| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 1583196 = | 78 (0.910) | 5 (0.060) | 4/338 | NT | 6.6% | coding (385/633 nt) | ttgR | Probable HTH‑type transcriptional regulator TtgR |
| ? | AE015451 | 1583247 = | 68 (0.830) | coding (436/633 nt) | ttgR | Probable HTH‑type transcriptional regulator TtgR | |||||
ACTTCAACAACAAGGCCGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCG > AE015451/1582963‑1583429 | aggggaaacactccctcacaatccttaacaaagtgtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatccagcccggtgtcgacccatttttcgacatcacccaacagatcgacactgtcaggcagcaatagccagcgcccgatcaggccatcgacataggcaaacatggccaccgccgcgcgctcgacatccagctcgccaggcaactgaccccggcgtacggcattggcCAg < 1:36253‑M1/3‑1 (MQ=255) cTTCAACAACAAGGCCGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCagcagc > 1:229439/1‑236 (MQ=255) ggaaacactccctcacaatccttaacaaagtgtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatccagcccggtgtcgacccatttttcgacatcacccaacagatcgacactgtcaggcagcaatagccagcgcccgatcaggccatcgacataggcaaacatggccaccgccgcgcgctcgacatccagctcgccaggcaactggccccggcgtacggcattggcCAgcgc < 1:603294‑M1/6‑1 (MQ=255) caacaacaaGGCCGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGcc > 1:1120676/1‑236 (MQ=255) caacaaGGCCGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCaga < 1:427010/236‑1 (MQ=255) caacaaGGCCGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCaga < 1:1509361/236‑1 (MQ=255) caacaaGGCCGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCaga < 1:862095/236‑1 (MQ=255) aaGGCCGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGc > 1:1205412/1‑236 (MQ=255) ggCCGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGGGTgatg > 1:894085/1‑233 (MQ=255) ggCCGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCg > 1:435157/1‑235 (MQ=255) ggCCGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCg > 1:1508112/1‑235 (MQ=255) ggCCGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCg > 1:588295/1‑235 (MQ=255) ccGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGt > 1:1329798/1‑235 (MQ=255) cGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCCAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGTTGGTGCTCGATCCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCaga < 2:798209/227‑1 (MQ=255) gtcatttgcgcagagccgggctcaagcgcagcatatccagcccggtgtcgacccatttttcgacatcacccaacagatcgacactgtcaggcagcaatagccagcgcccgatcaggccatcgacataggcaaacatggccaccgccgcgcgctcgacatccagctcgccaggcaactggccccggcgtacggcattggcCAGcgcccg < 1:286454‑M1/9‑3 (MQ=255) tCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCa > 2:1030156/1‑234 (MQ=255) cGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATc > 1:1369875/1‑235 (MQ=255) cGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCa > 1:702406/1‑236 (MQ=255) cAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCcagca < 1:1017922/195‑1 (MQ=255) aGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCca < 1:1064959/221‑1 (MQ=255) gCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGCGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCAccc > 1:1235169/1‑234 (MQ=255) cGAGACCAATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCaga < 1:749741/194‑1 (MQ=255) gagaCCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCcagcag < 1:1006056/186‑1 (MQ=255) cgggctcaagcgcagcatatccagcccggtgtcgacccatttttcggcatcacccaacagatcgacactgtcaggcagcaatagccagcgcccgatcaggccatcgacataggcaaacatggccaccgccgcgcgctcgacatccagctcgccaggcaactggccccagcgtacggcattggcCAgcg < 1:1346301‑M1/5‑1 (MQ=255) agaCCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCt < 2:1189169/202‑1 (MQ=255) agaCCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTgg < 2:702404/234‑1 (MQ=255) aCCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCaa > 1:1107280/1‑236 (MQ=255) tGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGATAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCaga < 1:865988/185‑1 (MQ=255) tGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGATCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCcagca > 1:24503/1‑177 (MQ=255) gACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTgg < 1:282767/226‑1 (MQ=255) aCCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCg > 2:603292/1‑234 (MQ=255) aCCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCg > 2:691750/1‑234 (MQ=255) cATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTAc < 1:91205/235‑1 (MQ=255) ttGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCaga < 1:739384/178‑1 (MQ=255) ttGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGcc > 2:889403/1‑235 (MQ=255) ggCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGt > 2:1481359/1‑183 (MQ=255) gcgcgcgcGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCg > 2:858366/1‑233 (MQ=255) cgcgcgAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCgggg < 2:969662/233‑1 (MQ=255) gcgagcgaAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGCATCAATGAACTCCTGCATCACAAGTGCGAGTCCACCGATGCCCTGTGTGAACTTCGCCAGCAgcgc > 2:117037/1‑165 (MQ=255) agcgaAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGGTGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCaga < 2:1431067/166‑1 (MQ=255) agcgaAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGc < 1:1313124/235‑1 (MQ=255) cgaGAGCGAGGATGATCTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCt < 1:685592/235‑1 (MQ=255) 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tttAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGcc < 1:848592/210‑1 (MQ=255) ttAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGc > 1:884562/1‑208 (MQ=255) ttAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATc > 1:101295/1‑236 (MQ=255) aaCGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCgg < 1:691752/236‑1 (MQ=255) tGGTGCTCTATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAgc < 1:530962/186‑1 (MQ=255) gTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCAccc > 2:848892/1‑127 (MQ=255) gTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGAt > 1:363208/1‑216 (MQ=255) tGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGGGCGGCGCTGGATTGCCACAAGAGCAGCACCCt > 2:299080/1‑127 (MQ=255) tCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGt > 1:747021/1‑175 (MQ=255) gCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTgg > 1:1086275/1‑127 (MQ=255) gCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTgg < 2:1086272/127‑1 (MQ=255) gCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGcggcgg < 2:1458645/184‑1 (MQ=255) gCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATtgctgc < 1:1481362/235‑1 (MQ=255) cccGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGc < 1:696400/225‑1 (MQ=255) ccGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAgtg > 1:465837/1‑236 (MQ=255) gtcgtATCAATGAAACCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGCCATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTc < 1:261969/236‑1 (MQ=255) gacatccagctcgccaggcaactggccccggcgtacggcattggcCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCAGGTTTGCCTAt < 2:496149‑M1/126‑1 (MQ=255) cATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGAt < 2:547847/219‑1 (MQ=255) acatccagctcgccaggcaactggccccggcgtacggcattggcCCGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACCAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCgggg < 1:1026960‑M1/71‑1 (MQ=255) tCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCATCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGtt < 2:1120673/222‑1 (MQ=255) cacaAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCgg < 2:590312/185‑1 (MQ=255) cacaAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTa > 2:1159838/1‑195 (MQ=255) cacaAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTAGTGCTGCCTGACAGTGTCGTTCTGTTGGGTGAt > 1:130062/1‑228 (MQ=255) gTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGCAATTCGCCAGCAGCGCAAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGGACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAgcgc > 2:788925/1‑139 (MQ=255) gTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAAt > 1:690932/1‑233 (MQ=255) tGCGAGTTCACCGATGCCATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCgg < 2:1131430/179‑1 (MQ=255) aTGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGa > 2:1129751/1‑196 (MQ=255) aTGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATtg < 2:435155/174‑1 (MQ=255) tgtgtgAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGAt > 1:997485/1‑191 (MQ=255) gtgAAATTCTCCAGCACCGCCAGAGTGTGGCGCTGGATTGCCACAAGGGCACTACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCTTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTCTGc < 2:806348/136‑1 (MQ=255) tgAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTa < 2:393026/166‑1 (MQ=255) gAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATtgc > 2:120874/1‑169 (MQ=255) aaTTCGCCAGCAGCGCCCGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCt < 1:290651/147‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTc < 1:1062583/179‑1 (MQ=255) cattggcCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGGGTCGATCTGTTGGGTGATGTcgaaaaagt < 1:142329‑M1/197‑3 (MQ=255) gCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATtgct < 2:329408/163‑1 (MQ=255) agcagcGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGat > 2:1320711/1‑218 (MQ=255) CAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCg > 2:1185114‑M1/1‑234 (MQ=255) | ACTTCAACAACAAGGCCGAGCTGGTGCAGGCGTTGCTCGACAGCCTGCACGAGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCG > AE015451/1582963‑1583429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |