| New junction evidence | |||||||||||
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aCTGCCACGGTCGGCACGCCGGAACCGGAGATGCGCTTGGTCACGCTCAGCGCCTGACCACGCGCGCCCAGCGAATAGAGCATGCGCGACGCCGTGTAGAGCCCCGAGTTCATGCAACTTGTCACCGCCACCAGCACCACCAGGTCAACCAGCAACTTGGCGCCCGGCACGTTCAGCACTTCCAGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGccac > 1:1083481/1‑236 (MQ=255) aCTGCCACGGTCGGCACGCCGGAACCGGAGATGCGCTTGGTCACGCTCAGCGCCTGACCACGCGCGCCCAGCGAATAGAGCATGCGCGACGCCGTGTAGAGCCCCGAGTTCATGCAACTTGTCACCGCCACCAGCACCACCAGGTCAACCAGCAACTTGGCGCCCGGCACGTTCAGCACTTCCAGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGcca < 1:381122/235‑1 (MQ=255) cACGGTCGGCACGCCGGAACCGGAGAGGCGCTTGGTCACGCTCAGCGCCTGACCACGCGCGCCCAGCGAATAGAGCATGCGCGACGCCGTGTAGAGCCCCGAGTTCATGCAACTTGTCACCGCCACCAGCACCACCAGGTCAACCAGCAACTTGGCGCCCGGCACGTTCAGCACTTCCAGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAg < 1:239701/234‑1 (MQ=255) 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aGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAAcc < 1:948192/235‑1 (MQ=255) gTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGgc > 2:1390826/1‑121 (MQ=255) gTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTg > 1:22650/1‑146 (MQ=255) cacGCTGTAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAg < 2:243114/52‑1 (MQ=255) cGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTggg < 1:1003891/236‑1 (MQ=255) cTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTggg < 2:771861/234‑1 (MQ=255) tGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCCGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACgag > 2:934156/1‑186 (MQ=255) tGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATGGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGCTGGTGACAATTTCGGCACCga > 2:259737/1‑178 (MQ=255) tGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGTCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCgaagaa > 2:777661/1‑182 (MQ=255) tGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTggg > 2:647984/1‑233 (MQ=255) tGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCACAAGc > 1:316362/1‑213 (MQ=255) tGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGCTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTGGGCgg > 2:463131/1‑142 (MQ=255) gAACGACCCcgggctcaaagcggtagggccgttccagcgtgtactggaagtgctgaacgtgccgggcgccaagttgctggttgacctggtggtgctggtggcggtgacaagttgcatgaactcggggctctacacggcgtcgcgc < 2:894536‑M1/145‑137 (MQ=255) aaCGACCCcgggctcaaagcggtagggtcgttccagcgtgtactggaagtgctgaacgtgccgggcgccaagttgctggttgacctggtggtgctggtggcggtgacaagttgcatgaactcggggctctacacggcggc > 2:386640‑M1/1‑8 (MQ=255) aaCGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTGGGCATGaa > 1:1277579/1‑236 (MQ=255) aaCGACCCCACCGCTTTGAGCCCGGGGCCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGagaag < 2:475966/186‑1 (MQ=255) gACCCcgggctcaaagcggtagggtcgttccagcgtgtactggaagtgctgaacgtgccgggcgccaagttgctggttgacctggtggtgctggtggcggtgacaagttgcatgaactcggggctctacacggcgtcgcgcatgctctattcgctgggcgcgcgtggtcaggcgctgagcgtgaccaagcgcatctccggttccggcgtgccgacc > 2:978209‑M1/1‑5 (MQ=255) aCCCcgggcgcaaagcggtagggtcgttccagcgtgtactggaagtgctgaacgtgccgggcgccaagttgctggttgacctggtggtgctggtggcggtgacaagttgcatgaactcggggctctacacggcgtcgcgcatgctctattcgctgggcgcgcgtggtcaggcgctgagcgtgaccaagcgcatctccggttccggcgtgccgaccgtggcagtgatcttctccacc < 1:340843‑M1/236‑233 (MQ=255) cccTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCgaa < 2:797477/171‑1 (MQ=255) ccTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTGGGCATGAAaccacc < 1:1498257/236‑1 (MQ=255) | GAAGCCCGCCAGGGTGGAGAAGATCACTGCCACGGTCGGCACGCCGGAACCGGAGATGCGCTTGGTCACGCTCAGCGCCTGACCACGCGCGCCCAGCGAATAGAGCATGCGCGACGCCGTGTAGAGCCCCGAGTTCATGCAACTTGTCACCGCCACCAGCACCACCAGGTCAACCAGCAACTTGGCGCCCGGCACGTTCAGCACTTCCAGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTGGGCATGAAACCACC > AE015451/4640759‑4641220 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |