New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | = 6041484 | 96 (1.120) | 4 (0.050) | 4/338 | NT | 4.0% | coding (440/723 nt) | rph | Ribonuclease PH |
? | AE015451 | = 6041615 | 103 (1.260) | coding (309/723 nt) | rph | Ribonuclease PH | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CGAGCATGGCGTTGAAATCTTCCGGCTGGAACGGTGCGCCTTCGGCAGTACCCTGCACTTCGATGAAACCACCAGCGCTGGTCATGACCACATTCAGGTCGGTTTCGGCTGCGGAGTCTTCCAGGTAGTCCAGGTCGAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCG > AE015451/6041263‑6041711 | cGAGCATGGCGTTGAAATCTTCCGGCTGGAACGGTGCGCCTTCGGCAGTACCCTGCACTTCGATGAAACCACCAGCGCTGGTCATGACCACATTCAGGTCGGTTTCGGCTGCGGAGTCTTCCAGGTAGTCCAGGTCGAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGAt > 2:1460431/1‑229 (MQ=255) cGAGCATGGCGTTGAAATCTTCCGGCTGGAACGGTGCGCCTTCGGCAGTACCCTGCACTTCGATGAAACCACCAGCGCTGGTCATGACCACATTCAGGTCGGTTTCGGCTGCGGAGTCTTCCAGGTAGTCCAGGTCGAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGc > 1:1056863/1‑235 (MQ=255) 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> 1:305201/1‑208 (MQ=255) ttCGATGAAACCACCAGCGCTGGTCATGACCACATTCAGGTCGGTTTCGGCTGCGGAGTCTTCCAGGTAGTCCAGGTCGAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCAt > 1:875132/1‑236 (MQ=255) gATGAAACCACCAGCGCTGGTCATGACCACATTCAGGTCGGTTTCGGCTGCGGAGTCTTCCAGGTAGTCCAGGTCGAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCgg > 1:120742/1‑236 (MQ=255) tGAAACCACCAGCGCTGGTCATGACCACATTCAGGTCGGTTTCGGCTGCGGAGTCTTCCAGGTAGTCCAGGTCGAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCg > 1:482686/1‑227 (MQ=255) 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acacGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCg > 1:1290834/1‑235 (MQ=255) acGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATg < 2:139986/162‑1 (MQ=255) gCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTcc > 1:620263/1‑180 (MQ=255) aGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGt > 1:151279/1‑225 (MQ=255) aGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCt > 1:49551/1‑236 (MQ=255) cGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGgc > 2:1155751/1‑207 (MQ=255) cGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCAccc > 2:637032/1‑233 (MQ=255) gATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTggacattagcaagctcggtgacatcaccctgtacgtcgattgcgacgtgatccaggccgatggcggtacccgtaccgcgtccatcaccggcgccatgg > 2:541638‑M1/1‑44 (MQ=255) aTCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCtt < 1:1038532/236‑1 (MQ=255) tCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATg < 1:235933/152‑1 (MQ=255) aTGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGTCCGCCGCGCTggacatgagcaagctcggtgacatcacccggtacgtcgattgcgacgtgatccaggccgatggc > 1:554562‑M1/1‑40 (MQ=255) tgtgCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCagc > 2:305199‑M2/1‑170 (MQ=255) tGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCa < 2:627589/207‑1 (MQ=255) agAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACggctg < 2:1406464/235‑1 (MQ=255) gCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATgg > 1:1383639/1‑69 (MQ=255) gCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATgg < 2:1383636/69‑1 (MQ=255) gCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACggctggct > 1:944028/1‑236 (MQ=255) gggTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGgcg > 1:61382/1‑191 (MQ=255) ggTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCCTCGGCTTGGATCACGTCGCAATCGAc < 2:676953/124‑1 (MQ=255) gTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGcttctt > 2:51919/1‑30 (MQ=255) ttGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGAt < 2:1489681/74‑1 (MQ=255) ttGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTc < 2:679622/233‑1 (MQ=255) cTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGtt < 2:815356/234‑1 (MQ=255) aGGCCGCCGCGCTTCTTGATCCCTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCagcgcggcggcctcaagggcggcaacccgatcaagcacatgctcgctgccgtgtc > 1:787514‑M2/1‑144 (MQ=255) gccgcGCTggacatgagcaagctcggtgacatcaccctgtacgtcgattgcgacgtgatccaggccgatggcggtacccgtaccgcgtccatcaccggcgccatggttgccttgtgcgacgctttggcagtgatcaagaagcgcggcggcctcaagggcggcaacccgctcaagcacatgatcgctgccgtgtcggtaggcatgtatcagggcgaagcggtgctcgacctggac < 1:65464‑M1/234‑227 (MQ=255) gccgcGCTggacatgagcaagctcggtgacatcaccctgtacgtcgattgcgacgtgatccaggccgatggcggtacccgtaccgcgtccatcaccggcgccatggttgccttgtgcgacgctttggcagtgatcaagaagcgcggcggcctcaagggcggcaacccgctcaagcacatgatcgctgccgtgtcggtaggcatgtatcagggcgaagcggtgctc < 2:1441409‑M1/225‑218 (MQ=255) cgcgCTggacatgagcaagctcggtgacatcaccctgtacgtcgattgcgacgtgatccaggccgat < 2:742834‑M1/67‑62 (MQ=255) gcgcTggacatgagcaagctcggtgacatcaccctgtacgtcgattgcgacgtgatccaggccgatggcggtacccgtaccgcgtccatcaccggcgccatggttgccttgtgcgacgctttggcagtgatcaagaagcgcggcggcctcaagggcggcaacccgctcaagcacatgatcgctgccgtgtcggtaggcatgtatcagggcgaagcgg < 1:1236930‑M1/217‑213 (MQ=255) cgcTggacatgagcaagctcggtgacatcaccctgtacgtcgattgcgacgtgatccaggccgatggcggtacccgtaccgcgtccatcaccggcgcaatggttgccttgtgcgacgctttggcagtgatcaagaagcgcggcggcctcaagggcggcaacccgctcaagcacatgatcgctgccgtgtcggta > 1:1127303‑M1/1‑4 (MQ=255) cgcTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCg < 2:969344/93‑1 (MQ=255) gcTggccatgagcaagctcggtgacatcaccctgtacgtcgattgcgacgtgatccaggccgatggcggtacccgtaccgcgtccatcaccggcgccatggttgccttg < 2:660942‑M1/109‑107 (MQ=255) gcTggacatgagcaagctcggtgacatcaccctgtacgtcgattgcgacgtgatccaggccgatggcggtacccgtaccgcgtccatcaccggcgccatggttgccttgtgcgacgctttggcagtgatcaagaagcgcggcggcctcaagggcggcaacccgctcaagcaca > 2:305199‑M1/1‑3 (MQ=255) | CGAGCATGGCGTTGAAATCTTCCGGCTGGAACGGTGCGCCTTCGGCAGTACCCTGCACTTCGATGAAACCACCAGCGCTGGTCATGACCACATTCAGGTCGGTTTCGGCTGCGGAGTCTTCCAGGTAGTCCAGGTCGAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCG > AE015451/6041263‑6041711 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |