| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 5920565 | 92 (1.070) | 3 (0.040) | 3/346 | NT | 3.3% | coding (1151/1674 nt) | PP_5190 | Type II secretion system protein |
| ? | AE015451 | = 5920579 | 84 (1.010) | coding (1165/1674 nt) | PP_5190 | Type II secretion system protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGGCTTCGACCGCCTTGGCCTGCACGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTGGGTGTGGCCGACTACCTGATCAAGGCGACG > AE015451/5920347‑5920794 | gggCTTCGACCGCCTTGGCCTGCACGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGac < 1:1161268‑M2/235‑3 (MQ=255) ccTTGGCCTGCACGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGcc > 1:417081/1‑235 (MQ=255) tGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCAtgctg > 2:920478/1‑233 (MQ=255) ccAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAg < 1:920480/236‑1 (MQ=255) cAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGa < 1:1032807/236‑1 (MQ=255) aGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGAcccc < 2:543868/233‑1 (MQ=255) ccTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGAcatc > 1:523460/1‑235 (MQ=255) cGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGAt > 1:995319/1‑236 (MQ=255) aaGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACCCCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGacctgcaactggttgaaggctggctccaggcgctcgatcgggtcttcgatggtg > 1:476924‑M2/1‑165 (MQ=255) cACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGAcccc > 2:1375509/1‑196 (MQ=255) aCCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTgcgc > 2:268197/1‑186 (MQ=255) aCCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCCTGATCg > 2:859780/1‑211 (MQ=255) ccGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCa < 2:94091/177‑1 (MQ=255) cGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAAcgc < 1:171672/165‑1 (MQ=255) ggCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGctct > 1:1208064/1‑236 (MQ=255) ccccACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGcc < 1:1233348/157‑1 (MQ=255) ccccACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGcc > 2:1233345/1‑157 (MQ=255) ccccACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCtgg > 1:32354/1‑236 (MQ=255) cccACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATccgcgaccgcg < 1:103915/223‑1 (MQ=255) ccGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAGCCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCg > 1:937943/1‑236 (MQ=255) ccGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCtggtg > 2:521657/1‑233 (MQ=255) ccgCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACGGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGCTCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCa < 2:353836/159‑1 (MQ=255) aGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGacctgcaactggttgaaggctggctccaggcgctcgatcgggtctt < 2:682758‑M2/167‑47 (MQ=255) aGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGacctgcaactggttgaaggctggctccaggcgctcgatcgggtctt > 1:682760‑M2/1‑121 (MQ=255) gCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGCCCCCGACATCATCATGATCGGCgca > 2:56548/1‑182 (MQ=255) gCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGc < 1:1410786/236‑1 (MQ=255) acacCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTg > 1:827549/1‑236 (MQ=255) cacCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTgg > 1:1224859/1‑236 (MQ=255) 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aaCTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGct > 2:481669/1‑188 (MQ=255) aaCTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCAc < 2:417079/221‑1 (MQ=255) aaCTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCt > 1:714821/1‑223 (MQ=255) aaCTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAAACCCGACCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATCCTGCGCCAAGACCCCg > 2:1139966/1‑147 (MQ=255) aCTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCCCCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAAcgc < 2:126783/117‑1 (MQ=255) gCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAAcc > 2:434315/1‑177 (MQ=255) cTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGAcccc > 2:956747/1‑120 (MQ=255) cTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGAcccc < 1:956749/120‑1 (MQ=255) cTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCGATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCgcag > 2:1024428/1‑235 (MQ=255) 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aaGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTg > 1:103577/1‑236 (MQ=255) gACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGttt < 2:1224856/233‑1 (MQ=255) aCCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATccgcgaccgc > 2:320368/1‑137 (MQ=255) aCCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCtggtgg > 2:1372911/1‑153 (MQ=255) aCCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCg > 1:1216759/1‑174 (MQ=255) cGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCggg < 2:1134049/173‑1 (MQ=255) aTCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCg < 2:1353899/186‑1 (MQ=255) aTCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCg > 1:1353902/1‑186 (MQ=255) cGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTgg > 1:1053186/1‑236 (MQ=255) gAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCAc > 1:15101/1‑171 (MQ=255) gAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTgg > 1:526436/1‑235 (MQ=255) aGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCa < 1:1255193/78‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCCCCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCCac > 2:1135677/1‑197 (MQ=255) aGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTggg < 1:1415402/235‑1 (MQ=255) gcccgccTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATccgcgaccgcg < 2:173498/119‑1 (MQ=255) tCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCgcagca > 2:789116/1‑194 (MQ=255) ccAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGCCCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGtt > 2:300036/1‑126 (MQ=255) ccAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTGGGTGTGGCCGACTACCt < 1:866734/228‑1 (MQ=255) ttGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTggg < 2:32354/209‑1 (MQ=255) tGCAGGTGCAGACCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCg < 2:1446715/155‑1 (MQ=255) gCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTGGGTGTGGc < 1:505514/213‑1 (MQ=255) gCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTGGGTGTGGc > 2:505512/1‑213 (MQ=255) gaGGTGCAGCCCGCGCTGGACCGGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGGCCGGGCACCTGGTGc < 2:148944/147‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTGGGTGTGGCCGACTACCTGACCAAGGCGACg > 2:577606/1‑234 (MQ=255) tgaccGCGCTGGACCTGGGGGTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCCTGATCGGCGAGATccg > 2:818127/4‑85 (MQ=255) gcgcTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGCTTGCAAGAGCTGGGTGTGGCCGACTAc > 1:455356/1‑207 (MQ=255) tGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAAt < 1:1321166/169‑1 (MQ=255) tGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAAt > 2:1321163/1‑169 (MQ=255) | GGGCTTCGACCGCCTTGGCCTGCACGGCCAGCAACTGGCCCAATGGCAGCGCCTGCTTCGTCAGCGCCAAGGCATCATCCTGGTCACCGGCCCCACCGGCTCCGGCAAGACCAGCACGCTGTACACCAGCCTCAAACTGCTGGCCACACCACAGGTCAACCTGTGCACCATCGAAGACCCGATCGAGCGCCTGGAGCCAGCCTTCAACCAGTTGCAGGTGCAGCCCGCGCTGGACCTGGGGTTTGCCAACGCGGTCAGGGCCATGCTGCGCCAAGACCCCGACATCATCATGATCGGCGAAATCCGCGACCGCGAAACCGCTCTGGTGGCGGTGCAGGCAGCGCTGACCGGGCACCTGGTGCTATCGACCCTGCATACCAACGACGCCTGCGCAGCAATCACCCGTTTGCAAGAGCTGGGTGTGGCCGACTACCTGATCAAGGCGACG > AE015451/5920347‑5920794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |