| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | 1057115 = | 111 (1.290) | 5 (0.060) | 5/330 | NT | 5.1% | coding (957/2082 nt) | PP_0914 | GGDEF domain protein |
| ? | AE015451 | 1057250 = | 84 (1.050) | coding (822/2082 nt) | PP_0914 | GGDEF domain protein | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGCGGTCAGGGTTGATCTGGGTGAGGTGCTCGATGATCTTCGACAGC > AE015451/1057022‑1057484 | gATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTg > 2:905660/1‑234 (MQ=255)gATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCt > 1:1238920/1‑236 (MQ=255)gATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCt > 1:1168265/1‑236 (MQ=255) atatTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTg > 1:980266/1‑236 (MQ=255) atatTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTAGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACCGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATAGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCGGTTGCTg > 1:804265/1‑236 (MQ=255) tGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTgg > 1:1495072/1‑235 (MQ=255) tACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGtt < 2:1050536/221‑1 (MQ=255) cAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGc > 1:1219999/1‑236 (MQ=255) 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2:1186038/208‑1 (MQ=255) acaGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCgg > 1:1059378/1‑235 (MQ=255) acaGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCgg > 1:1263262/1‑235 (MQ=255) acaGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCgg > 1:598537/1‑235 (MQ=255) acaGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGGGAGGAAGTCGGACTggg > 1:331430/1‑108 (MQ=255) 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cTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGgt < 1:1182200/181‑1 (MQ=255) cacaCGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCAGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCtcgatcga > 2:610279/1‑156 (MQ=255) cacGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGgtgt > 2:1348419/1‑177 (MQ=255) ctgcAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGtt < 2:1321641/162‑1 (MQ=255) ctgcAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGc < 1:229222/236‑1 (MQ=255) tgcAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGc < 1:155533/235‑1 (MQ=255) tgcAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCT‑GCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCCCGCTCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGgt > 2:182369/1‑166 (MQ=255) cAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGCgg > 1:619864/1‑235 (MQ=255) 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ggATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGCGGTCAGGGTTGATCTGGGTGAg > 1:7508/1‑235 (MQ=255) cagttgctgctgCAGTTGGTGGCGGTTGGGGAGGCCGGGGAGGAAGGCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTGTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGc < 2:89271‑M2/191‑1 (MQ=255) cAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGGTGGGGAGGCCGGTGAGGAAggc > 1:451989/1‑46 (MQ=255) gttgctgctgCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGc < 2:136672‑M2/191‑1 (MQ=255) ttgctgctgCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGCGGTCa < 2:609562‑M2/196‑1 (MQ=255) ttgctgctgCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGCGGTCa > 1:609564‑M2/10‑205 (MQ=255) ctgctgCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGCGGTCAGGGTTGATCTGGGTGAGGTGCTCGATGATCTTc > 1:1247420‑M2/7‑235 (MQ=255) atgCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGCGGTCa < 1:1187295‑M2/196‑1 (MQ=255) cAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGCGGTCAGGGTTGATCTGGGTGAGGTGCTCGATGATCTTCGACAGc < 1:648263/235‑1 (MQ=255) | GATATTGGCCTGTACCAGGGCGAACTGGTCGCCGCCCAGCCGCGCCAGAGCGCCCAGGCGGCCGCTGTGGGCGCGTAGTCGATCGGCCAGGGCCAGCAGCAACTGGTCACCGACCTGGTAGCTGAATTGTTCGTTGATACCCTTGAAGTCGTCCAGGCCAACGCACAGCACTGCCACACGGTGCTGCAGGCGGCCGCCGTCGACGAGGATCTTGTCCAGTTGCTGCTGCAGTTGCTGGCGGTTGGGCAGGCCGGTGAGGAAGTCGTACTGGGCCATGCGCTGCAGGCTGTTTTCCGCCTCGTGGCGCAAATGGGTGTTGCGCTCGATCGAGGCCAGCAACTGGTTGGCGGTGTTAACCCACAGGCCCAGCTCGTTTTTCTCGTGGCCCTTGAGCAGCGGTATCTGGTGCTGGCTGGGGCGGTCAGGGTTGATCTGGGTGAGGTGCTCGATGATCTTCGACAGC > AE015451/1057022‑1057484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |