New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 4025138 = | 53 (0.620) | 3 (0.040) | 3/340 | NT | 5.8% | coding (561/1194 nt) | emrA | multidrug efflux transport system ‑ membrane fusion protein |
? | AE015451 | 4025175 = | 47 (0.570) | coding (524/1194 nt) | emrA | multidrug efflux transport system ‑ membrane fusion protein |
CAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCGTGCCAGCTTGGCTTCGGCGGACTGCAAGGCCACTTCGCT > AE015451/4024952‑4025410 | cAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGAc > 1:300182/1‑228 (MQ=255) cAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCt > 1:792908/1‑236 (MQ=255) cAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCt > 1:854905/1‑236 (MQ=255) cAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTAGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTg < 2:841237/226‑1 (MQ=255) cAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCAGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGc > 1:1501625/1‑234 (MQ=255) aCCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCt < 1:1009154/236‑1 (MQ=255) cgGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGt > 1:340201/1‑201 (MQ=255) gTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGc > 1:1269305/1‑236 (MQ=255) gactcgctgaaggctcaactggaaacgcgccaagccgaactgcgcaaggcgcaacaggacttcaaccggcgcaaggtgctggctgacagcggtgcgattgccgcagaagaactgtcccacgcccgtgacgacctgagcgttgcccaggctgccgtcaacagcgcgcggcaacagctcagcaccagcagcgcgctgTTGAc < 1:45671‑M2/5‑1 (MQ=255) ggCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGa > 1:1412789/1‑236 (MQ=255) gCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTgg > 1:488391/1‑233 (MQ=255) gcgcTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGttct > 1:642158/1‑235 (MQ=255) gTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGgtc > 1:296206/1‑194 (MQ=255) gCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTcagc > 1:241168/1‑225 (MQ=255) gcGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACAGCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGc < 2:447286/135‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCGGGAGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCg < 2:1224002/197‑1 (MQ=255) gtggtgCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGgtcgt < 2:287116/157‑1 (MQ=255) tggtgCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCgg < 2:863948/183‑1 (MQ=255) ggtgCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGCGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGtt > 1:78548/1‑230 (MQ=255) gggCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTgcg > 1:1245420/1‑235 (MQ=255) gTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATc > 2:1240483/1‑178 (MQ=255) ggTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACAACGCGGTGCGAAGACACCACGAGGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGCGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGa > 2:564739/1‑117 (MQ=255) ctgacagcggtgcgattgccgcagaagaactgtcccacgcccgtgacgacctgagcgttgcccaggctgccgtcaaCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGGTCTTCTGCGGCaatag < 1:382239‑M1/101‑3 (MQ=255) gAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGgtcttc > 2:358715/1‑162 (MQ=255) gAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCtt > 1:144973/1‑236 (MQ=255) ctattgccgcagaagacctgtcccacgcccgtgacgacctgagcgttgcccaggctgccgtcaacagcgcgcggcaacagctcagcaccagcagcgcgctgTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTcag < 1:382239‑M2/76‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGtt > 1:1422428/1‑235 (MQ=255) tGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGtt > 2:1030042/1‑234 (MQ=255) ggCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTc > 1:1076868/1‑235 (MQ=255) gcgcAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTgc < 2:1114969/185‑1 (MQ=255) cAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTcagcca > 1:650502/1‑173 (MQ=255) cAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTg > 2:673930/1‑190 (MQ=255) cAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTg < 1:673932/190‑1 (MQ=255) gCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAg > 2:907548/1‑234 (MQ=255) aTGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGt < 2:1115015/232‑1 (MQ=255) aCATCGGGGTGCGAGGACACCCCGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATc < 2:1486197/135‑1 (MQ=255) cGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCTCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGAc < 1:40589/229‑1 (MQ=255) acgacctgagcgttgcccaggctgccgtcaaCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCt < 2:526031‑M1/60‑1 (MQ=255) gTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGcc > 2:290060/1‑175 (MQ=255) gTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTaaa > 1:1099313/1‑236 (MQ=255) agcgttgcccaggctgccgtcaacagcgcgcggcaacagctcagcaccagcagcgcgctgTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGgtcgt < 2:526031‑M2/31‑1 (MQ=255) aGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTaaa > 1:199861/1‑231 (MQ=255) ggACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAACGCCcg > 1:333553/1‑235 (MQ=255) gACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGcgcg > 1:1179043/1‑190 (MQ=255) acGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTg > 1:326330/1‑236 (MQ=255) cGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTCGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGa < 2:823038/210‑1 (MQ=255) cgtcgACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACg > 1:1093345/1‑236 (MQ=255) cgtcgACAAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAAGGCTAAGGTCGTCACGGGCGTGGGGCAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTcagcc > 2:1369924/1‑122 (MQ=255) gtcgACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCAc > 2:1106130/1‑234 (MQ=255) gtcaaCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTc < 1:45671‑M1/195‑1 (MQ=255) aCCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCa > 2:148977/1‑178 (MQ=255) aCCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGt > 2:488282/1‑208 (MQ=255) aCCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCg > 1:53945/1‑236 (MQ=255) CAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCGt < 1:1257370‑M1/235‑1 (MQ=255) GCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGa < 2:243471‑M1/190‑1 (MQ=255) GCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCGTGc < 1:904556‑M1/235‑1 (MQ=255) cgcggcaacagctcagcaccagcagcgcgctgTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGttct < 2:63825‑M2/51‑1 (MQ=255) GCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACg < 1:1292615‑M1/223‑1 (MQ=255) tGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTAAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCGTGCCAGCTTGGCTTcg < 1:498958/236‑1 (MQ=255) tGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCGTGCCAGCTTGGCTTcggcg < 1:425862/236‑1 (MQ=255) cTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCGTGCCAGCTTGGCTTCGGCGGAc > 1:1201090/1‑235 (MQ=255) gTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCAGCGCACCTGCCGCACGCTGCGTGCCAGCTTGGCTTCGGCGAACTGc > 1:1408724/1‑236 (MQ=255) gCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCt > 1:1499827/1‑205 (MQ=255) cgctgTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCGTGCCAGCTTGGCTTCGGCGGACTGCAAGGCCACt > 1:81329‑M2/6‑236 (MQ=255) ctgTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCGTGCCAGCTTGGCTTCGGCGGAc < 2:1071984‑M2/219‑1 (MQ=255) tgTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCGTGCCAGCTTGGCTTCGGCGGACTGCAAGGCCACTTCg > 1:641269‑M2/3‑236 (MQ=255) ttGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCGTGCCAGCTTGGCTTCGGCGGACTGCAAGGCCACTTCGCt > 1:428228/1‑236 (MQ=255) | CAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAACTGGACGGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTGCGAGGACACCACGGTGTCGTCGACCAGCGCGCTGCTGGTGCTGAGCTGTTGCCGCGCGCTGTTGACGGCAGCCTGGGCAACGCTCAGGTCGTCACGGGCGTGGGACAGTTCTTCTGCGGCAATCGCACCGCTGTCAGCCAGCACCTTGCGCCGGTTGAAGTCCTGTTGCGCCTTGCGCAGTTCGGCTTGGCGCGTTTCCAGTTGAGCCTTCAGCGAGTCGACGTTGCTGTAAAGCCCGCGCACCTGCCGCACGCTGCGTGCCAGCTTGGCTTCGGCGGACTGCAAGGCCACTTCGCT > AE015451/4024952‑4025410 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |