| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | 1057115 = | 111 (1.290) | 5 (0.060) | 5/330 | NT | 5.1% | coding (957/2082 nt) | PP_0914 | GGDEF domain protein |
| ? | AE015451 | 1057250 = | 84 (1.050) | coding (822/2082 nt) | PP_0914 | GGDEF domain protein | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TCACCGTCTTCGGGGAAGAGGGTGATGCCGATGGTCGCGCGCAGGCGGATTTGCTCGTGGTCGAGGTCGAACGGTACTTCCAGGTCGTCAAGAATGCTTTGCGCCAGTTCGGCAGCCTCATAGGG‑‑‑‑‑CTGCTCGATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGA > AE015451/1056891‑1057347 | gaagatcatcgagcacctcacccagatcaaccctgaccgccccagccagcaccagataccgctgctcaagggccacgagaaaaacgagctgggcctgtgggttaacaccgccaaccagttgctggcctcgatcgagcgcaacacccatttgcgccacgaggcggaaaacagcctgcagcgcatggcccagtacgacttcctcaccggcctgcccaaccgccagcaactgcagcag > 1:1247420‑M1/230‑235 (MQ=255) ttCGGGGAAGAGGGTGATGCCGATGGTCGCGCGCAGGCGGATTTGCTCGTGGTCGAGGTCGAACGGTACTTCCAGGTCGTCAAGAATGCTTTGCGCCAGTTCGGCAGCCTCATAGGG‑‑‑‑‑CTGCTCGATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCg 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cGATGGTCGCGCGCAGGCGGATTTGCTCGTGGTCGAGGTCGAACGGTACTTCCAGGTCGTCAAGAATGCTTTGCGCCAGTTCGGCAGCCTCATAGGG‑‑‑‑‑CTGCTCGATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGAGCggccagggcca > 1:345309/1‑198 (MQ=255) gATGGTCGCGCGCAGGCGGATTTGCTCGTGGTCGAGGTCGAACGGTACTTCCAGGTCGTCAAGAATGCTTTGCGCCAGTTCGGCAGCCTCATAGGG‑‑‑‑‑CTGCTCGATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGt < 1:522665/236‑1 (MQ=255) gATGGTCGCGCGCAGGCGGATTTGCTCGTGGTCGAGGTCGAACGGTACTTCCAGGTCGTCAAGAATGCTTTGCGCCAGTTCGGCAGCCTCATAGGG‑‑‑‑‑CTGCTCGATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGt < 1:946715/236‑1 (MQ=255) 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aggtcgaACGGTACTTCCAGGTCGTCAAGAATGCTTTGCGCCAGTTCGGCAGCCTCATAGGG‑‑‑‑‑CTGCTCGATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGca < 2:924855/233‑1 (MQ=255) ggtcgaACGGTACTTCCAGGTCGTCAAGAATGCTTTGCGCCAGTTCGGCAGCCTCATAGGG‑‑‑‑‑CTGCTCGATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAg < 1:783034/235‑1 (MQ=255) gtcgaACGGTACTTCCAGGTCGTCAAGAATGCTTTGCGCCAGTTCGGCAGCCTCATAGGG‑‑‑‑‑CTGCTCGATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAg > 2:648261/1‑234 (MQ=255) 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ggTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTgg < 2:1328323/212‑1 (MQ=255) gccgccCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCGGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGGGGaa > 2:1507359/1‑231 (MQ=255) ccgccCAGCCGGGCCTGGGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTg < 2:317604/114‑1 (MQ=255) cgccCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGtt > 1:463553/1‑189 (MQ=255) 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cAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCt < 2:1168262/234‑1 (MQ=255) cccGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAg < 2:288305/197‑1 (MQ=255) cGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTcga < 2:878146/141‑1 (MQ=255) tgGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTggg > 1:370869/1‑179 (MQ=255) ccggcctgcccaaccgccagcaactgCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCCGTTGCTGGCg < 1:365612‑M1/147‑1 (MQ=255) gTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCa > 2:1463338/1‑234 (MQ=255) aGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATgcgc < 2:1489105/204‑1 (MQ=255) gTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTc > 1:66364/1‑217 (MQ=255) tCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCt < 1:270733/45‑1 (MQ=255) ccGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGca < 2:395610/82‑1 (MQ=255) ggccagggccagCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAgg > 1:902836/1‑73 (MQ=255) ggccagggccagCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAgg < 2:902834/73‑1 (MQ=255) ggccagggccagCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGGAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAgg > 2:813861/1‑202 (MQ=255) aactgCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTcga < 2:384545‑M1/110‑1 (MQ=255) gccagCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCtcga > 1:1071873/1‑235 (MQ=255) | TCACCGTCTTCGGGGAAGAGGGTGATGCCGATGGTCGCGCGCAGGCGGATTTGCTCGTGGTCGAGGTCGAACGGTACTTCCAGGTCGTCAAGAATGCTTTGCGCCAGTTCGGCAGCCTCATAGGG‑‑‑‑‑CTGCTCGATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGA > AE015451/1056891‑1057347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |