| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 1583196 = | 78 (0.910) | 5 (0.060) | 4/338 | NT | 6.6% | coding (385/633 nt) | ttgR | Probable HTH‑type transcriptional regulator TtgR |
| ? | AE015451 | 1583247 = | 68 (0.830) | coding (436/633 nt) | ttgR | Probable HTH‑type transcriptional regulator TtgR | |||||
AGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCT > AE015451/1583014‑1583479 | agaCCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTgg < 2:702404/234‑1 (MQ=255) aCCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCaa > 1:1107280/1‑236 (MQ=255) gACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTgg < 1:282767/226‑1 (MQ=255) aCCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCg > 2:603292/1‑234 (MQ=255) aCCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCg > 2:691750/1‑234 (MQ=255) cATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTAc < 1:91205/235‑1 (MQ=255) ttGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGcc > 2:889403/1‑235 (MQ=255) gcgcgcgcGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCg > 2:858366/1‑233 (MQ=255) cgcgcgAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCgggg < 2:969662/233‑1 (MQ=255) agcgaAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGc < 1:1313124/235‑1 (MQ=255) cgaGAGCGAGGATGATCTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCt < 1:685592/235‑1 (MQ=255) gCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAg < 1:174396/236‑1 (MQ=255) actttttcgacatcacccaacagatcgaccctgtcaggcagcaatagccagcgcccgatcaggccatcgacataggcaaacatggccaccgccgcgcgctcgacatccagctcgccaggcaactggccccggcgtacggcattggccagcgccagggtgatgcccttgtggcaatccagcaccgcactctggcgctgGCCAATg < 1:142329‑M2/7‑1 (MQ=255) aGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAg < 2:890109/233‑1 (MQ=255) tGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGAt > 1:393028/1‑235 (MQ=255) ggCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCt < 2:1409716/211‑1 (MQ=255) gcctGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGcgcgcg > 1:1185117/4‑235 (MQ=255) aTGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCAt < 1:71540/236‑1 (MQ=255) gcAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCa > 2:227256/1‑190 (MQ=255) ctgTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATg > 1:1215359/1‑235 (MQ=255) ttGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGa > 1:1076109/1‑236 (MQ=255) gtgtTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGt < 1:1375078/194‑1 (MQ=255) tttAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGcc < 1:848592/210‑1 (MQ=255) ttAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGc > 1:884562/1‑208 (MQ=255) ttAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATc > 1:101295/1‑236 (MQ=255) aaCGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCgg < 1:691752/236‑1 (MQ=255) tGGTGCTCTATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAgc < 1:530962/186‑1 (MQ=255) 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gCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATtgctgc < 1:1481362/235‑1 (MQ=255) ataggcaaacctggccaccgccgcgcgctcgacatccagctcgccaggcaactggccccggcgtacggcattggccagcgccagggtgatgcccttgtggcaatccagcaccgcactctggcgctgGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTc < 2:496149‑M2/45‑1 (MQ=255) cccGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGc < 1:696400/225‑1 (MQ=255) ccGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAgtg > 1:465837/1‑236 (MQ=255) gtcgtATCAATGAAACCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGCCATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTc < 1:261969/236‑1 (MQ=255) gacatccagctcgccaggcaactggccccggcgtacggcattggcCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCAGGTTTGCCTAt < 2:496149‑M1/126‑1 (MQ=255) cATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGAt < 2:547847/219‑1 (MQ=255) acatccagctcgccaggcaactggccccggcgtacggcattggcCCGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACCAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCgggg < 1:1026960‑M1/71‑1 (MQ=255) tCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCATCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGtt < 2:1120673/222‑1 (MQ=255) cacaAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCgg < 2:590312/185‑1 (MQ=255) cacaAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTa > 2:1159838/1‑195 (MQ=255) cacaAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTAGTGCTGCCTGACAGTGTCGTTCTGTTGGGTGAt > 1:130062/1‑228 (MQ=255) 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aaTTCGCCAGCAGCGCCCGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCt < 1:290651/147‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTc < 1:1062583/179‑1 (MQ=255) cattggcCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGGGTCGATCTGTTGGGTGATGTcgaaaaagt < 1:142329‑M1/197‑3 (MQ=255) gCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATtgct < 2:329408/163‑1 (MQ=255) agcagcgccagggtgatgcccttgtggcaatccagcaccgcactctggcgctgGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTc < 1:541970‑M2/120‑1 (MQ=255) agcagcgccagggtgatgcccttgtggcaatccagcaccgcactctggcgctgGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTc > 2:541968‑M2/54‑173 (MQ=255) agcagcGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGat > 2:1320711/1‑218 (MQ=255) CAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCg > 2:1185114‑M1/1‑234 (MQ=255) CGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCggg < 2:232491‑M1/141‑1 (MQ=255) GCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTTGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTg < 2:1441775‑M1/209‑1 (MQ=255) CAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGc > 2:831136‑M1/1‑145 (MQ=255) CAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGc < 1:831138‑M1/145‑1 (MQ=255) agTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCg < 1:1373776/225‑1 (MQ=255) tGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCa > 2:1296884/1‑228 (MQ=255) tGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGacac > 1:683483/1‑236 (MQ=255) tGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGacac < 2:997876/187‑1 (MQ=255) tGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGacac > 1:997878/1‑187 (MQ=255) ggATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACttt < 1:1353209/235‑1 (MQ=255) aTTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGtt < 1:1082204/236‑1 (MQ=255) ttGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGtt < 1:745023/235‑1 (MQ=255) cagCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTggg < 2:130061/157‑1 (MQ=255) tGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTaa > 1:806714/1‑236 (MQ=255) ccACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAg > 1:1126061/1‑235 (MQ=255) caAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGc > 2:897573/1‑37 (MQ=255) caAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGGTCTGTTGGGTg > 2:320155/1‑155 (MQ=255) caAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCaacc > 2:745021/1‑216 (MQ=255) caAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAACTGACACTTTGTTAAGGAtt > 1:232628/1‑236 (MQ=255) caAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGac > 2:1421374/1‑221 (MQ=255) caAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGAtt > 1:59149/1‑236 (MQ=255) ggCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATtgtg < 1:1129754/235‑1 (MQ=255) ggCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATtgtg < 1:858368/235‑1 (MQ=255) gaaTCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGa < 2:1107277/213‑1 (MQ=255) tCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATg < 2:1215356/211‑1 (MQ=255) aCCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAACTGGGTCGACACCGGGCTg > 1:1088890/1‑174 (MQ=255) aCCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCg > 2:1381245/1‑195 (MQ=255) cgggcgctgGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGac < 1:286454‑M2/199‑1 (MQ=255) gcgctgGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTcc < 1:603294‑M2/230‑1 (MQ=255) cgctgGCCAATGCCGTACGCTGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGCCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCg < 1:1346301‑M2/183‑1 (MQ=255) cgctgGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATtgctgc > 2:657971‑M2/6‑114 (MQ=255) ctgGCCAATGCCGTACGCCGGGGTCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCt < 1:36253‑M2/233‑1 (MQ=255) cggGCCAAGGCCGTACGCCGGGGCAAGTGGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGaa < 2:72656‑M2/141‑1 (MQ=255) gCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGa < 2:588293/218‑1 (MQ=255) | AGACCCATGACCATTTGGCGCGCGCGAGCGAAAGCGAGGATGAACTCGACCCGCTTGGCTGCATGCGCAAGCTGCTGTTGCAAGTGTTTAACGAGCTGGTGCTCGATGCCCGAACCCGTCGTATCAATGAAATCCTGCATCACAAGTGCGAGTTCACCGATGACATGTGTGAAATTCGCCAGCAGCGCCAGAGTGCGGTGCTGGATTGCCACAAGGGCATCACCCTGGCGCTGGCCAATGCCGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTCGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGTGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCGGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCT > AE015451/1583014‑1583479 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |