New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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TTTCCACCAGGTTCATGGCGAAGGTGGTCTTACCCATCGACGGACGACCCGCGACGATGATCAGGTCGGCTGCCTGCAGCCCGCTGGTCTTCTCGTCCAGGTCGGTGTAACCGGTGGAGATACCGGTGATGTCACTGTCGGAGTTGAACAGCGTATCGATGCGGTCGATGGCCATGGTCAACAGCTCGTTGACGCCCACCGGGCCGCCGGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCATCGTCGAGAATCTCGGCAGCGTTGCGCCCCTGCGGGTTGAACGCGTTGTCGGCGATGTCGGTACTGATGCTGATCAGCTGGCGCAACGTGGCCCGCTCACGAATGATCGCGGCGTAGGCCTTGATGTTGGCCACCGAAGGGGTGTTCTTGGCCAGCTCGGCCAGGTAAGCCAAGCCGCCGACTTGCGA > AE015451/5541987‑5542428 | ttttCACCAGGTTCATGGCGAAGGTGGTCTTACCCATCGACGGACGACCCGCGACGATGATCAGGTCGGCTGCCTGCAGCCCGCTGGTCTTCTCGTCCAGGTCGGTGTAACCGGTGGAGATACCGGTGATGTCACTGTCGGAGTTGAACAGCGTATCGATGCGGTCGATGGCCATGGTCAACAGCTCGTTGACGCCCACCGGGCCGCCGGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTgg < 1:722802/236‑1 (MQ=255) accaGGTTCATGGCGAAGGTGGTCTTACCCATCGACGGACGACCCGCGACGATGATCAGGTCGGCTGCCTGCAGCCCGCTGGTCTTCTCGTCCAGGTCGGTGTAACCGGTGGAGATACCGGTGATGTCACTGTCGGAGTTGAACAGCGTATCGATGCGGTCGATGGCCATGGTCAACAGCTCGTTGACGCCCACCGGGCCGCCGGTTTTa > 2:1128987/1‑210 (MQ=255) 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gAAGGTGGTCTTACCCATCGACGGACGACCCGCGACGATGATCAGGTCGGCTGCCTGCAGCCCGCTGGTCTTCTCGTCCAGGTCGGTGTAACCGGTGGAGATACCGGTGATGTCACTGTCGGAGTTGAACAGCGTATCGATGCGGTCGATGGCCATGGTCAACAGCTCGTTGACGCCCACCGGGCCGCCGGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCAt > 1:792271/1‑236 (MQ=255) tggtCTTACCCATCGACGGACGACCCGCGACGATGATCAGGTCGGCTGCCTGCAGCCCGCTGGTCTTCTCGTCCAGGTCGGTGTAACCGGTGGAGATACCGGTGATGTCACTGTCGGAGTTGAACAGCGTATCGATGCGGTCGATGGCCATGGTCAACAGCTCGTTGACGCCCACCGGGCCGCCGGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCAtcgtc > 1:116916/1‑235 (MQ=255) tggtCTTACCCATCGACGGACGACCCGCGACGATGATCAGGTCGGCTGCCTGCAGCCCGCTGGTCTTCTCGTCCAGGTCGGTGTAACCGGTGGAGATACCGGTGATGTCACTGTCGGAGTTGAACAGCGTATCGATGCGGTCGATGGCCATGGTCAACAGCTCGTTGACGCACACCGGGCCGCCGGGTTTAGGCCGCGCCTCGGCGAt > 1:243453/1‑208 (MQ=255) ttACCCACCGACGGACGACCCGCGACGATGATCAGGTCGGCTGCCTGCAGCCCGCTGGTCTTCTCGTCCAGGTCGGTGTAACCGGTGGAGATACCGGTGATGTCACTGTCGGAGTTGAACAGCGTATCGATGCGGTCGATGGCCATGGTCAACAGCTCGTTGACGCCCACCGGGCCGCCGGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCATCGTCgag < 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gCTCGTTGACGCCCACCGGGCCGCCGGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCATCGTCGAGAATCTCGGCAGCGTTGCGCCCCTGCGGGTTGAACGCGTTGTCGGCGATATCGGTACTGATGCTGATCAGCTGGCGCAACGTGGCCCGCTCACGAATGATCGCGGCGTAGGCCTTGATGTTGGCCACCGAAGGGGTGTTCTTGGCCAGCTCGAcc < 2:804507/233‑1 (MQ=255) tGACGCCCACCGGGCCGCCGGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCATCGTCGAGAATCTCGGCAGCGTTGCGCCCCTGCGGGTTGAACGCGTTGTCGGCGATGTCGGTACTGATGCTGATCAGCTGGCGCAACGTGGCCCGCTCACGAATGATCGCGGCGTAGGCCTTGATGTTGGCCACCGAAGGGGTGTTCTTGGCCAGCTCGGCCAGGTaagcc > 1:504211/1‑236 (MQ=255) tGACGCCCACCGAGCCGCCGGTTTTAggccgcgcctgacctcggcagtgaacctgctcaacgaccgaaaattgttcatcgacgatacggcgggtatcagcccctcggaaatgcgcgcgcgtacccgccgcctggcccgtgagcatggcgaaaccgccatgatca < 1:1437948‑M2/164‑139 (MQ=255) gACGCCCACCGGGCCGCCGGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCATCGTCGAGAATCTCGGCAGCGTTGCGCCCCTGCGGGTTGAACGCGTTGTCGGCGATGTCGGTACTGATGCTGATCAGCTGGCGCAACGTGGCCCGCTCACGAATGATCGCGGCGTAGGCCTTGATGGTGGCCAc > 2:1085660/1‑198 (MQ=255) cGCCCACCGGGCCGCCGGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCATCGTCGAGAATCTCGGCAGCGTTGCGCCCCTGCGGGTTGAACGCGTTGTCGGCGATGTCGGTACTGATGCTGATCCGCTGGCGCac > 1:299624/1‑147 (MQ=255) cGGGCCGCCGGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCATGGTCGAGAATCTCGGCAGCGTTGCGCCCCTGCGGGTTGAACGCGTTGTCGGCGATGTCGGTACTGATGCTGATCAGCTGGCGCAACGTGGCCCGCTCACGAATGATCGCGGCGTAGGCCTTGATGTTGGCCACCGaa < 1:354722/193‑1 (MQ=255) ggCCGCCGGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCATCGTCGAGAATCTCGGCAGCGTTGCGCCCCTGCGGGTTGAACGCGTTGTCGGCGATGTCGGTACTGATGCTGATCAGCTGGCGCAACGTGGCCCGCTCACGAATGATCGCGGCGTAGGCCTTGATGTTGGCCACCGAAGGGGTGTTCTTGGCCAGCTCGGCCAGGTAAGCCAAGCCGCCGACt < 1:1128990/236‑1 (MQ=255) ccgGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCATCGTCGAGAATCTCGGCAGCGTTGCGCCCCTGCGGGTTGAACGCGTTGTCGGCGATGTCGGTACTGATGCTGATCAGCTGGCGCAACGTGGCCCGCTCACGAATGATCGCGGCGTAGGCCTTGATGTTGGCCACCGAAGGGGTGTTCTTGGCCAGCTCGGCCAGGTAAGCCAAGCCGCCGACTTGCGa > 1:716981/1‑236 (MQ=255) ggTTTTAggccgcgcctgacctcggcagtgaacctgctcaacgaccgaaaattgttcatcgacgatacggcgg < 2:442672‑M2/73‑67 (MQ=255) ggTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCATCGTCGAGAATCTCGGCAGCGTTGCGCCCCTGCGGGTTGAACGCGTTGTCGGCGATGTCGGTACTGAGGCTGATCAGCTGGCGCAACGTGGCTCGc > 2:493225/1‑142 (MQ=255) | TTTCCACCAGGTTCATGGCGAAGGTGGTCTTACCCATCGACGGACGACCCGCGACGATGATCAGGTCGGCTGCCTGCAGCCCGCTGGTCTTCTCGTCCAGGTCGGTGTAACCGGTGGAGATACCGGTGATGTCACTGTCGGAGTTGAACAGCGTATCGATGCGGTCGATGGCCATGGTCAACAGCTCGTTGACGCCCACCGGGCCGCCGGTTTTAGGCCGCGCCTCGGCGATCTGGAAGATCTGCCGTTCGGCATCGTCGAGAATCTCGGCAGCGTTGCGCCCCTGCGGGTTGAACGCGTTGTCGGCGATGTCGGTACTGATGCTGATCAGCTGGCGCAACGTGGCCCGCTCACGAATGATCGCGGCGTAGGCCTTGATGTTGGCCACCGAAGGGGTGTTCTTGGCCAGCTCGGCCAGGTAAGCCAAGCCGCCGACTTGCGA > AE015451/5541987‑5542428 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |