New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2095608 = | 57 (0.660) | 3 (0.040) | 3/342 | NT | 5.1% | coding (870/1212 nt) | alaA | glutamate‑pyruvate aminotransferase |
? | AE015451 | 2095638 = | 56 (0.680) | coding (840/1212 nt) | alaA | glutamate‑pyruvate aminotransferase |
GAACGCCGTCCCTTGTACGATCAGCAGCTTCTCCGACAGCAGCAGGTCAAGGGCGAACTTCTCGTCGTTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGATGTGCACGGCTTCGTCGTACA > AE015451/2095374‑2095840 | gAACGCCGTCCCTTGTACGATCAGCAGCTTCTCCGACAGCAGCAGGTCAAGGGCGAACTTCTCGTCGTTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAgccgc > 1:1263014/1‑236 (MQ=255) tctccgacgagatctacgacaagatcctgtacgacgaagccgtgcacatcagcaccgcctcgctggctccggacctgctgtgcctgaccttcaacggcttgtccaagtcgtaccgggtggcgggcttccgctctggctggctgatcatttccgggcccaagcaccacgcacacagctacatcgaaggcatcgacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccgGCCCAg > 1:630685‑M1/231‑236 (MQ=255) tccgacgagatctacgacaagatcctgtacgacgaagccgtgcacatcagcaccgcctcgctggctccggacctgctgtgcctgaccttcaacggcttgtccaagtcgtaccgggtggcgggcttccgctctggctggctgatcatttccgggcccaagcaccacgcacacagctacatcgaaggcatcgacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccgGCCCAgc < 1:669052‑M1/7‑1 (MQ=255) cccTTGTACGATCAGCAGCTTCTCCGACAGCAGCAGGTCAAGGGCGAACTTCTCGTCGTTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGcgcg > 1:982742/1‑235 (MQ=255) cTTGTACGATCAGCAGCTTCTCCGACAGCAGCAGGTCAAGGGCGAACTTCTCGTCGTTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTc > 1:380754/1‑236 (MQ=255) cagcagCTTCTCCGACAGCAGCAGGTCAAGGGCGAACTTCTCGTCGTTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCAt > 1:785552/1‑236 (MQ=255) gcagcTTCTCCGACAGCAGCAGGTCAAGGGCGAACTTCTCGTCGTTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATg > 1:1398004/1‑235 (MQ=255) cTTCTCCGACAGCAGCAGGTCAAGGGCGAACTTCTCGTCGTTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTgg > 2:1266587/1‑235 (MQ=255) agGTCAAGGGCGAACTTCTCGTCGTTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCGGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTTgc < 2:805027/233‑1 (MQ=255) cgcaccgcctcgctggctccggacctgctgtgcctgaccttcaacggcttgtccaagtcgtaccgggtggcgggcttccgctctggctggctgatcatttccgggcccaagcaccacgcacacagctacatcgaaggcatcgacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccgGCCCAg > 2:58113‑M1/181‑186 (MQ=255) gcaccgcctcgctggctccggacctgctgtgcctgaccttcaacggcttgtccaagtcgtaccgggtggcgggcttccgctctggctggctgatcatttccgggcccaagcaccacgcacacagctacatggaaggcatcgacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccgGCCCAg > 1:191830‑M1/180‑185 (MQ=255) gtcgtTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAg > 2:1453731/1‑234 (MQ=255) cgctggctccggacctgctgtgcctgaccttcaacggcttgtccaagtcgtaccgggtggcgggcttccgctctggctggctgatcatttccgggcccaagcaccacgcacacagctacatcgaaggcatcgacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccgg < 1:727341‑M1/1‑1 (MQ=255) cgctggctccggacctgctgtgcctgaccttcaacggcttgtccaagtcgtaccgggtggcgggcttccgctctggctggctgatcatttccgggcccaagcaccacgcacacagctacatcgaaggcatcgacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccgg > 2:727339‑M1/171‑171 (MQ=255) gCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTc > 2:989173/1‑234 (MQ=255) aaaCCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCa > 2:527400/1‑159 (MQ=255) aaaCCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATg > 1:999705/1‑236 (MQ=255) gaccttcaacggcttgtccaagtcgtaccgggtggcgggcttccgctctggctggctgatcatttccgggcccaagcaccacgcacacagctacatcgaaggcatcgacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccgGCCCAg > 2:1073109‑M1/146‑151 (MQ=255) gaccttcaacggcttgtccaagtcgtaccgggtggcgggcttccgctctggctggctgatcatttccgggcccaagcaccacgcacacagctacatcgaaggcatcgacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccgGCCCAg < 1:1073112‑M1/6‑1 (MQ=255) tCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCtgtg > 2:1306880/1‑233 (MQ=255) cgcgGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATg > 1:1329/1‑210 (MQ=255) gtccaagtcgtaccgggtggcgggcttccgccctggctggctgatcatttccgggcccaagcaccacgcacacagctacatcgaaggcatcgacattctggccaacatgcgcctgtgcgccaacctgccgg < 1:1142127‑M1/1‑1 (MQ=255) gcgcgcCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAAt > 1:431885/1‑235 (MQ=255) cgcCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGcc > 2:794452/1‑179 (MQ=255) gcCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGCCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGAt > 2:1175687/1‑234 (MQ=255) ccATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAg > 1:1361345/1‑121 (MQ=255) ccATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAg < 2:1361342/121‑1 (MQ=255) ccATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGACATGATcagc > 1:397223/1‑236 (MQ=255) aTCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATg > 1:895557/1‑168 (MQ=255) aTCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATg < 2:895555/168‑1 (MQ=255) aTCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATcagcca > 1:792682/1‑236 (MQ=255) cGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATg < 2:58299/170‑1 (MQ=255) aGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGaa > 2:300458/1‑235 (MQ=255) tGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTAc > 1:906659/1‑236 (MQ=255) tGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGAGCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGc > 1:1268938/1‑226 (MQ=255) cGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTa > 2:1487749/1‑232 (MQ=255) aGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACa > 1:1030104/1‑235 (MQ=255) aGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTGCGATGGAGCTGGGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAACTGCTcag > 1:258426/1‑194 (MQ=255) aGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCAGGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGAt > 2:307325/1‑155 (MQ=255) cGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGCAGTGATCAGCCCGCCAGAGCGGaa > 2:152845/1‑205 (MQ=255) gTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGt > 1:1115627/1‑236 (MQ=255) ggTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGt > 2:757599/1‑235 (MQ=255) gTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTc < 1:633558/235‑1 (MQ=255) ttGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCGAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGCTg > 2:378425/1‑117 (MQ=255) ttGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGGAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTc > 2:1368118/1‑234 (MQ=255) ttGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGccc > 2:996049/1‑198 (MQ=255) ttGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACt > 1:31990/1‑214 (MQ=255) ttGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGa > 2:882945/1‑229 (MQ=255) ttGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAg > 1:212835/1‑236 (MQ=255) ttGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAg > 1:1427706/1‑236 (MQ=255) gcgcTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAgg > 1:1087203/1‑235 (MQ=255) tgctCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTAc < 2:999703/204‑1 (MQ=255) cgaaggcatcgacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccgGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATCTCGAtga < 1:1062590‑M1/74‑2 (MQ=255) aggcatcgacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccgGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCgg < 1:25482‑M1/133‑1 (MQ=255) ggcggcCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGa < 2:982740/213‑1 (MQ=255) gcggcCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTc < 1:959251/217‑1 (MQ=255) atcgacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccgGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGGTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTc < 2:399507‑M1/69‑1 (MQ=255) cccGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGgcgc > 2:210304/1‑90 (MQ=255) cccGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGgcgc < 1:210305/90‑1 (MQ=255) cccGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTTGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACtt > 2:1447745/1‑194 (MQ=255) cccGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCa > 1:1289395/1‑235 (MQ=255) cccGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAg < 1:1306883/236‑1 (MQ=255) cggcggCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCg < 1:1373374/236‑1 (MQ=255) cggcggCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCg < 1:1368121/236‑1 (MQ=255) ggcAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTc > 1:515088/1‑207 (MQ=255) ccAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCg < 1:1106569/225‑1 (MQ=255) gTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGAtgt < 1:989175/236‑1 (MQ=255) aTGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTGGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGATGTGCACg > 2:830721/1‑234 (MQ=255) gCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCGGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGATGTGCACGGCt < 1:300460/235‑1 (MQ=255) tctGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCGGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTg < 1:149587/167‑1 (MQ=255) ggTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCgg > 2:739950/1‑147 (MQ=255) gccgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGc > 2:1456334/1‑33 (MQ=255) ccgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGCCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGATGTGCACGGCTTCGTCGTACa < 1:1175690/235‑1 (MQ=255) | GAACGCCGTCCCTTGTACGATCAGCAGCTTCTCCGACAGCAGCAGGTCAAGGGCGAACTTCTCGTCGTTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGATGTGCACGGCTTCGTCGTACA > AE015451/2095374‑2095840 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |