New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 5920565 | 92 (1.070) | 3 (0.040) | 3/346 | NT | 3.3% | coding (1151/1674 nt) | PP_5190 | Type II secretion system protein |
? | AE015451 | = 5920579 | 84 (1.010) | coding (1165/1674 nt) | PP_5190 | Type II secretion system protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
ACCAGTTGCAAGAGGGCTTCGACCGCCTTGGCCTGCACGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTGGGTGTGGCCGACTACCTGATCAAGGCGACGCTTA > AE015451/5920334‑5920798 | gTTGCAGGAGGGCTTCGACCGCCCTGGCCTGCACGGCCAGCAACTGGCCCGATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCcg < 1:167282/236‑1 (MQ=255) ttGCAAGAGGGCTTCGACCGCCTTGGCCTGCACGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCcgc < 1:1021829/236‑1 (MQ=255) ttGCAAGAGGGCTTCGACCGCCTTGGCCTGCACGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCcg < 1:872733/235‑1 (MQ=255) gggCTTCGACCGCCTTGGCCTGCACGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGac < 1:1161268‑M2/235‑3 (MQ=255) gCTTCGACCGCCTTGGCCTGCACGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCcg > 2:502105/1‑225 (MQ=255) tCGACCGCCTTGGCCTGCACGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTg > 2:1232031/1‑215 (MQ=255) ccTTGGCCTGCACGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGcc > 1:417081/1‑235 (MQ=255) ccTGCACGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGc < 2:687716/206‑1 (MQ=255) cccGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTCCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCcg < 2:865285/203‑1 (MQ=255) ggCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGCGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCCGGTGccg > 2:538507/1‑196 (MQ=255) aaCTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCa < 2:562116/190‑1 (MQ=255) cgggCCCAAGGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCACCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCcg < 2:202894/191‑1 (MQ=255) tGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCAtgctg > 2:920478/1‑233 (MQ=255) ccAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAg < 1:920480/236‑1 (MQ=255) cAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGa < 1:1032807/236‑1 (MQ=255) aGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGAcccc < 2:543868/233‑1 (MQ=255) ccTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGAcatc > 1:523460/1‑235 (MQ=255) ccTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGCGCACCATCGCAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTCCAGGTGCACCCcgc > 2:222531/1‑177 (MQ=255) cGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGAt > 1:995319/1‑236 (MQ=255) aaGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACCCCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGacctgcaactggttgaaggctggctccaggcgctcgatcgggtcttcgatggtg > 1:476924‑M2/1‑165 (MQ=255) cTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCa < 2:1319399/143‑1 (MQ=255) cTGCTCCCCGCCCCCACCGGCCCCAGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCcg < 2:267672/148‑1 (MQ=255) cACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGAcccc > 2:1375509/1‑196 (MQ=255) aCCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTgcgc > 2:268197/1‑186 (MQ=255) aCCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCCTGATCg > 2:859780/1‑211 (MQ=255) ccGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCa < 2:94091/177‑1 (MQ=255) cGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAAcgc < 1:171672/165‑1 (MQ=255) ggCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGctct > 1:1208064/1‑236 (MQ=255) ccccACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGcc < 1:1233348/157‑1 (MQ=255) ccccACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGcc > 2:1233345/1‑157 (MQ=255) ccccACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCtgg > 1:32354/1‑236 (MQ=255) ccccACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGT > 2:1458646‑M1/1‑129 (MQ=255) cccACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATccgcgaccgcg < 1:103915/223‑1 (MQ=255) 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ccgCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACGGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGCTCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCa < 2:353836/159‑1 (MQ=255) aGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGacctgcaactggttgaaggctggctccaggcgctcgatcgggtctt > 1:682760‑M2/1‑121 (MQ=255) aGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGacctgcaactggttgaaggctggctccaggcgctcgatcgggtctt < 2:682758‑M2/167‑47 (MQ=255) gCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGc < 1:1410786/236‑1 (MQ=255) acacCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTg > 1:827549/1‑236 (MQ=255) cacCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTgg > 1:1224859/1‑236 (MQ=255) aGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGc > 1:579901/1‑171 (MQ=255) cTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTAt < 1:631577/235‑1 (MQ=255) 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gtgCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTg > 2:1224384/1‑199 (MQ=255) gtgCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCgcagc > 2:1415399/1‑234 (MQ=255) cACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTccagcgcgggctgcacctgcaactggttgaaggctggctccaggcgctcgatcgggtcttcgatggtgcacaggttgacctgtggggtggccagcagtttgaggctggtgtacagcgtgctggtcttgccggagccggtggggccggtgaccaggatgatgcctt > 1:476924‑M1/1‑54 (MQ=255) ccATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCa > 2:1231948/1‑187 (MQ=255) 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cGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGc < 1:1418727/203‑1 (MQ=255) cGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGc > 2:1418724/1‑203 (MQ=255) gAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCGCGCCTTCAACCAGTTGCCGGTGCAGCCCGCGCTGGGCCTGGGGTTTGCCAAcgc < 2:484378/80‑1 (MQ=255) aaGACCCGATCGAGCGCCTGGCGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGCCCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTg < 1:1045052/236‑1 (MQ=255) aaGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTccagcgcgggctgcacctgcaactggttgaaggctggctccaggcgctcgatcgggtcttcgatggtgcacaggttgacctgtggtgtggccagcagtttgaggctggtgtacagcgtgct > 1:682760‑M1/1‑46 (MQ=255) aaGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTccagcgcgggctgcacctgcaactggttgaaggctggctccaggcgctcgatcgggtcttcgatggtgcacaggttgacctgtggtgtggccagcagtttgaggctggtgtacagcgtgct < 2:682758‑M1/167‑122 (MQ=255) aaGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACTGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCt > 1:177795/1‑172 (MQ=255) aaGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTg > 1:103577/1‑236 (MQ=255) gACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGttt < 2:1224856/233‑1 (MQ=255) 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aTCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCg < 2:1353899/186‑1 (MQ=255) cGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTgg > 1:1053186/1‑236 (MQ=255) gAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCAc > 1:15101/1‑171 (MQ=255) gAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTgg > 1:526436/1‑235 (MQ=255) 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ccAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGCCCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGtt > 2:300036/1‑126 (MQ=255) ccAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTGGGTGTGGCCGACTACCt < 1:866734/228‑1 (MQ=255) ttGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTggg < 2:32354/209‑1 (MQ=255) tGCAGGTGCAGACCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCg < 2:1446715/155‑1 (MQ=255) gCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTGGGTGTGGc < 1:505514/213‑1 (MQ=255) gCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTGGGTGTGGc > 2:505512/1‑213 (MQ=255) gaGGTGCAGCCCGCGCTGGACCGGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGGCCGGGCACCTGGTGc < 2:148944/147‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTGGGTGTGGCCGACTACCTGACCAAGGCGACg > 2:577606/1‑234 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |