New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | = 4640986 | 72 (0.840) | 5 (0.060) | 5/332 | NT | 6.4% | coding (817/1383 nt) | gabP‑IV | gamma‑aminobutyrate permease |
? | AE015451 | = 4641002 | 79 (0.990) | coding (801/1383 nt) | gabP‑IV | gamma‑aminobutyrate permease |
GGTGGAGAAGATCACTGCCACGGTCGGCACGCCGGAACCGGAGATGCGCTTGGTCACGCTCAGCGCCTGACCACGCGCGCCCAGCGAATAGAGCATGCGCGACGCCGTGTAGAGCCCCGAGTTCATGCAACTTGTCACCGCCACCAGCACCACCAGGTCAACCAGCAACTTGGCGCCCGGCACGTTCAGCACTTCCAGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTGGGCATGAAACCACCGCTGT > AE015451/4640771‑4641225 | ggTGGAGAAGATCACTGCCACGGTCGGCACGCCGGAACCGGAGATGCGCTTGGTCACGCTCAGCGCCTGACCACGCGCGCCCAGCGAATAGAGCATGCGCGACGCCGTGTAGAGCCCCGAGTTCATGCAACTTGTCACCGCCACCAGCACCACCAGGTCAACCAGCAACTTGGCGCCCGGCACGTTCAGCACTTCCAGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGCGCCCGgggt < 1:340843‑M2/236‑5 (MQ=255) aCTGCCACGGTCGGCACGCCGGAACCGGAGATGCGCTTGGTCACGCTCAGCGCCTGACCACGCGCGCCCAGCGAATAGAGCATGCGCGACGCCGTGTAGAGCCCCGAGTTCATGCAACTTGTCACCGCCACCAGCACCACCAGGTCAACCAGCAACTTGGCGCCCGGCACGTTCAGCACTTCCAGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGccac > 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ggTCGGCACGCCGGAACCGGAGATGCGCTTGGTCACGCTCAGCGCCTGACCACGCGCGCCCAGCGAATAGAGCATGCGCGACGCCGTGTAGAGCCCCGAGTTCATGCAACTTGTCACCGCCACCAGCACCACCAGGTCAACCAGCAACTTGGCGCCCGGCACGTTCAGCACTTCCAGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGgggtc > 2:978209‑M2/1‑211 (MQ=255) cGGAGATGCGCTTGGTCACGCTCAGCGCCTGACCACGCGCGCCCAGCGAATAGAGCATGCGCGACGCCGTGTAGAGCCCCGAGTTCATGCAACTTGTCACCGCCACCAGCACCACCAGGTCAACCAGCAACTTGGCGCCCGGCACGTTCAGCACTTCCAGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGAc < 1:77987/236‑1 (MQ=255) gcTTGGTCACGCTCAGCGCCTGACCACGCGCGCCCAGCGAATAGAGCATGCGCGACGCCGTGTAGAGCCCCGAGTTCATGCAACTTGTCACCGCCACCAGCACCACCAGGTCAACCAGCAACTTGGCGCCCGGCACGTTCAGCACTTCCAGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCg < 2:1495383/225‑1 (MQ=255) gCTCAGCGCCTGACCACGCGCGCCCAGCGAATAGAGCATGCGCGACGCCGTGTAGAGCCCCGAGTTCATGCAACTTGTCACCGCCACCAGCACCACCAGGTCAACCAGCAACTTGGCGCCCGGCACGTTCAGCACTTCCAGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGgggtcgttccagcgtgtactggaagtg > 1:421658‑M2/1‑175 (MQ=255) 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cGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTggg < 1:1003891/236‑1 (MQ=255) cTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTggg < 2:771861/234‑1 (MQ=255) tGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCCGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACgag > 2:934156/1‑186 (MQ=255) tGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATGGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGCTGGTGACAATTTCGGCACCga > 2:259737/1‑178 (MQ=255) tGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGTCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCgaagaa > 2:777661/1‑182 (MQ=255) tGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTggg > 2:647984/1‑233 (MQ=255) tGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCACAAGc > 1:316362/1‑213 (MQ=255) tGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGCTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTGGGCgg > 2:463131/1‑142 (MQ=255) aaCGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTGGGCATGaa > 1:1277579/1‑236 (MQ=255) aaCGACCCCACCGCTTTGAGCCCGGGGCCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGagaag < 2:475966/186‑1 (MQ=255) cccTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCgaa < 2:797477/171‑1 (MQ=255) ccTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTGGGCATGAAaccacc < 1:1498257/236‑1 (MQ=255) tACCGCTTTGAGCCCGgggtcgttccagcgtgtactggaagtgctgaacgtgccgggcgccaagttgctggttgacctggtggtgctggtggcggtgacaagttgcatgaactcggggctctacacggcgtcgcgcatgctctattcgctgggcgcgcgtggtcaggcgctgagcgtgaccaagcgcatctccggttccggcgtgccgaccgtggcagtgatcttctccaccctg < 1:637963‑M2/235‑220 (MQ=255) tACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATggc > 1:275544/1‑182 (MQ=255) aCCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGc < 1:682093/189‑1 (MQ=255) ccGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCa < 1:1292215/186‑1 (MQ=255) ccGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTGGGCATGAAacca < 1:961848/230‑1 (MQ=255) ccGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTGGGCATGAAacca > 2:961846/1‑230 (MQ=255) cGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTGGGCATGAAACCACCGCTGt > 1:43609/1‑236 (MQ=255) gCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTacac > 1:1103637/1‑83 (MQ=255) gCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTacac < 2:1103634/83‑1 (MQ=255) cTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGTTGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAAcc > 2:775749/1‑210 (MQ=255) cTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTc < 2:788527/203‑1 (MQ=255) cTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAAcc < 1:775751/210‑1 (MQ=255) tttGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTGGGCATGAAACCACCGCTGt < 2:626264/233‑1 (MQ=255) gAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGGCACCCCCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGt < 2:146951/128‑1 (MQ=255) gCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATg < 1:1315206/62‑1 (MQ=255) gCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATg > 2:1315203/1‑62 (MQ=255) cccGgggtcggtccagcgtggactggaagtgctgaacgtgccgggcgccaagttgctggttgtcctggtggtgctggtggcggt > 2:1154460‑M2/1‑4 (MQ=255) cGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGc < 1:1116680/176‑1 (MQ=255) | GGTGGAGAAGATCACTGCCACGGTCGGCACGCCGGAACCGGAGATGCGCTTGGTCACGCTCAGCGCCTGACCACGCGCGCCCAGCGAATAGAGCATGCGCGACGCCGTGTAGAGCCCCGAGTTCATGCAACTTGTCACCGCCACCAGCACCACCAGGTCAACCAGCAACTTGGCGCCCGGCACGTTCAGCACTTCCAGTACACGCTGGAACGACCCTACCGCTTTGAGCCCGGGGTCGTTCCAGGCCACCAGCGACACCACCAGGAAGATCGACGCCAGGTAGAAGATGGCGATGCGGTACACCACCAGGTTGGTGGCGCGGCGAATCTTGTCTTTCGGGTTGGCGGTTTCGTCAGCCGCGATGGTGACAATTTCGGCACCGAAGAACGAGAAGATGGTGATCAGCACGCCCCCAAGCACCGTCCCAAACCCATTGGGCATGAAACCACCGCTGT > AE015451/4640771‑4641225 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |