| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3056788 = | 71 (0.830) | 6 (0.080) | 6/324 | NT | 8.7% | coding (560/990 nt) | PP_2669 | putative Outer membrane protein |
| ? | AE015451 | 3056804 = | 61 (0.780) | coding (544/990 nt) | PP_2669 | putative Outer membrane protein | |||||
ATCGATCACTGCCACGTGGTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGC > AE015451/3056556‑3057007 | aTCGATCACTGCCACGTGGTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGgcg > 1:396977/1‑234 (MQ=255) aTCACTGCCGCGTGGTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTc < 1:316615/236‑1 (MQ=255) aTCACTGCCACGTGGTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTc < 1:1463706/236‑1 (MQ=255) ccACGTGGTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGAcccg > 2:878926/1‑233 (MQ=255) cACGTGGTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGc < 1:759943/235‑1 (MQ=255) ggTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCt > 1:20511/1‑235 (MQ=255) ggTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCt > 1:401786/1‑235 (MQ=255) gCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCg < 2:1008549/234‑1 (MQ=255) gCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAggg < 1:878928/236‑1 (MQ=255) aGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTgg < 1:954686/236‑1 (MQ=255) aGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTc < 1:1515440/214‑1 (MQ=255) ggaCTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCg < 1:1434554/233‑1 (MQ=255) aCTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATc < 1:321608/236‑1 (MQ=255) ccATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAg > 2:535386/1‑234 (MQ=255) cATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTgc > 1:700930/1‑236 (MQ=255) gcgcTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTc < 1:1188374/182‑1 (MQ=255) gAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACCCCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGGCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCCCAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTc < 2:446872/177‑1 (MQ=255) tGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGtt < 1:1084262/236‑1 (MQ=255) gtgatcgacaccgtcaccgacaaggtgctcgggcagatcgaagtcggcatcgaacccgaaggcatggcggtcagccccgacggcaagtgggcggtcaacaccagcgaaaccaccaacatgctgcactggatcgacaccagcacccagaccctggccgacagcac < 2:91959‑M1/1‑1 (MQ=255) ggctggACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAg > 1:217954/1‑167 (MQ=255) ggACTTTGTCCGGGTGCACCCCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCa < 2:1447450/202‑1 (MQ=255) gACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTtggt < 2:1101293/216‑1 (MQ=255) cGGGTGCACACCCTTGAGCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTgg < 1:59521/182‑1 (MQ=255) tGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTc > 1:876914/1‑236 (MQ=255) acCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGTCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTtggt < 2:1307693/198‑1 (MQ=255) ttGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCGCGTCGAGTATGGTGACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGtt < 1:379603/209‑1 (MQ=255) aTCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCCGGGTCTGGG‑TGCTg > 2:425705/1‑165 (MQ=255) aTCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGGTTGCTGGTGTCGATCCAGTgcagc > 2:597111/1‑184 (MQ=255) cTGGAAGTTCAGTGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCa < 1:20959/213‑1 (MQ=255) tGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCAt > 1:1329367/1‑236 (MQ=255) aaGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTc < 2:1015552/140‑1 (MQ=255) gTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCg > 2:1206337/1‑139 (MQ=255) gTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCg < 1:1206340/139‑1 (MQ=255) gTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCt > 1:1277462/1‑235 (MQ=255) ttCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTc > 1:1447506/1‑147 (MQ=255) acccgaaggcatggcggtcagccccgacggcaagtgggcggtcaacaccagcgaaaccaccaacatgctgcactggatcgacaccagcacccagaccctggccgacagcaCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTg > 2:1507377‑M1/111‑166 (MQ=255) ggTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGgtg > 2:921413/1‑154 (MQ=255) ggTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCggg > 2:1468501/1‑234 (MQ=255) ggTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGt > 1:500601/1‑235 (MQ=255) ttCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCgg < 2:1465488/130‑1 (MQ=255) aCCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCg < 1:1192506/234‑1 (MQ=255) gcgcGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGGCTGGG‑TGCTGGTGTCGATc > 2:1195229/1‑145 (MQ=255) gcgTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCg > 2:1410152/1‑233 (MQ=255) gcgTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGGGTCGATCCAGTGCAGCCTGTTGGTGGTTTCGCTGGTGtt > 2:174015/1‑175 (MQ=255) aGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGa < 2:504875/208‑1 (MQ=255) ggTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGgtgac > 1:266321/1‑118 (MQ=255) gTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCgg < 1:1046409/235‑1 (MQ=255) aacaccagcgaaaccaccaacatgctgcactggatcgacaccagcacccagaccctggccgacagcaCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGa > 2:769138‑M1/68‑152 (MQ=255) gTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCGTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTc < 2:1505803/89‑1 (MQ=255) tGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGgt > 1:561368/1‑235 (MQ=255) tGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTCGTCGACCAGCGCGCTGTCGGCCAgg > 2:128675/1‑95 (MQ=255) gccgccGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGTCCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGCCTTCGATCTGCCCGAGCGCCTTGTCgg > 1:358424/1‑227 (MQ=255) ccgccgATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCg > 2:617692/1‑204 (MQ=255) ccgccgATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCg > 1:1077778/1‑225 (MQ=255) ccgccgATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTc > 1:214145/1‑236 (MQ=255) ccgATTTCTGCCGAGGCCCATAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGAt < 1:96471/236‑1 (MQ=255) ccgATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCt > 2:1377748/1‑180 (MQ=255) cgATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATc < 1:612136/236‑1 (MQ=255) cgATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCCGGTCGACCAGc > 1:311475/1‑74 (MQ=255) tttCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCACCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCt < 2:1214896/97‑1 (MQ=255) accaacatgctgcactggatcgacaccagcacccagaccctggccgacagcaCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCa < 1:1311141‑M1/184‑1 (MQ=255) cacaGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATc > 1:899294/1‑236 (MQ=255) caGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGGTTGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATc < 1:597113/235‑1 (MQ=255) gcgcGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTgg > 2:890281/1‑80 (MQ=255) gcgcGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTgg < 1:890283/80‑1 (MQ=255) cgACCCGTCTTTGCTGAGCTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCgggg < 2:270711/139‑1 (MQ=255) cgAACCGTCTTTGCTGAACGCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGa < 2:53968/164‑1 (MQ=255) aCCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAgcgcct > 1:20466/1‑222 (MQ=255) aCCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCt > 2:1390360/1‑230 (MQ=255) aCCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCt < 1:1390363/230‑1 (MQ=255) aCCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGtt > 2:1310124/1‑234 (MQ=255) ttGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCg > 2:707564/1‑153 (MQ=255) ttGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGccc > 2:28856/1‑173 (MQ=255) cccagaccctggccgacagcaCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGc < 2:1374900‑M1/113‑1 (MQ=255) tGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATAcagc < 1:535388/236‑1 (MQ=255) caCTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGtt < 2:238283/89‑1 (MQ=255) accctggccgacagcaCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATAcagccagc < 1:730650‑M1/220‑1 (MQ=255) ggccgacagcaCGCTGGTGGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCt > 1:1374903‑M1/12‑210 (MQ=255) cgcgGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGc < 2:1137401/103‑1 (MQ=255) | ATCGATCACTGCCACGTGGTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGC > AE015451/3056556‑3057007 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |