| New junction evidence | |||||||||||
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CTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCGT > AE015451/4024904‑4025372 | cgaagtggccttgcagtccgccgaagccaagctggcacgcagcgtgcggcaggtgcgcgggctttacagcaacgtcgactcgctgaaggctcaactggaaacgcgccaagccgaactgcgcaaggcgcaacaggacttcaaccggcgcaaggtgctggctgacagcggtgcgattgccgcagaagaactgtcccacgcccgtgacgacctgagcgttgcccaggctgccgtcaaCa > 1:641269‑M1/235‑236 (MQ=255) 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aTCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCcgcg > 1:711711/1‑236 (MQ=255) aTCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACAAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCcgc > 1:82871/1‑235 (MQ=255) acacCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAgcgc > 2:498956/1‑202 (MQ=255) cAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGAc > 1:300182/1‑228 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |