| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3940056 = | 81 (0.940) | 5 (0.060) | 4/342 | NT | 6.1% | coding (219/414 nt) | csgF | curli secretion and assembly outer membrane associated component |
| ? | AE015451 | 3940101 = | 75 (0.910) | coding (174/414 nt) | csgF | curli secretion and assembly outer membrane associated component | |||||
ATGGTGTTCTCTCCCCAACATAAAAGCCCTTCCCTCTCAGGGGTTCAGGCCGCTGACCTCAATGATCGAAATTTCTCCTGTGGCACGATCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAGGCGGCAATGCAACGTGGAATGCGGTGGTTCATAGCTCGTCCCT > AE015451/3939825‑3940285 | tcaacgcaagctgcaacgcctgctacaggacaccaccgacttggagagggacgagctatgaaccaccgcattccacgttgcattgccgcctgcctgctggccagcgcctgtgctgcccaggccaccgagctggtgtacaccccggtcaacccggcctttggcggcaacccgttgaacggcacctggctgctgaacaacgcccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCTCaa > 1:1189640‑M1/232‑236 (MQ=255) gtgtTCTCTCCCCAACATAAAAGCCCTTCCCTCTCAGGGGTTCAGGCCGCTGACCTCAATGATCGAAATTTCTCCTGTGGCACGATCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAggg < 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aGCCCTTCCCTCTCAGGGGTTCAGGCCGCTGACCTCAATGATCGAAATTTCTCCTGTGGCACGATCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCt > 2:169694/1‑209 (MQ=255) cccTTCCCTCTCAGGGGTTCAGGCCGCTGACCTCAATGATCGAAATTTCTCCTGTGGCACGATCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTAGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAg < 1:322574/236‑1 (MQ=255) aggacaccaccgacttggagagggacgagctatgaaccaccgcattccacgttgcattgccgcctgcctgctggccagcgcctgtgctgcccaggccaccgagctggtgtacaccccggtcaacccggcctttggcggcaacccgttgaacggcacctggctgctgaacaacgcccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCTCAAGGGCCgtg > 1:898996‑M1/206‑218 (MQ=255) ccTTCCCTCTCAGGGGTTCAGGCCGCTGACCTCAATGATCGAAATTTCTCCTGTGGCACGATCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAgg < 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cTGTGGCACGATCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCa < 2:121607/188‑1 (MQ=255) gCACGATCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTcc < 2:524745/198‑1 (MQ=255) cACGATCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcag > 1:697181/1‑235 (MQ=255) gATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGGCGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCGAGCAACGGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTcc < 1:821404/181‑1 (MQ=255) 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ggctgctgaacaacgcccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTgccgcc < 1:1251613‑M1/117‑1 (MQ=255) ggctgctgaacaacgcccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGCTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGGTgccgcc < 1:466634‑M1/117‑1 (MQ=255) cAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCggt > 1:403086/1‑171 (MQ=255) cAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGcaggcaggag > 1:99889/1‑233 (MQ=255) cAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAggcg > 1:1313899/1‑235 (MQ=255) aGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCgttgt < 2:818654/127‑1 (MQ=255) aGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCgttgt > 1:818656/1‑127 (MQ=255) tGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAg < 1:60028/132‑1 (MQ=255) tGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAGGCGGCAATGCa < 1:1148950/236‑1 (MQ=255) gggACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGa < 1:420098/166‑1 (MQ=255) acaacaTCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGa > 2:1164027/1‑165 (MQ=255) acaacaTCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGa < 1:1164030/165‑1 (MQ=255) aacaTCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAGGCGGCAATGCAACGTg < 1:169695/235‑1 (MQ=255) ccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCg < 1:337554‑M1/100‑1 (MQ=255) caTCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGGGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCggg < 1:80148/166‑1 (MQ=255) tCCGCGCCTCAAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCaa < 2:1112225/147‑1 (MQ=255) ccGCGCCTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAgcaggc < 1:334938/212‑1 (MQ=255) ccGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCaaa < 2:790615/147‑1 (MQ=255) 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gTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAGGCGGCAATGCAACGTGGAATGCGGTGGTTCATAGCTc < 1:358304/236‑1 (MQ=255) ttGCGGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTACGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAGGCGGCAATGCAACGTGGAATGCGGTGGTTCATAGCTCg < 1:351232/236‑1 (MQ=255) gCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAGGCGGCAATGCAACGTGGAATGCGGTGGTTCATAGCTCg < 1:1079565/234‑1 (MQ=255) tGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGgca < 2:1012600/170‑1 (MQ=255) aaGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAGGCGGCAATGCAACGTGGAATGCGGTGGTTCATAGCTCGTCCct < 1:149897/235‑1 (MQ=255) cgcTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGgcag > 2:1495275/1‑166 (MQ=255) | ATGGTGTTCTCTCCCCAACATAAAAGCCCTTCCCTCTCAGGGGTTCAGGCCGCTGACCTCAATGATCGAAATTTCTCCTGTGGCACGATCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAGGCGGCAATGCAACGTGGAATGCGGTGGTTCATAGCTCGTCCCT > AE015451/3939825‑3940285 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |