New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | 2095608 = | 57 (0.660) | 3 (0.040) | 3/342 | NT | 5.1% | coding (870/1212 nt) | alaA | glutamate‑pyruvate aminotransferase |
? | AE015451 | 2095638 = | 56 (0.680) | coding (840/1212 nt) | alaA | glutamate‑pyruvate aminotransferase |
AGGTCAAGGGCGAACTTCTCGTCGTTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGATGTGCACGGCTTCGTCGTACAGGATCTTGTCGTAGATCTCGTCGGAGA > AE015451/2095417‑2095867 | agGTCAAGGGCGAACTTCTCGTCGTTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCGGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTTgc < 2:805027/233‑1 (MQ=255) gtcgtTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAg > 2:1453731/1‑234 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cgcgGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATg > 1:1329/1‑210 (MQ=255) gcgcgcCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAAt > 1:431885/1‑235 (MQ=255) cgcCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGcc > 2:794452/1‑179 (MQ=255) gcCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGCCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGAt > 2:1175687/1‑234 (MQ=255) ccATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGACATGATcagc > 1:397223/1‑236 (MQ=255) aTCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATg > 1:895557/1‑168 (MQ=255) aTCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATg < 2:895555/168‑1 (MQ=255) aTCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATcagcca > 1:792682/1‑236 (MQ=255) 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GCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAgg < 2:1054062‑M1/168‑1 (MQ=255) GCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGACAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGATGTGCACGGCTTCGTCGTACAGGATCTTg < 1:841266‑M1/236‑1 (MQ=255) ggggTGTGGAGGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGAc < 2:233689/151‑1 (MQ=255) gcgGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGcaca < 1:723141/175‑1 (MQ=255) gcgGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTg > 2:1476114/1‑201 (MQ=255) cgGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGGGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCg < 2:1427703/192‑1 (MQ=255) tCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGATGTGCACGGCTTCGTCGTACAgg < 2:1263011/224‑1 (MQ=255) gctgggcCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGATGTGCACGGCTTCGTCGTACAGGATCTTGTCGTAGATCTCGTCGga < 1:669052‑M2/228‑1 (MQ=255) ctgggcCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTc > 2:1073109‑M2/7‑151 (MQ=255) ctgggcCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTc < 1:1073112‑M2/145‑1 (MQ=255) ctgggcCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTgcg > 2:58113‑M2/7‑185 (MQ=255) ctgggcCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGATGTGCACGGCTTCGTCGTACAGGATCTTGTCGTAGATCTCGTCGgaga > 1:630685‑M2/7‑236 (MQ=255) ctgggcCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCCATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGc > 1:191830‑M2/7‑185 (MQ=255) cCGGCAGGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGAATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGGGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGAc < 1:1142127‑M2/130‑1 (MQ=255) cCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCg > 2:727339‑M2/2‑171 (MQ=255) cCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCg < 1:727341‑M2/170‑1 (MQ=255) | AGGTCAAGGGCGAACTTCTCGTCGTTGAGGATCGGGCAAACCTTCGGGTCGATCCGCGGGAACGCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGATGTGCACGGCTTCGTCGTACAGGATCTTGTCGTAGATCTCGTCGGAGA > AE015451/2095417‑2095867 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |