New junction evidence | |||||||||||
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CCTTGAGCGAGCGGGAAATCTCGGAAATTTCGTTGGTACGGTTGTCACCGGCCGACCCCGGAATCTGCATCAGCTGCAGGTAGTCGACCATGATCATGGCGATTTCGCCATGCTCACGGGCCAGGCGGCGGGTACGCGCGCGCATTTCCGAGGGGCTGATACCCGCCGTATCGTCGATGAACAATTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGCCTTGTCGGTACGCAGAACGGCGTTTTCCACCAGGTTCATGGCGAAGGTGGTCTTACCCATCGACGGACGACCCGCGACGATGATCAGGTCGGCTGCCTGCAGCCCG > AE015451/5541618‑5542069 | ccTTGAGCGAGCGGGAAATCTCGGAAATTTCGTTGGTACGGTTGTCACCGGCCGACCCCGGAATCTGCATCAGCTGCAGGTAGTCGACCATGATCATGGCGATTTCGCCATGCTCACGGGCCAGGCGGCGGGTACGCGCGCGCATTTCCGAGGGGCTGATACCCGCCGTATCGTCGATGAACAATTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAgtcgtc > 1:329830/1‑235 (MQ=255) cTTGAGCGAGCGGGAAATCTCGGAAATTTCGTTGGTACGGTTGTCACCGGCCGACCCCGGAATCTGCATCAGCTGCAGGTAGTCGACCATGATCATGGCGATTTCGCCATGCTCACGGGCCAGGCGGCGGGTACGCGCGCGCATTTCCGAGGGGCTGATACCCGCCGTATCGTCGATGAACAATTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAgtcgtcg > 1:91665/1‑235 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ccgccgTATCGTCGATGAACAATTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGAGGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGcc < 2:91665/185‑1 (MQ=255) ccgccgTATCGTCGATGAACAATTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAg < 1:189697/178‑1 (MQ=255) ccgccgTATCGGCGATGAACAATTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAgg < 2:366361/167‑1 (MQ=255) cgccgTATCGTCGATGAACAATTTGCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAgg < 2:433525/121‑1 (MQ=255) gTATCGTCGATGAACAATTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACg > 2:391941/1‑89 (MQ=255) gTATCGTCGATGAACAATTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGCCTTGTCGGTACGCAGAACGGCGTTTTCCACCAGGTTCATGGCGAAGGTGGTCt > 2:1511635/1‑232 (MQ=255) gTATCGTCGATGAACAATTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGCCTTGTCGGTACGCAGAACGGCGTTTTCCACCAGGTTCATGGCGAAGGTGGTCTTAcc > 1:1418111/1‑236 (MQ=255) aTCGTCGATGAACAATTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAg < 2:426340/171‑1 (MQ=255) gATGAACAATTTGCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGGGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGc < 2:49764/118‑1 (MQ=255) cAATTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGccc < 1:54471/99‑1 (MQ=255) aTTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGCCTTGTCGGTACGCAGAACGGCGTTTTCCACCAGGTTCATGGCGa < 1:930650/207‑1 (MQ=255) gcGGTCGTTGAGAAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGga < 1:247730/143‑1 (MQ=255) ggTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGa < 2:708173/84‑1 (MQ=255) aGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGCCTTGTCGGTACGCAGAACGGCGTTTTCCACCAGGTTCATGGCGAAGGTGGTCTTACCCATCGACGGACGACCCGCGACGATGATc > 1:975983/1‑234 (MQ=255) tCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGCCTTGTCGGTACGCAGAACGGCGTTTTCCACCAGGTTCATGGCGAAGGTGGTCTTACCCATCGACGGACGACCCGCGACGATGATCAGGTCGGct > 1:411391/1‑236 (MQ=255) ggCCGGGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGCCTTGTCGGTACGCAGAACGGCGTTTTCCACCAGGTTCa < 2:456855/175‑1 (MQ=255) ccGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGCCTTg < 2:303117/140‑1 (MQ=255) tCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGCCTTGTCGGTACGCAGAACGGCGTTTTCCACCAGGTTCATGGCGAAggtgg > 2:1503490/1‑180 (MQ=255) tCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGCCTTGTCGGTACGCAGAACGGCGTTTTCCACCAGGTTCATGGCGAAGGTGGTCTTACCCATCGACGGACGACCCGCCACGATGATCAGGTCGGCTGCCTGCAGcgcg > 1:645699/1‑236 (MQ=255) aGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGCCTTGTCGGTACGCAGAACGGCGTTTTCCACCAGGTTCATGGCGAAGGTGGTCTTACCCATCGACGGACGACCCGCGACGATGATCAGGTCGGCTGCATGCAGCCCg > 2:494412/1‑234 (MQ=255) gcgGCCtcaaaccggcggccctgtgggagtcaacgagctgttgaccatggccatcgaccgcatcgatacgc < 1:1139877‑M1/71‑66 (MQ=255) | CCTTGAGCGAGCGGGAAATCTCGGAAATTTCGTTGGTACGGTTGTCACCGGCCGACCCCGGAATCTGCATCAGCTGCAGGTAGTCGACCATGATCATGGCGATTTCGCCATGCTCACGGGCCAGGCGGCGGGTACGCGCGCGCATTTCCGAGGGGCTGATACCCGCCGTATCGTCGATGAACAATTTTCGGTCGTTGAGCAGGTTCACTGCCGAGGTCAGGCGCGGCCAGTCGTCGTCGTCCAGCTGGCCGGAACGGACCTTGGTCTGGTCGATACGCCCCAGGGACGAAAGCATACGCATGATCAGCGACTCACCTGGCATCTCGAGGGAGAACACCAGCACCGCCTTGTCGGTACGCAGAACGGCGTTTTCCACCAGGTTCATGGCGAAGGTGGTCTTACCCATCGACGGACGACCCGCGACGATGATCAGGTCGGCTGCCTGCAGCCCG > AE015451/5541618‑5542069 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |