| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | 5910238 = | 64 (0.740) | 6 (0.070) | 5/338 | NT | 8.6% | coding (513/1362 nt) | spuC‑II | polyamine:pyruvate transaminase |
| ? | AE015451 | 5910270 = | 66 (0.810) | coding (481/1362 nt) | spuC‑II | polyamine:pyruvate transaminase | |||||
GCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAGCGGTCTGGAAGAACAGGTTGTAGTACGGCAG > AE015451/5910036‑5910504 | gcggGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCg < 1:681878/236‑1 (MQ=255) ggATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGc > 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cccTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAAc < 1:1244517/235‑1 (MQ=255) ccTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCg > 1:1056854/1‑236 (MQ=255) ccgacgtggcgccgaaaggtatgacccgtgtgtgcttcgccggcgccggctccgaaggcaacgacactgtgctgcgcagggtgcgtcactacggggcgctgaagggcaaaccgcacaagcagaccatcatcggccgcatcaacggttaccacggctccaccttcgccggtgcatgcctgggcggtatgagcggcatgcacCgg < 2:452612‑M2/3‑1 (MQ=255) tGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGc < 2:586222/225‑1 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2:1056851‑M1/3‑236 (MQ=255) TGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAGCGGt < 2:890459‑M1/235‑1 (MQ=255) TGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAGCGGTc > 1:990976‑M1/1‑236 (MQ=255) GCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATAcc < 2:620296‑M1/177‑1 (MQ=255) GCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCt < 1:185183‑M1/212‑1 (MQ=255) CGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAac > 1:515828‑M1/1‑161 (MQ=255) CGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAac < 2:515826‑M1/161‑1 (MQ=255) CGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAGCGGTCTg < 1:1236610‑M1/235‑1 (MQ=255) cTCATACCGCCCAGGCATGCCCCgg < 2:801983/25‑1 (MQ=255) cTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAgcg > 1:579590/1‑214 (MQ=255) 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cGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAGCGGTCTGGAAGAACAGGTTGTAGTACGGCAg > 1:1245369/1‑235 (MQ=255) | GCGGGATGATCACGCCACCAGCGCCCTGGATCGGCTCGGCGATGAAGGCCGCGACGTTGTCTTCGCCGACTTCGAGGATCTTCTTCTCCAACTGCTCGGCGGCCCAGACACCGAATTCGTCAGGGGTCATGTCGCCTCCCTCGCCGAACCAGTACGGCTGAGGGATGTGCACGATGCCCGGGATCGGCAGGCCACCCTGCTCGTGCATGCCGCTCATACCGCCCAGGCATGCACCGGCGAAGGTGGAGCCGTGGTAACCGTTGATGCGGCCGATGATGGTCTGCTTGTGCGGTTTGCCCTTCAGCGCCCAGTAGTGACGCACCATGCGCAGCACAGTGTCGTTGCCTTCGGAGCCGGAGCCGGTGAAGAACACATGGGTCATACCTTTCGGCGCCACGTCGGTGATCGCCTTGGCCAGCTCGAGCGCAGGCGGGTGAGCGGTCTGGAAGAACAGGTTGTAGTACGGCAG > AE015451/5910036‑5910504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |