt < 1:400272‑M1/141‑1 (MQ=255) aTTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTc > 2:892308/1‑234 (MQ=255) gTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAg < 1:892311/236‑1 (MQ=255) tGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGc < 1:493702/236‑1 (MQ=255) ccccATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCtgaatg < 2:441945/68‑1 (MQ=255) cccATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTTTCGTGGTc > 1:48430/1‑216 (MQ=255) cGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGc < 2:917008/225‑1 (MQ=255) gAATGGTCCATCTCTGCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATAc < 2:41793/188‑1 (MQ=255) aaTGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCGGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCCTAGCTTTATCGCGGCCATGCGATTCGATCACTATGCTGTGGTCCATGCCtt > 2:580679/1‑166 (MQ=255) gTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTc < 1:540777/236‑1 (MQ=255) tCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCa > 1:306961/1‑236 (MQ=255) cctcAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTCCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCAt < 1:183547/214‑1 (MQ=255) ccgcagcaACGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCt < 1:264663/180‑1 (MQ=255) cagcagCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTcc < 2:808298/153‑1 (MQ=255) attcagcatGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCATCGAGTCAt < 1:256096‑M1/225‑1 (MQ=255) agcagcAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTGGCTGTGATCCATACCTTCCCTCGAg < 1:47081/158‑1 (MQ=255) cagcaAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCATCGAGt < 1:638919/229‑1 (MQ=255) aGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCAt < 1:810616/185‑1 (MQ=255) aGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCAt > 2:810613/1‑185 (MQ=255) GCTGGGCGAAGCAGCTCCCCGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGTTGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTc > 2:208806‑M1/1‑167 (MQ=255) GGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCATCGa < 2:615258‑M1/216‑1 (MQ=255) GGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCATCGa > 1:615261‑M1/1‑216 (MQ=255) cagcagcaCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGt < 2:697917/172‑1 (MQ=255) agcagcaCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGc < 1:692928/189‑1 (MQ=255) cagcaCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCATCGAGTCATGATCCATGCCCTGAGAAccc > 1:510279/1‑234 (MQ=255) agcaCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCATCGAGTCATGATCCATGCCCTGAGAACCCTTc < 1:866647/236‑1 (MQ=255) caCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTc < 2:767725/177‑1 (MQ=255) caCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTc > 1:767728/1‑177 (MQ=255) caCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGa < 1:54384/182‑1 (MQ=255) cATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGGCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCAt < 2:667758‑M2/179‑1 (MQ=255) aTGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGa > 1:345879/1‑174 (MQ=255) aTGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGa < 2:345876/174‑1 (MQ=255) aTGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCATCGAGTCATGATCCATGCCCTGAGAACCCt > 1:652540/1‑224 (MQ=255) | TCTTGCTGTGGTCCATGTGCGCAGGTTTGGCCACAGGTTGACTGTGTTTCATTTTGCTGTGATCAACAGGCGCGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATACCTTTCATGCTGTCGTGGTCCATACCCTTCATGGAGCCATGATCCATACCCTTCATCGAGTCATGATCCATGCCCTGAGAACCCTTC > AE015451/6131239‑6131691 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |