New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 3272245 | 41 (0.820) | 5 (0.110) | 5/320 | NT | 11.3% | intergenic (‑161/‑14) | PP_2869/PP_2870 | Oxidoreductase, FMN‑binding/putative spermidine/putrescine‑binding periplasmic protein |
? | AE015451 | = 3272356 | 40 (0.840) | coding (98/1044 nt) | PP_2870 | putative spermidine/putrescine‑binding periplasmic protein |
GTGTAGCGATAGTAAAAAATCAACTTGTTTTTTTACTTACGTCTGTCTAGGTTTTCCTCACTCGCATGGCGAGGGTGTGACCTCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCATGGCCGACACCGGGAATGTCGATTGGGACGTGGTGCAGATCGAAGGCCCTGACTTGATGCGCGGCTGCGACGAGGGGATTT > AE015451/3272126‑3272553 | gtgtAGCGATAGTAAAAAATCAACTTGTTTTTTTACTTACGTCTGTCTAGGTTTTCCTCACTCGCATGGCGAGGGTGTGACCTCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggcg > 1:483116‑M2/1‑231 (MQ=255) gCGATAGTAAAAAATCAACTTGTTTTTTTACTTACGTCTGTCTAGGTTTTCCTCACTCGCATGGCGAGGGTGTGACCTCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAt > 1:24290‑M2/1‑226 (MQ=255) aCTTGTTTTTTTACTTACGTCTGTCTAGGTTTTCCTCACTCGCATGGCGAGGGTGTGACCTCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggcggcg < 1:206644‑M2/217‑9 (MQ=255) gtctgtctAGGTTTTCCTCACTCGCATGGCGAGGGTGTGACCTCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCggg > 2:432462/1‑203 (MQ=255) tAGGTTTTCCTCACTCGCATGGCGAGGGTGTGACCTCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGGGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAg > 1:901785/1‑215 (MQ=255) cACTCGCATGGCGAGGGTGTGACCTCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggcg < 1:167879‑M2/178‑6 (MQ=255) cGCATGGCGAGGGTGTGACCTCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATg < 1:442016/198‑1 (MQ=255) cGCATGGCGAGGGTGTGACCTCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATg > 2:442013/1‑198 (MQ=255) gtgtGACCTCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCACGCCCTTCGTTGCCCAg > 1:630356/1‑215 (MQ=255) gtgtGACCTCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGCGGTCGGTTATGGCGGGGCGGGccg > 1:207358/1‑171 (MQ=255) tCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCaga > 1:327003/1‑229 (MQ=255) acaacaAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggcggtgcccgacgggcccgttttcttgttgtt > 2:364932‑M2/1‑144 (MQ=255) caacaaGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGCTGGTCGTGGTCGGTTAtggcggg < 1:231817‑M2/150‑8 (MQ=255) gAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggcgg < 2:176136‑M2/143‑7 (MQ=255) gAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAAt > 1:928411/1‑236 (MQ=255) aaCGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATg < 1:889832/234‑1 (MQ=255) gCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggcggtgcccgacgggcccgttttcttgttgttctgagg > 1:462381‑M2/1‑129 (MQ=255) ccGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCatgagtc > 1:263527/1‑142 (MQ=255) cGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCTGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggcg > 2:512106‑M2/1‑126 (MQ=255) cGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggcg < 1:512109‑M2/131‑6 (MQ=255) cGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTc > 2:759730/1‑166 (MQ=255) cGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCt > 1:900115/1‑195 (MQ=255) gccGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCAt < 1:934132/234‑1 (MQ=255) aCCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCATg < 1:432465/236‑1 (MQ=255) ccAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCCCGCGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATg < 1:784172/214‑1 (MQ=255) cAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCGACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggcggtgcccgacgggcccgttttcttgttgttctgaggtcac > 1:544025‑M2/1‑113 (MQ=255) aggaggAAACTACGATGCAGCTCTATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACgg < 2:291660/175‑1 (MQ=255) ggaggaAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGt > 2:352747/1‑162 (MQ=255) ggaggaAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGAt < 2:937863/186‑1 (MQ=255) gaAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAg > 2:26904/1‑123 (MQ=255) cTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCAc > 2:934129/1‑207 (MQ=255) gCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCATGGCCGACACCGGGAATGTCGAtt < 1:925060/236‑1 (MQ=255) tataTCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTGGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGAt > 1:367341/1‑127 (MQ=255) aCGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATg > 1:325755/1‑184 (MQ=255) aCGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATg < 2:325752/184‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCt > 1:586752/1‑123 (MQ=255) ccGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCt < 2:586749/123‑1 (MQ=255) ggCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGa < 1:519635/148‑1 (MQ=255) ggCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGa > 2:519632/1‑148 (MQ=255) ggCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAGTACaa > 1:518380/1‑164 (MQ=255) ggCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACaa < 2:518377/164‑1 (MQ=255) aGCCTTGTGGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATgg < 1:99224/164‑1 (MQ=255) ccTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCATGGCCGACACCGGGAATGTCGATTGGGACGTGGTGCAGa < 2:629115/216‑1 (MQ=255) tgGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCATGGCCGACACCGGGAATGTCGATTggg < 1:429528/198‑1 (MQ=255) tgGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCATGGCCGACACCGGGAATGTCGATTggg > 2:429525/1‑198 (MQ=255) gCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCATGGCCGACACCGGGAATGTCGATTGGGACGTGGTGCAGATCGAAGGCCCTGACTTGATGCGCGGCt > 1:333072/1‑235 (MQ=255) ccTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggcggt < 1:315437‑M2/52‑8 (MQ=255) cTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggc < 2:330415‑M2/48‑5 (MQ=255) cTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGc > 1:234211/1‑57 (MQ=255) gCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATcc < 2:492037/117‑1 (MQ=255) cAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCATGGCCGACACCGGGAATGTCGATTGGGACGTGGTGCAGATCGAAGGCCCTGACTTGATGCGCGGCTGcga < 2:599820/225‑1 (MQ=255) cAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGGCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCATGGc < 2:236529/159‑1 (MQ=255) gcAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggcggtgcccgacgggcccgttttcttgttgttctgaggtcacaccctcgccatgcgagtg < 2:915276‑M2/95‑63 (MQ=255) gcAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTAtggcggtgcccgacgggcccgttttcttgttgttctgaggtcacaccctcgccatgcgagtg > 1:915279‑M2/1‑33 (MQ=255) gcAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCATGGCCGACACCGGGAATGTCGATTGGGACGTGGTGCAGATCGAAGGCCCTGGCTTGATGCGCGGCTGCGACGAGGGGAttt > 1:933257/1‑230 (MQ=255) gcAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGGGAATACAACGGCGAAATGGCAc > 2:839558/1‑137 (MQ=255) tGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCATGGCCGACACCGGGAATGTCGATTGGGACGTGGTGCAGATCGAAGGCCCTGACTTGATgcg < 1:834761/204‑1 (MQ=255) cagcagATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCgg > 2:160072/1‑34 (MQ=255) aTGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATcc < 2:367338/127‑1 (MQ=255) | GTGTAGCGATAGTAAAAAATCAACTTGTTTTTTTACTTACGTCTGTCTAGGTTTTCCTCACTCGCATGGCGAGGGTGTGACCTCAGAACAACAAGAAAACGGGCCCGTCGGGCACCGCCAGGAGGAAACTACGATGCAGCTATATCCACGTGTGACCGGCCTTTGTGCAGCCTTGTTGGCCCTTGGCCTGAGCAATGCGCAAGCTGCGCAGCAGATGGTCGTGGTCGGTTATGGCGGTGCGGGCCAGAAGGCCCAGGATGAGGCGATCTTCAAGCCCTTCGTTGCCCAGGACGGCAGCCAGCTGATCCAGAGTGAATACAACGGCGAAATGGCACGGATCCAGGTCATGGCCGACACCGGGAATGTCGATTGGGACGTGGTGCAGATCGAAGGCCCTGACTTGATGCGCGGCTGCGACGAGGGGATTT > AE015451/3272126‑3272553 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |