New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | 5910238 = | 64 (0.740) | 6 (0.070) | 5/338 | NT | 8.6% | coding (513/1362 nt) | spuC‑II | polyamine:pyruvate transaminase |
? | AE015451 | 5910270 = | 66 (0.810) | coding (481/1362 nt) | spuC‑II | polyamine:pyruvate transaminase |
CTCCTTCACCTTCGGCCAGTAGGTTTCCGGCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGAT > AE015451/5910007‑5910441 | ctcctcCACCTTCGGCCAGTAGGTTTCCGGCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGc < 1:934371/235‑1 (MQ=255) ctacaacctgttcttccagaccgctcacccgcctgcgctcgagctggccaaggcgatcaccgacgtggcgccgaaaggtatgacccatgtgttcttcaccggctccggctccgaaggcaacgacactgtgctgcgcatggtgcgtcactactgggcgctgaagggcaaaccgcacaagcagaccatcatcggccgcatcaacggttaccacggctccaccttcgccgGTGCATGcc > 1:957818‑M1/228‑236 (MQ=255) aCCTTCGGCCAGTAGGTTTCCGGCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCt < 1:1089725/236‑1 (MQ=255) cTTCGGCCAGTAGGTTTCCGGCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTc < 1:1189892/235‑1 (MQ=255) gCCAGTAGGTTTCCGGCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTg > 1:974091/1‑220 (MQ=255) 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ctcGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTGGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGc < 2:31536/206‑1 (MQ=255) gAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCagtagt < 2:1479470/170‑1 (MQ=255) tgcggAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATgcg < 2:337742/169‑1 (MQ=255) ggCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCG‑GGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCgg < 1:1406565/235‑1 (MQ=255) gAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTcggagccgg < 2:665146/198‑1 (MQ=255) aGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCa < 1:338988/236‑1 (MQ=255) aGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGCGACGCACCATGCGCAGCACAGGGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAac > 1:361072/1‑211 (MQ=255) aGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGAATGCACCGGCGCAGGTGGAGCCGt > 2:1351198/1‑92 (MQ=255) gATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACg > 1:876784/1‑235 (MQ=255) gCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTgaagaa > 2:509655/1‑202 (MQ=255) aCGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGAt > 1:660269/1‑236 (MQ=255) cGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCgcagc < 2:883224/161‑1 (MQ=255) cGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTcggagccgg < 2:250823/186‑1 (MQ=255) cccGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGcc < 2:684261/132‑1 (MQ=255) ccGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGGTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACTCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCAACGt > 1:92489/1‑222 (MQ=255) ggATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCAGGCCGTTCATACCGGCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCtt < 2:1154081/106‑1 (MQ=255) aTCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCa < 2:691350/121‑1 (MQ=255) acggctccaccttcgccgGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGGGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGCTTGCCCTTCAGCGGCCa < 2:1087299‑M1/108‑1 (MQ=255) acggctccaccttcgccgGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCAGGCACCGGCGAAGGTGGCGCCCTGGAAACCGTCGATg < 2:1337501‑M1/64‑1 (MQ=255) gCAGGCAACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTc < 2:1258073/154‑1 (MQ=255) ggCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGt > 2:1204909/1‑63 (MQ=255) ggCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGt < 1:1204912/63‑1 (MQ=255) tGCTCGTGCGTGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTCACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCt < 1:1229624/150‑1 (MQ=255) gCTCGTGCGTGCCGCGCCTACCGCCCAGGCATGCAACGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAac < 2:315553/173‑1 (MQ=255) ccgGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCCGTAGTGACGCACCCTGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGCGCCGGCGAAGCACACACGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCgg < 2:452612‑M1/200‑1 (MQ=255) | CTCCTTCACCTTCGGCCAGTAGGTTTCCGGCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGAT > AE015451/5910007‑5910441 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |