| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3056788 = | 71 (0.830) | 6 (0.080) | 6/324 | NT | 8.7% | coding (560/990 nt) | PP_2669 | putative Outer membrane protein |
| ? | AE015451 | 3056804 = | 61 (0.780) | coding (544/990 nt) | PP_2669 | putative Outer membrane protein | |||||
GGTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGC > AE015451/3056573‑3057007 | ggTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCt > 1:20511/1‑235 (MQ=255)ggTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCt > 1:401786/1‑235 (MQ=255) gCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCg < 2:1008549/234‑1 (MQ=255) gCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAggg < 1:878928/236‑1 (MQ=255) gctggctgtatgtatcaaacgaggacgatgcgctggtgacggtgatcgacaccgtcaccgacaaggtgctcgggcagatcgaagtcggcatcgaacccgaaggcatggcggtcagccccgacggcaagtgggcggtcaacaccagcgaaaccaccaacatgctgcactggatcgacaccagcacccagaccctggccgacagcacgctggtcgaccagcgTGCTGTCGGCCAGGGt < 1:730650‑M2/16‑1 (MQ=255) aGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTgg < 1:954686/236‑1 (MQ=255) aGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTc < 1:1515440/214‑1 (MQ=255) ggaCTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCg < 1:1434554/233‑1 (MQ=255) aCTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATc < 1:321608/236‑1 (MQ=255) aggacgatgcgctggtgacggtgatcgacaccgtcaccgacaaggtgctcgggcagatcgaagtcggcatcgaacccgaaggcatggcggtcagccccgacggcaagtgggcggtcaacaccagcgaaaccaccaacatgctgcactggatcgacaccagcacccagaccctggccgacagcacgctggtccaccagcgTGCTGTCGGcc > 1:1374903‑M2/200‑210 (MQ=255) ccATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAg > 2:535386/1‑234 (MQ=255) cATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTgc > 1:700930/1‑236 (MQ=255) tgacggtgatcgacaccgtcaccgacaaggtgctcgggcagatcgaagtcggcatcgaacccgaaggcatggcggtcagccccgacggcaagtgggcggtcaacaccagcgaaaccaccaacatgctgcactggatcgacaccagcacccagaccctggccgacagcacgctggtcgaccagcgTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTtggt < 1:1311141‑M2/52‑1 (MQ=255) tGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGtt < 1:1084262/236‑1 (MQ=255) ggACTTTGTCCGGGTGCACCCCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCa < 2:1447450/202‑1 (MQ=255) gACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTtggt < 2:1101293/216‑1 (MQ=255) cGGGTGCACACCCTTGAGCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTgg < 1:59521/182‑1 (MQ=255) tGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTc > 1:876914/1‑236 (MQ=255) acCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGTCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTtggt < 2:1307693/198‑1 (MQ=255) ttGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCGCGTCGAGTATGGTGACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGtt < 1:379603/209‑1 (MQ=255) aTCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCCGGGTCTGGG‑TGCTg > 2:425705/1‑165 (MQ=255) aTCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGGTTGCTGGTGTCGATCCAGTgcagc > 2:597111/1‑184 (MQ=255) cTGGAAGTTCAGTGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCa < 1:20959/213‑1 (MQ=255) 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cgAACCGTCTTTGCTGAACGCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGa < 2:53968/164‑1 (MQ=255) aCCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAgcgcct > 1:20466/1‑222 (MQ=255) aCCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCt < 1:1390363/230‑1 (MQ=255) aCCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCt > 2:1390360/1‑230 (MQ=255) aCCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGtt > 2:1310124/1‑234 (MQ=255) ttGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCg > 2:707564/1‑153 (MQ=255) ttGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGccc > 2:28856/1‑173 (MQ=255) cccagaccctggccgacagcaCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGc < 2:1374900‑M1/113‑1 (MQ=255) tGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATAcagc < 1:535388/236‑1 (MQ=255) caCTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGtt < 2:238283/89‑1 (MQ=255) accctggccgacagcaCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATAcagccagc < 1:730650‑M1/220‑1 (MQ=255) ggccgacagcaCGCTGGTGGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCt > 1:1374903‑M1/12‑210 (MQ=255) cgcgGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGc < 2:1137401/103‑1 (MQ=255) cgGGTCGACCGGTGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCGGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGcc > 2:369554‑M1/3‑132 (MQ=255) GTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAgc > 1:628‑M1/1‑184 (MQ=255) gTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCAc < 2:91959‑M2/163‑1 (MQ=255) | GGTTGGCCGGGCCCAAGGCGACGAAGGCGTACTTGCCATCGGCGCTGAGCTTGATGCCCACTGGCTGGACTTTGTCCGGGTGCACACCCTTGATCTGGAAGTTCAGGGTTTTCAGCACCTGGCGCGTGGTCACGTCGAGTATGGTCACCGTGCCGCCGATTTCTGCCGAGGCCCACAGGCGCGAACCGTCTTTGCTGAACTCGACGAAGCGCGGGCGCTGGTCGACCAGCGTGCTGTCGGCCAGGGTCTGGG‑TGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGACGGTGTCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGC > AE015451/3056573‑3057007 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |